178 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1274 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1274  putative transcriptional regulator, PucR family  100 
 
 		 420 aa  808    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4680  putative transcriptional regulator, PucR family  45.06 
 
 		 405 aa  298  2e-79  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1467  putative PucR family transcriptional regulator  47.09 
 
 		 408 aa  291  2e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3032  putative transcriptional regulator, PucR family  45.95 
 
 		 399 aa  282  6.000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.173584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3161  putative transcriptional regulator, PucR family  43.11 
 
 		 414 aa  264  2e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0100012  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0761  putative transcriptional regulator, PucR family  42.71 
 
 		 400 aa  245  9e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23030  hypothetical protein  36.06 
 
 		 418 aa  159  9e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.131719 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7076  PucR family transcriptional regulator  36.14 
 
 		 421 aa  151  3e-35  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1477  transcriptional regulator, CdaR  33.8 
 
 		 422 aa  150  4e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0631045  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5004  putative transcriptional regulator, PucR family  35.45 
 
 		 404 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.351377  normal  0.990518 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6696  putative transcriptional regulator, PucR family  30.1 
 
 		 410 aa  110  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.944538  normal  0.225314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2011  putative transcriptional regulator, PucR family  33.44 
 
 		 408 aa  105  1e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2612  putative PucR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 462 aa  99  1e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.164197 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5870  putative transcriptional regulator, PucR family  34.57 
 
 		 402 aa  97.1  5e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.158333 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2769  putative transcriptional regulator, PucR family  31.51 
 
 		 389 aa  86.3  9e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.245793  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3970  putative transcriptional regulator, PucR family  28.19 
 
 		 406 aa  79.3  0.0000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  decreased coverage  0.00695384  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3284  putative transcriptional regulator, PucR family  39.52 
 
 		 447 aa  71.6  0.00000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.946669  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0207  transcriptional regulator  48.65 
 
 		 558 aa  66.6  0.0000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000326759  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2662  putative transcriptional regulator, PucR family  30.53 
 
 		 376 aa  65.5  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.384645  normal  0.292926 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1016  putative transcriptional regulator, PucR family  29.94 
 
 		 382 aa  63.9  0.000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.13413  normal  0.31968 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0193  CdaR family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1657  hypothetical protein  27.72 
 
 		 419 aa  62.8  0.00000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2569  putative transcriptional regulator, PucR family  38.89 
 
 		 501 aa  62.4  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0873115  normal  0.990739 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2216  transcriptional regulator, PucR family  27.27 
 
 		 542 aa  60.1  0.00000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3797  hypothetical protein  31.38 
 
 		 495 aa  60.1  0.00000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00410976  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4842  putative phytochrome sensor protein  46.15 
 
 		 645 aa  60.1  0.00000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10050  transcriptional regulator, CdaR family  40.23 
 
 		 619 aa  59.7  0.00000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.626795  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1318  transcriptional regulator, PucR family  25.15 
 
 		 537 aa  59.7  0.00000009  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000441454  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1241  PucR family transcriptional regulator  44.59 
 
 		 552 aa  59.7  0.0000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.0259232 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09280  Fis family regulatory protein  34.69 
 
 		 411 aa  59.3  0.0000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.739433  normal  0.888606 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2278  putative transcriptional regulator, PucR family  33.9 
 
 		 739 aa  58.2  0.0000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1808  putative transcriptional regulator, PucR family  33.79 
 
 		 397 aa  57.4  0.0000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.583872  normal  0.0100346 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2223  transcriptional regulator, CdaR  37.6 
 
 		 520 aa  57  0.0000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.14509  hitchhiker  0.000308823 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1388  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 493 aa  57  0.0000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8813  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 417 aa  57  0.0000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.652147  normal  0.896825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1626  transcriptional regulator, CdaR  33.68 
 
 		 413 aa  56.6  0.0000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1796  transcriptional regulator, CdaR  42.31 
 
 		 644 aa  56.6  0.0000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.220013  hitchhiker  0.00020327 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10300  regulator of polyketide synthase expression  36.24 
 
 		 413 aa  56.2  0.0000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.10355 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2149  transcriptional regulator, CdaR  35.71 
 
 		 408 aa  56.2  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5712  putative transcriptional regulator, PucR family  32.21 
 
 		 537 aa  55.8  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.857659  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1333  transcriptional regulator, PucR family  38.64 
 
 		 558 aa  56.2  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1328  putative transcriptional regulator, PucR family  36.73 
 
 		 393 aa  55.8  0.000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2535  transcriptional regulator, PucR family  39.77 
 
 		 505 aa  55.8  0.000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.295371 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12271  hypothetical protein  41.18 
 
 		 414 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000339947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0930  PucR family transcriptional regulator  31.19 
 
 		 464 aa  55.1  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.465733  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3370  putative transcriptional regulator, PucR family  48.39 
 
 		 460 aa  54.7  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00329007  normal  0.365111 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2630  transcriptional regulator, PucR family  43.24 
 
 		 528 aa  53.9  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0196857  normal  0.48093 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3793  putative transcriptional regulator, PucR family  35.56 
 
