More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_2515 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 518 aa  1072    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  51.06 
 
 		 534 aa  507  9.999999999999999e-143  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.42 
 
 		 520 aa  479  1e-134  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.71 
 
 		 547 aa  466  9.999999999999999e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1572  dehydrogenase subunit-like protein  46.67 
 
 		 528 aa  434  1e-120  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.849895  normal  0.707104 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.11 
 
 		 516 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.44 
 
 		 524 aa  422  1e-117  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.4 
 
 		 526 aa  422  1e-117  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.28 
 
 		 506 aa  419  1e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.47 
 
 		 534 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.47 
 
 		 534 aa  418  9.999999999999999e-116  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.33 
 
 		 524 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.06 
 
 		 534 aa  415  1e-114  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  46.3 
 
 		 521 aa  409  1e-113  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  46.52 
 
 		 502 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  46.52 
 
 		 510 aa  396  1e-109  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.14 
 
 		 534 aa  380  1e-104  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0275  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.04 
 
 		 506 aa  365  1e-100  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0236777 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.2 
 
 		 512 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.38 
 
 		 512 aa  362  1e-98  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.69 
 
 		 501 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  42.07 
 
 		 489 aa  343  4e-93  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.34 
 
 		 494 aa  340  2.9999999999999998e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  39.8 
 
 		 506 aa  339  5e-92  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  40.24 
 
 		 494 aa  334  3e-90  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  34.87 
 
 		 522 aa  301  2e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  36.54 
 
 		 502 aa  284  3.0000000000000004e-75  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.89 
 
 		 504 aa  204  3e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.86 
 
 		 511 aa  201  1.9999999999999998e-50  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0493  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.36 
 
 		 532 aa  199  7.999999999999999e-50  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.86 
 
 		 545 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.35 
 
 		 561 aa  176  6e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  26.6 
 
 		 573 aa  174  3.9999999999999995e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.93 
 
 		 550 aa  171  4e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.21 
 
 		 563 aa  169  8e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.91 
 
 		 527 aa  162  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 		 553 aa  159  8e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 		 572 aa  159  9e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4263  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.82 
 
 		 544 aa  155  2e-36  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.157361  normal  0.86886 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.14 
 
 		 560 aa  154  5e-36  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  28.7 
 
 		 558 aa  152  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.91 
 
 		 531 aa  150  4e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  28.06 
 
 		 551 aa  150  4e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.24 
 
 		 522 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.24 
 
 		 522 aa  150  6e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.95 
 
 		 563 aa  149  1.0000000000000001e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 		 522 aa  149  1.0000000000000001e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 		 566 aa  148  2.0000000000000003e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.5 
 
 		 545 aa  146  8.000000000000001e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.17 
 
 		 533 aa  145  2e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1801  GMC oxidoreductase family protein  25.49 
 
 		 549 aa  145  3e-33  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000289048  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  29.11 
 
 		 549 aa  144  4e-33  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.1 
 
 		 556 aa  143  6e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.15 
 
 		 556 aa  143  6e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.73 
 
 		 562 aa  141  1.9999999999999998e-32  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.7 
 
 		 572 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.45 
 
 		 528 aa  141  3e-32  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7345  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.8 
 
 		 550 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.421505  normal  0.897172 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.64 
 
 		 527 aa  139  1e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.24 
 
 		 522 aa  139  1e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  24.87 
 
 		 561 aa  137  3.0000000000000003e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.67 
 
 		 563 aa  137  5e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  28.9 
 
 		 547 aa  136  7.000000000000001e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.88 
 
 		 526 aa  136  9e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 561 aa  135  9.999999999999999e-31  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.58 
 
 		 545 aa  135  1.9999999999999998e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.5 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.82 
 
 		 547 aa  134  3e-30  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.5 
 
 		 563 aa  135  3e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 		 538 aa  134  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  27.5 
 
 		 563 aa  134  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.48 
 
 		 755 aa  133  9e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 		 533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.68 
 
 		 518 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.21 
 
 		 528 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.15 
 
 		 548 aa  131  3e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 		 573 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 		 559 aa  131  3e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 		 552 aa  131  4.0000000000000003e-29  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.1 
 
 		 528 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 		 581 aa  130  6e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.53 
 
 		 566 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.3 
 
 		 574 aa  129  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  29.54 
 
 		 483 aa  128  3e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.57 
 
 		 570 aa  127  4.0000000000000003e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.61 
 
 		 561 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.44 
 
 		 548 aa  127  5e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0230  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.88 
 
 		 579 aa  127  5e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.118413  normal  0.242955 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  29.21 
 
 		 480 aa  127  6e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 		 523 aa  126  1e-27  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.26 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 		 582 aa  125  3e-27  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 		 533 aa  124  3e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.64 
 
 		 553 aa  124  4e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.58 
 
 		 573 aa  124  4e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  25.68 
 
 		 522 aa  124  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.6 
 
 		 579 aa  124  5e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 		 525 aa  124  6e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3248  hypothetical protein  29.07 
 
 		 480 aa  123  9e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.713925  normal  0.212703 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>