139 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4754 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 416 aa  818    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  55.27 
 
 		 417 aa  386  1e-106  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3963  putative transcriptional regulator, PucR family  52.61 
 
 		 429 aa  358  8e-98  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2495  putative transcriptional regulator, PucR family  51.43 
 
 		 399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.591683  normal  0.122494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2864  putative transcriptional regulator, PucR family  45.87 
 
 		 425 aa  306  4.0000000000000004e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000667518  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  42.97 
 
 		 415 aa  279  8e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  38.26 
 
 		 411 aa  256  4e-67  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5328  putative transcriptional regulator, PucR family  40.1 
 
 		 479 aa  253  4.0000000000000004e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4185  transcriptional regulator, CdaR  41.25 
 
 		 392 aa  223  4e-57  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  38.68 
 
 		 447 aa  223  4.9999999999999996e-57  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  39.03 
 
 		 417 aa  192  1e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  36.95 
 
 		 464 aa  187  4e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  35.9 
 
 		 495 aa  172  6.999999999999999e-42  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  34.55 
 
 		 414 aa  164  3e-39  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  36.68 
 
 		 395 aa  163  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2075  hypothetical protein  34.9 
 
 		 414 aa  158  2e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.300029  normal  0.31372 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0230  putative transcriptional regulator, PucR family  36.86 
 
 		 420 aa  156  8e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 429 aa  150  3e-35  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4482  hypothetical protein  34.92 
 
 		 389 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.606872  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1543  transcriptional regulator, CdaR  33.6 
 
 		 416 aa  143  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.513722 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_22400  hypothetical protein  31.41 
 
 		 409 aa  140  4.999999999999999e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  34.1 
 
 		 412 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4487  transcriptional regulator, CdaR  31.66 
 
 		 458 aa  106  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.93269 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_23270  hypothetical protein  33.24 
 
 		 430 aa  99.8  8e-20  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  32.06 
 
 		 419 aa  98.2  3e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1093  transcriptional regulator, CdaR  46.76 
 
 		 428 aa  90.5  5e-17  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1394  transcriptional regulator, CdaR  29.02 
 
 		 393 aa  69.3  0.0000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.684667  hitchhiker  0.0014878 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  26.16 
 
 		 421 aa  68.6  0.0000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2867  transcriptional regulator, CdaR  38.58 
 
 		 407 aa  64.3  0.000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  48.61 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  48.61 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  48.61 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4527  hypothetical protein  52.54 
 
 		 525 aa  59.7  0.00000009  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.354978  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  24.17 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  27.25 
 
 		 408 aa  56.6  0.0000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1869  transcriptional regulator, PucR family  34.91 
 
 		 609 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  25.77 
 
 		 406 aa  55.5  0.000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  26.4 
 
 		 405 aa  55.5  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  29.49 
 
 		 558 aa  54.3  0.000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11210  hypothetical protein  31.85 
 
 		 538 aa  54.3  0.000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1896  transcriptional regulator, CdaR  34.01 
 
 		 434 aa  54.3  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.612834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2940  transcriptional regulator, CdaR  32.1 
 
 		 405 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.837438  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2802  Fis family transcriptional regulator  33.1 
 
 		 384 aa  53.1  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  31.82 
 
 		 552 aa  52.4  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.61 
 
 		 408 aa  52.8  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  45.59 
 
 		 419 aa  53.1  0.00001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2134  putative transcriptional regulator, PucR family  44.26 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1380  CdaR family transcriptional regulator  23.67 
 
 		 403 aa  52.4  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000902469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  48 
 
 		 528 aa  52.4  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6672  putative transcriptional regulator, PucR family  34.65 
 
 		 520 aa  52  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0255343  normal  0.214426 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14120  transcriptional regulator, CdaR family  42.11 
 
 		 397 aa  51.6  0.00002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.261126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  35.53 
 
 		 563 aa  51.6  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3595  putative transcriptional regulator, PucR family  41.33 
 
 		 529 aa  51.2  0.00003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.15656  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 420 aa  51.2  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2232  PucR family transcriptional regulator  35.23 
 
 		 537 aa  50.8  0.00004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.129404 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  31.21 
 
 		 410 aa  50.4  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2368  putative PucR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 425 aa  50.1  0.00007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00862332 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1083  putative transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 512 aa  50.1  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0589  hypothetical protein  25.75 
 
 		 408 aa  50.1  0.00008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4258  putative transcriptional regulator, PucR family  37.5 
 
 		 547 aa  49.7  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.484226  normal  0.267228 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  39.77 
 
 		 485 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5234  putative DNA-binding protein  34.42 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.198671  n/a   
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4866  CdaR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 466 aa  48.9  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5322  putative DNA-binding protein  34.42 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.266784 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5614  putative DNA-binding protein  34.42 
 
 		 515 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.3289 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.71 
 
 		 537 aa  48.9  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  29.89 
 
 		 400 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  30.39 
 
 		 558 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0076  transcriptional regulator, CdaR  32.79 
 
 		 611 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.105438  normal  0.388356 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3916  transcriptional regulator, CdaR  34.21 
 
 		 614 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.3459  normal  0.0290883 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3106  transcriptional regulator, PucR family  35.87 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.411475  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2307  putative transcriptional regulator, PucR family  29.07 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  26.55 
 
 		 414 aa  48.9  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3926  putative transcriptional regulator, PucR family  39.51 
 
 		 399 aa  48.9  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00603602 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3698  CdaR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 549 aa  48.1  0.0003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2723  putative transcriptional regulator, PucR family  41.1 
 
 		 429 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0536  CdaR family transcriptional regulator  33.65 
 
 		 659 aa  48.1  0.0003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.289228  hitchhiker  0.00416894 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  42.11 
 
 		 397 aa  48.1  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  37.84 
 
 		 514 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  34.95 
 
 		 501 aa  48.1  0.0003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  39.66 
 
 		 537 aa  47.8  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  27.47 
 
 		 404 aa  47.8  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0608  CdaR family transcriptional regulator  30.34 
 
 		 416 aa  47.4  0.0005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4779  putative DNA-binding protein  46.3 
 
 		 510 aa  47  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.821414 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  32.91 
 
 		 648 aa  47  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5661  CdaR family transcriptional regulator  37.08 
 
 		 494 aa  47  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0637  purine catabolism PurC domain-containing protein  34.21 
 
 		 486 aa  47  0.0006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  30.07 
 
 		 619 aa  47  0.0006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0431  putative PucR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 514 aa  47  0.0006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.517464  normal  0.914585 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  29.82 
 
 		 665 aa  47  0.0006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3866  transcriptional regulator, PucR family  32.63 
 
 		 557 aa  47  0.0006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2288  PucR family transcriptional regulator  40.98 
 
 		 597 aa  46.6  0.0007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0468789 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3449  transcriptional regulator, CdaR  33.04 
 
 		 398 aa  46.6  0.0007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00146797  hitchhiker  0.00488503 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1487  hypothetical protein  31.45 
 
 		 438 aa  46.6  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  32.46 
 
 		 459 aa  46.6  0.0008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3662  transcriptional regulator, PucR family  29.61 
 
 		 481 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0446387  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4508  putative transcriptional regulator, PucR family  42.86 
 
 		 498 aa  46.6  0.0008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2598  transcriptional regulator CdaR  44.44 
 
 		 511 aa  45.8  0.001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  30.22 
 
 		 312 aa  46.2  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7053  transcriptional regulator, CdaR  40.62 
 
 		 404 aa  46.2  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259086  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>