 		 415 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.254116  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3335  PucR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 517 aa  53.9  0.000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_5059  putative transcriptional regulator, PucR family  41.25 
 
 		 395 aa  53.5  0.000007  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4754  putative transcriptional regulator, PucR family  34 
 
 		 416 aa  53.5  0.000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2411  putative transcriptional regulator, PucR family  35.78 
 
 		 417 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00000974619  hitchhiker  0.000254155 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5765  transcriptional regulator, CdaR  41.76 
 
 		 553 aa  52.8  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.808305  normal  0.0531949 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2339  putative transcriptional regulator, PucR family  32.65 
 
 		 705 aa  52.4  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00013602  hitchhiker  0.000729233 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1802  transcriptional regulator, CdaR  27.14 
 
 		 364 aa  52.4  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000701672  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1876  putative transcriptional regulator, PucR family  41.05 
 
 		 487 aa  52.4  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2139  putative transcriptional regulator, PucR family  33.09 
 
 		 514 aa  51.6  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.351371 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0042  purine catabolism PurC domain-containing protein  37.5 
 
 		 459 aa  51.2  0.00003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.250157 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0495  CdaR family transcriptional regulator  38.96 
 
 		 645 aa  51.6  0.00003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4831  CdaR family transcriptional regulator  31.11 
 
 		 305 aa  50.8  0.00004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.558318 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8514  putative transcriptional regulator, PucR family  38.04 
 
 		 637 aa  50.8  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484421  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5251  PucR family transcriptional regulator  42.17 
 
 		 312 aa  51.2  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.60944  normal  0.261771 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2205  putative transcriptional regulator, PucR family  38.1 
 
 		 505 aa  50.4  0.00005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0290612  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4740  transcriptional regulator, CdaR  37.04 
 
 		 515 aa  50.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23280  hypothetical protein  34.04 
 
 		 512 aa  50.4  0.00005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.122242  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3120  Regulator of polyketide synthase expression- like protein  42.86 
 
 		 418 aa  50.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.550646  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3753  hypothetical protein  35.96 
 
 		 428 aa  50.1  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.144369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2218  PucR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 414 aa  50.1  0.00007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.025406  normal  0.163117 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1957  putative transcriptional regulator, PucR family  41.18 
 
 		 485 aa  49.7  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.665292  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0936  hypothetical protein  37.36 
 
 		 412 aa  49.7  0.00009  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.865506 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4027  hypothetical protein  45.31 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4102  hypothetical protein  45.31 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.471493  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4257  hypothetical protein  45.31 
 
 		 554 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0586368 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0801  transcriptional regulator, CdaR  35.94 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.140313  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3341  transcriptional regulator, CdaR  37.5 
 
 		 442 aa  49.3  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  hitchhiker  0.00355427  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3770  transcriptional regulator, CdaR  27.95 
 
 		 404 aa  49.3  0.0001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12040  transcriptional regulator, CdaR family  33.54 
 
 		 393 aa  49.3  0.0001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0292097  normal  0.187885 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0080  GAF domain-containing protein  36.11 
 
 		 648 aa  48.9  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.920818  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1640  DNA-binding protein  32.82 
 
 		 410 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0331425  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39770  putative regulatory protein  35.9 
 
 		 515 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4823  CdaR family transcriptional regulator  28.88 
 
 		 563 aa  48.9  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1003  PucR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 516 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.481265  normal  0.280145 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4896  transcriptional regulator, CdaR  42.31 
 
 		 616 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5330  putative phytochrome sensor protein  38.16 
 
 		 627 aa  48.9  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1489  transcriptional regulator, PucR family  41.67 
 
 		 504 aa  48.5  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0802599 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1023  putative transcriptional regulator, PucR family  23.78 
 
 		 518 aa  48.9  0.0002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0774134  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3185  transcriptional regulator, CdaR  30.85 
 
 		 518 aa  48.5  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.731568 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2063  transcriptional regulator, PucR family  45.76 
 
 		 561 aa  48.5  0.0002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.20553  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2334  DNA-binding protein  32.82 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2101  CdaR family transcriptional regulator  35.56 
 
 		 393 aa  48.1  0.0003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1119  putative purine catabolism transcriptional regulator  32.82 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1033  putative purine catabolism transcriptional regulator  32.82 
 
 		 410 aa  48.1  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1806  GAF domain-containing protein  37.31 
 
 		 639 aa  47.8  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1182  transcriptional regulator, CdaR  35.48 
 
 		 555 aa  47.8  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000261051  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2800  transcriptional regulator, PucR family  39.74 
 
 		 478 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0125039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0907  transcriptional regulator, PucR family  30.77 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0046  transcriptional regulator, CdaR  38.89 
 
 		 665 aa  48.1  0.0003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.541147  normal  0.0349089 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2967  transcriptional regulator, PucR family  38.36 
 
 		 486 aa  48.1  0.0003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2346  regulator of polyketide synthase expression-like protein  54.55 
 
 		 681 aa  47.8  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00520289  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1514  putative transcriptional regulator, PucR family  35.51 
 
 		 419 aa  47.8  0.0004  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.0197746 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>