More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_6433 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  41.33 
 
 		 979 aa  661    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1013 aa  2046    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  41.59 
 
 		 993 aa  681    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  39.84 
 
 		 1087 aa  671    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  39.55 
 
 		 1017 aa  634  1e-180  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  38.85 
 
 		 1034 aa  618  1e-175  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  38.91 
 
 		 1102 aa  619  1e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  37.53 
 
 		 1106 aa  614  9.999999999999999e-175  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  36.98 
 
 		 1006 aa  605  1.0000000000000001e-171  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  38.46 
 
 		 1161 aa  599  1e-170  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  37.28 
 
 		 1096 aa  585  1.0000000000000001e-165  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  35.93 
 
 		 1077 aa  577  1.0000000000000001e-163  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  36.77 
 
 		 1144 aa  575  1.0000000000000001e-162  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  36.54 
 
 		 1147 aa  570  1e-161  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  38.7 
 
 		 996 aa  568  1e-160  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  36.83 
 
 		 1177 aa  559  1e-157  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 		 1029 aa  552  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  37.93 
 
 		 1117 aa  551  1e-155  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  36.55 
 
 		 1114 aa  547  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  35.36 
 
 		 1037 aa  546  1e-154  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  34.55 
 
 		 1168 aa  542  9.999999999999999e-153  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  36.91 
 
 		 986 aa  540  9.999999999999999e-153  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  34.5 
 
 		 1037 aa  536  1e-151  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4106  TonB-dependent receptor plug  35.12 
 
 		 1048 aa  534  1e-150  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  37.11 
 
 		 1006 aa  534  1e-150  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  36.3 
 
 		 1000 aa  530  1e-149  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2267  TonB-dependent receptor plug  34.79 
 
 		 1146 aa  531  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  35.62 
 
 		 1155 aa  530  1e-149  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  36 
 
 		 1042 aa  530  1e-149  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  37.24 
 
 		 1019 aa  529  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  36.05 
 
 		 1128 aa  526  1e-148  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  34.52 
 
 		 1008 aa  525  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  35.38 
 
 		 1042 aa  523  1e-147  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  35.41 
 
 		 1155 aa  523  1e-147  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  34.67 
 
 		 1181 aa  520  1e-146  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 1050 aa  513  1e-144  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  34.2 
 
 		 1038 aa  510  1e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  35.89 
 
 		 1148 aa  511  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1105 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  35.79 
 
 		 1066 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  36.33 
 
 		 1008 aa  510  1e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  35.63 
 
 		 1038 aa  508  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 1027 aa  506  1e-141  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  35.83 
 
 		 1079 aa  503  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  33.36 
 
 		 1132 aa  500  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  34.87 
 
 		 1116 aa  501  1e-140  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5674  TonB-dependent receptor plug  32.63 
 
 		 1038 aa  498  1e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.167608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  34.6 
 
 		 1041 aa  495  9.999999999999999e-139  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  34.95 
 
 		 1071 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  33.62 
 
 		 1030 aa  490  1e-137  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1012  TonB-dependent receptor  33.6 
 
 		 994 aa  491  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.467602 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  35.01 
 
 		 1050 aa  492  1e-137  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4042  TonB-dependent receptor  34.93 
 
 		 1026 aa  490  1e-137  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3950  TonB-dependent receptor  33.83 
 
 		 996 aa  489  1e-136  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.265866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  34.73 
 
 		 1124 aa  488  1e-136  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  34.04 
 
 		 1051 aa  483  1e-135  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  33.85 
 
 		 1152 aa  486  1e-135  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  33.82 
 
 		 1051 aa  479  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  33.67 
 
 		 1023 aa  480  1e-134  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  34.3 
 
 		 1028 aa  483  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1163 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  33.67 
 
 		 1076 aa  482  1e-134  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5315  TonB-dependent receptor plug  34.4 
 
 		 1039 aa  478  1e-133  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0672223  normal  0.942477 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  34.53 
 
 		 982 aa  478  1e-133  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  33.86 
 
 		 989 aa  474  1e-132  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1023 aa  475  1e-132  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  34.26 
 
 		 1097 aa  474  1e-132  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  33.23 
 
 		 986 aa  468  9.999999999999999e-131  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  33.53 
 
 		 1076 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  33.5 
 
 		 1012 aa  468  9.999999999999999e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5655  TonB-dependent receptor plug  35.2 
 
 		 1164 aa  469  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.268168  normal  0.858728 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  33.27 
 
 		 1034 aa  464  1e-129  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1911  TonB-dependent receptor plug  33.05 
 
 		 1064 aa  463  1e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.420637 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  33.24 
 
 		 1173 aa  464  1e-129  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.37 
 
 		 1062 aa  465  1e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  33.92 
 
 		 1025 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1220  TonB-dependent receptor plug  34.43 
 
 		 1137 aa  462  9.999999999999999e-129  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  32.52 
 
 		 1071 aa  460  9.999999999999999e-129  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1033 aa  460  9.999999999999999e-129  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1129 aa  458  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  33.62 
 
 		 1039 aa  459  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6529  TonB-dependent receptor plug  33.09 
 
 		 1075 aa  458  1e-127  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  33.11 
 
 		 1154 aa  457  1e-127  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  33.93 
 
 		 1076 aa  458  1e-127  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4824  TonB-dependent receptor plug  32.87 
 
 		 1113 aa  453  1.0000000000000001e-126  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00024385  hitchhiker  0.00000000773033 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1657  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1122 aa  454  1.0000000000000001e-126  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.653698 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  33.18 
 
 		 1127 aa  450  1e-125  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  31.5 
 
 		 1063 aa  447  1.0000000000000001e-124  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1081 aa  447  1.0000000000000001e-124  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2991  TonB-dependent receptor plug  32.76 
 
 		 1082 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.40723  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  32.5 
 
 		 1071 aa  449  1.0000000000000001e-124  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  32.46 
 
 		 1010 aa  446  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  32.77 
 
 		 1034 aa  444  1e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  33.88 
 
 		 1150 aa  446  1e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  33.17 
 
 		 1023 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  33.2 
 
 		 1010 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  32.89 
 
 		 1049 aa  440  9.999999999999999e-123  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  31.72 
 
 		 1021 aa  440  9.999999999999999e-123  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11498  putative outer membrane protein  32.75 
 
 		 1018 aa  442  9.999999999999999e-123  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  32.92 
 
 		 1006 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>