132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_13012 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_1909  hypothetical protein  69.41 
 
 		 491 aa  665    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.210936  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1955  hypothetical protein  69.41 
 
 		 491 aa  665    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.689507  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2127  hypothetical protein  70.46 
 
 		 482 aa  679    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.255916  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1889  hypothetical protein  69.41 
 
 		 476 aa  665    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.247314  normal  0.163069 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4235  hypothetical protein  69.41 
 
 		 482 aa  667    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0811417  normal  0.282669 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13012  hypothetical protein  100 
 
 		 480 aa  955    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0101829  normal  0.587267 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0818  dehydrogenase  56.15 
 
 		 496 aa  503  1e-141  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.486977 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2057  FAD dependent oxidoreductase  52.58 
 
 		 487 aa  465  9.999999999999999e-131  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.548507  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_31610  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  52.34 
 
 		 503 aa  464  1e-129  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.911892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17640  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  53.7 
 
 		 499 aa  458  9.999999999999999e-129  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.760158  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0214  FAD dependent oxidoreductase  53.96 
 
 		 491 aa  442  1e-123  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.942451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4153  putative dehydrogenase  47.83 
 
 		 479 aa  408  1.0000000000000001e-112  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3794  FAD dependent oxidoreductase  51.05 
 
 		 484 aa  392  1e-108  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.116635  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3920  putative dehydrogenase  47.93 
 
 		 482 aa  378  1e-103  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11461  dehydrogenase  42.24 
 
 		 473 aa  342  9e-93  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.717734 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2958  FAD dependent oxidoreductase  41.45 
 
 		 474 aa  333  5e-90  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2084  FAD dependent oxidoreductase  39.66 
 
 		 477 aa  332  9e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.424143 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2736  FAD dependent oxidoreductase  40.47 
 
 		 484 aa  331  2e-89  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.118695  hitchhiker  0.0000199916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3180  FAD dependent oxidoreductase  39.41 
 
 		 478 aa  329  6e-89  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.882146 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1268  FAD dependent oxidoreductase  41.83 
 
 		 474 aa  329  7e-89  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4109  FAD dependent oxidoreductase  43.04 
 
 		 491 aa  326  6e-88  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0668634  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2416  FAD dependent oxidoreductase  43.1 
 
 		 487 aa  326  7e-88  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.28605  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4519  FAD dependent oxidoreductase  40.72 
 
 		 506 aa  323  5e-87  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.962314  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0562  phytoene dehydrogenase  38.97 
 
 		 476 aa  321  9.999999999999999e-87  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.57864 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3246  FAD dependent oxidoreductase  42.51 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.396208 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0335  FAD dependent oxidoreductase  36.23 
 
 		 476 aa  316  6e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000674369  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3691  FAD dependent oxidoreductase  44.42 
 
 		 481 aa  313  5.999999999999999e-84  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0128787  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1398  FAD dependent oxidoreductase  43.5 
 
 		 469 aa  312  6.999999999999999e-84  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.389386  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2860  FAD dependent oxidoreductase  38.49 
 
 		 468 aa  311  1e-83  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03260  putative dehydrogenase  35.58 
 
 		 476 aa  311  1e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  40.69 
 
 		 470 aa  309  5.9999999999999995e-83  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0268  FAD dependent oxidoreductase  41.94 
 
 		 466 aa  308  2.0000000000000002e-82  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1238  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  39.61 
 
 		 472 aa  304  3.0000000000000004e-81  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.690842  normal  1 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_15580  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  43.59 
 
 		 469 aa  295  1e-78  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0617882  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_26280  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  42.61 
 
 		 477 aa  293  4e-78  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0239  FAD dependent oxidoreductase  45.22 
 
 		 505 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.771217 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1663  phytoene dehydrogenase, putative  37.9 
 
 		 465 aa  284  2.0000000000000002e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.638198  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0214  FAD dependent oxidoreductase  54.27 
 
 		 568 aa  283  4.0000000000000003e-75  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.646521  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0553  FAD dependent oxidoreductase  38.14 
 
 		 472 aa  278  2e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14190  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  40.35 
 
 		 511 aa  268  2e-70  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  hitchhiker  0.00208581  normal  0.0106814 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0229  FAD dependent oxidoreductase  43.8 
 
 		 474 aa  253  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0240  FAD dependent oxidoreductase  44.23 
 
 		 474 aa  248  2e-64  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.236814  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0251  FAD dependent oxidoreductase  44.89 
 
 		 474 aa  241  2e-62  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.307099  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  36.81 
 
 		 524 aa  230  5e-59  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0805  dehydrogenase  37.37 
 
 		 437 aa  219  1e-55  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  32.5 
 
 		 530 aa  191  2e-47  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 560 aa  191  2.9999999999999997e-47  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  33.72 
 
 		 531 aa  189  8e-47  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 530 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  32.46 
 
 		 530 aa  189  9e-47  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4289  FAD dependent oxidoreductase  32.86 
 
 		 528 aa  179  1e-43  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.366851  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.14 
 
 		 545 aa  167  4e-40  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  30.16 
 
 		 526 aa  160  4e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  32.06 
 
 		 534 aa  159  1e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 		 534 aa  155  2e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0965  FAD dependent oxidoreductase  30.83 
 
 		 528 aa  135  1.9999999999999998e-30  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.19081  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1761  amine oxidase  29.85 
 
 		 530 aa  130  6e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0378062  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4056  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 580 aa  129  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 522 aa  112  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  25.48 
 
 		 554 aa  97.1  6e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  26.32 
 
 		 528 aa  95.5  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 533 aa  95.1  3e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  25.23 
 
 		 555 aa  94.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  25.81 
 
 		 535 aa  93.2  1e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  24.23 
 
 		 554 aa  90.9  5e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  22.77 
 
 		 563 aa  90.9  5e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  22.78 
 
 		 547 aa  89  2e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 		 547 aa  86.7  9e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  21.88 
 
 		 565 aa  86.3  0.000000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  24.42 
 
 		 524 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  21.78 
 
 		 564 aa  85.9  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  24.95 
 
 		 556 aa  84.3  0.000000000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  32.21 
 
 		 532 aa  84.3  0.000000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  26.11 
 
 		 531 aa  84  0.000000000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  24.62 
 
 		 559 aa  84  0.000000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  31.84 
 
 		 532 aa  81.6  0.00000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  25.88 
 
 		 510 aa  80.1  0.00000000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  25.8 
 
 		 523 aa  80.1  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  25.57 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  24.64 
 
 		 531 aa  79  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  25.69 
 
 		 510 aa  78.6  0.0000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  24.25 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  22.52 
 
 		 556 aa  76.6  0.000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 536 aa  74.3  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.81 
 
 		 545 aa  73.9  0.000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 		 514 aa  73.9  0.000000000006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  22.95 
 
 		 561 aa  73.6  0.000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  27.03 
 
 		 545 aa  73.2  0.00000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  24.3 
 
 		 539 aa  68.9  0.0000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  26.03 
 
 		 549 aa  68.2  0.0000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  25.1 
 
 		 523 aa  67  0.0000000006  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  24.58 
 
 		 547 aa  67  0.0000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 		 505 aa  66.2  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  24.95 
 
 		 510 aa  65.9  0.000000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  24.29 
 
 		 537 aa  65.1  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  26.25 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  27.12 
 
 		 551 aa  62.8  0.00000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  25.64 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 536 aa  60.8  0.00000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  25.14 
 
 		 533 aa  60.8  0.00000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>