94 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5445 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5653  FG-GAP repeat protein  44.25 
 
 		 1208 aa  956    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  40.91 
 
 		 1127 aa  793    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  51.01 
 
 		 1183 aa  1200    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4979  secreted protein containing FG-GAP repeats  37.09 
 
 		 1098 aa  639    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.55758 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  38.55 
 
 		 1109 aa  707    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  39.53 
 
 		 1098 aa  736    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1760  ASPIC/UnbV domain protein  40.21 
 
 		 1120 aa  754    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2472  ASPIC/UnbV domain protein  39.42 
 
 		 1172 aa  739    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0642293  normal  0.355386 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  39.89 
 
 		 1088 aa  740    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3034  ASPIC/UnbV domain protein  37.31 
 
 		 1129 aa  687    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.721984 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5445  FG-GAP repeat protein  100 
 
 		 1203 aa  2468    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  36.57 
 
 		 1126 aa  637    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5057  ASPIC/UnbV domain protein  37.97 
 
 		 1166 aa  723    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.279918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5060  ASPIC/UnbV domain protein  36.98 
 
 		 1161 aa  691    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  40.62 
 
 		 1113 aa  742    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1797  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.25 
 
 		 1246 aa  559  1e-158  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.164789 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3076  ASPIC/UnbV domain protein  34.91 
 
 		 1107 aa  555  1e-156  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1795  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.03 
 
 		 1228 aa  551  1e-155  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.482089  normal  0.316892 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2319  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.88 
 
 		 1192 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.236252  normal  0.0252838 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2953  ASPIC/UnbV domain-containing protein  34.99 
 
 		 1170 aa  534  1e-150  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0362405  normal  0.571112 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0597  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.49 
 
 		 1208 aa  527  1e-148  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.31 
 
 		 1236 aa  522  1e-146  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  32.79 
 
 		 1226 aa  514  1e-144  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.6 
 
 		 1114 aa  511  1e-143  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.79 
 
 		 1193 aa  497  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.03 
 
 		 1225 aa  457  1e-127  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33 
 
 		 1189 aa  449  1.0000000000000001e-124  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2942  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.79 
 
 		 546 aa  159  4e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  27.41 
 
 		 583 aa  136  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1678  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.1 
 
 		 1066 aa  131  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2997  hypothetical protein  25.96 
 
 		 585 aa  120  9.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0217455  hitchhiker  0.0000181877 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1684  ASPIC/UnbV  26.94 
 
 		 573 aa  119  5e-25  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.478922 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2932  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.74 
 
 		 574 aa  113  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0476681  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2951  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.6 
 
 		 596 aa  112  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0418906  normal  0.405756 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1617  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.04 
 
 		 600 aa  111  1e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  25.87 
 
 		 593 aa  108  5e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2893  FG-GAP repeat-containing protein  26.79 
 
 		 566 aa  108  6e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  25.34 
 
 		 737 aa  107  1e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  26.09 
 
 		 649 aa  100  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2275  FG-GAP repeat-containing protein  29.04 
 
 		 604 aa  100  1e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.645045 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1747  ASPIC/UnbV domain protein  26.3 
 
 		 554 aa  100  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.302243  normal  0.511021 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  36.61 
 
 		 577 aa  98.2  7e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0909  ASPIC/UnbV  32.33 
 
 		 593 aa  98.2  8e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.442824  normal  0.0377132 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1623  ASPIC/UnbV domain-containing protein  33.43 
 
 		 551 aa  97.4  1e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  24.18 
 
 		 604 aa  97.1  2e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  25.85 
 
 		 556 aa  96.7  3e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4767  FG-GAP repeat protein  23.44 
 
 		 951 aa  95.5  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.47375  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.23 
 
 		 574 aa  90.1  2e-16  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  27.47 
 
 		 569 aa  85.9  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3172  ASPIC/UnbV  24.43 
 
 		 521 aa  84.7  0.00000000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.72438 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1882  ASPIC/UnbV domain-containing protein  27.1 
 
 		 573 aa  78.2  0.0000000000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0826925 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0931  hypothetical protein  29.35 
 
 		 499 aa  77.8  0.000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.246665  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  31.06 
 
 		 803 aa  77.8  0.000000000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0695  ASPIC/UnbV domain protein  23.19 
 
 		 668 aa  76.3  0.000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0868  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.02 
 
 		 638 aa  72  0.00000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2177  ASPIC/UnbV domain-containing protein  22.64 
 
 		 657 aa  68.2  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.191315  normal  0.0143459 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  28.85 
 
 		 1127 aa  67.8  0.000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  24.25 
 
 		 562 aa  67.4  0.000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2769  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.82 
 
 		 1040 aa  65.9  0.000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.791466  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7001  hypothetical protein  22.06 
 
 		 658 aa  65.9  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.537258  hitchhiker  0.00183275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0870  ASPIC/UnbV domain-containing protein  20.22 
 
 		 645 aa  65.5  0.000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  27.04 
 
 		 655 aa  63.5  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2897  hypothetical protein  28.95 
 
 		 1575 aa  62  0.00000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0255386  normal  0.161029 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1475  FG-GAP  23.14 
 
 		 645 aa  60.8  0.0000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4117  ASPIC/UnbV domain protein  22.25 
 
 		 655 aa  60.1  0.0000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2356  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.5 
 
 		 455 aa  60.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.57211  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1750  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.5 
 
 		 526 aa  59.3  0.0000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.678312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1255  hypothetical protein  25.06 
 
 		 566 aa  58.9  0.0000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.450308  normal  0.0913658 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0847  ASPIC/UnbV domain protein  32 
 
 		 482 aa  58.9  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3123  ASPIC/UnbV domain-containing protein  25.6 
 
 		 453 aa  58.5  0.0000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4587  ASPIC/UnbV domain protein  30.82 
 
 		 878 aa  57.8  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  24.13 
 
 		 447 aa  57.8  0.000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  28.72 
 
 		 438 aa  57.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8247  hypothetical protein  23.72 
 
 		 730 aa  56.6  0.000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0258368 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  28.24 
 
 		 590 aa  55.8  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  25.64 
 
 		 1557 aa  55.8  0.000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0118  hypothetical protein  25.66 
 
 		 691 aa  55.1  0.000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2331  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.63 
 
 		 585 aa  53.5  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0092125 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4112  ASPIC/UnbV domain protein  21 
 
 		 667 aa  53.9  0.00002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  29.29 
 
 		 616 aa  51.6  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1753  FG-GAP repeat-containing protein  24.52 
 
 		 768 aa  50.1  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000543044  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  22.75 
 
 		 1124 aa  50.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0738  VCBS  27.48 
 
 		 8871 aa  50.1  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  27.08 
 
 		 2807 aa  49.7  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0555  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.54 
 
 		 677 aa  48.9  0.0005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0158412 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0746  Integrins alpha chain  25.42 
 
 		 681 aa  48.1  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  30.08 
 
 		 2000 aa  47.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  29.06 
 
 		 472 aa  47.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0890  hypothetical protein  27.27 
 
 		 646 aa  47.4  0.002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2699  ASPIC/UnbV domain-containing protein  21.71 
 
 		 655 aa  47  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.163426  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  40 
 
 		 1838 aa  46.2  0.003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  25.18 
 
 		 1126 aa  46.6  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0911  hypothetical protein  27.49 
 
 		 664 aa  46.2  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1428  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.73 
 
 		 1138 aa  45.1  0.008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.230338  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>