297 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0242 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  100 
 
 
1987 aa  3982    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  36.49 
 
 
1842 aa  195  9e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  35.05 
 
 
1862 aa  194  2e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  36.87 
 
 
752 aa  193  2.9999999999999997e-47  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  35.68 
 
 
2036 aa  191  1e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  33.4 
 
 
963 aa  190  2e-46  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  36.57 
 
 
1882 aa  189  3e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  34.69 
 
 
1682 aa  189  4e-46  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.13 
 
 
1094 aa  187  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.52 
 
 
2272 aa  188  1.0000000000000001e-45  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.94 
 
 
2122 aa  181  1e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  35.84 
 
 
735 aa  180  2e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  32.7 
 
 
978 aa  179  6e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  34.4 
 
 
575 aa  178  9.999999999999999e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  34.25 
 
 
2000 aa  177  2.9999999999999996e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3622  conserved repeat domain protein  33.96 
 
 
4978 aa  176  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000013093 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  35.36 
 
 
1667 aa  176  3.9999999999999995e-42  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  30.22 
 
 
941 aa  173  2e-41  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  37.03 
 
 
1300 aa  164  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  31.42 
 
 
561 aa  164  2e-38  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  36.11 
 
 
528 aa  160  2e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  37.47 
 
 
1667 aa  161  2e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  34.51 
 
 
1361 aa  159  4e-37  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.91 
 
 
2554 aa  159  5.0000000000000005e-37  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  33.2 
 
 
1282 aa  159  7e-37  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  31.95 
 
 
1230 aa  158  9e-37  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  34.8 
 
 
1356 aa  155  7e-36  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  35.4 
 
 
859 aa  153  3e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  35.65 
 
 
1241 aa  152  5e-35  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  34.33 
 
 
1120 aa  151  1.0000000000000001e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  36.55 
 
 
679 aa  150  3e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  29.55 
 
 
958 aa  149  6e-34  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  36.05 
 
 
1969 aa  148  9e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  33.11 
 
 
530 aa  146  4e-33  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  35.76 
 
 
685 aa  146  5e-33  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  35.28 
 
 
460 aa  144  1.9999999999999998e-32  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  40.16 
 
 
675 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  40.08 
 
 
669 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.96 
 
 
713 aa  143  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  38.89 
 
 
551 aa  143  3e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  27.44 
 
 
1602 aa  140  3.0000000000000003e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  30.82 
 
 
1620 aa  139  4e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  31.46 
 
 
861 aa  140  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  36.1 
 
 
658 aa  137  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  38.31 
 
 
581 aa  136  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  30.82 
 
 
1606 aa  135  6e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  32.39 
 
 
930 aa  135  9e-30  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  30.39 
 
 
1236 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  31.96 
 
 
1528 aa  134  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2588  PKD domain containing protein  28.93 
 
 
815 aa  131  1.0000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0382453 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  38.35 
 
 
791 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.52 
 
 
615 aa  129  4.0000000000000003e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  32.22 
 
 
1387 aa  128  1e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  36.29 
 
 
547 aa  125  6e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  39.44 
 
 
3295 aa  125  9.999999999999999e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0939  hypothetical protein  29.15 
 
 
1976 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0134792  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3441  beta-glycosidase-like protein  33.03 
 
 
2807 aa  124  1.9999999999999998e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3437  hypothetical protein  31.86 
 
 
2421 aa  123  3.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3439  glycerol kinase-related  31.69 
 
 
2454 aa  123  4.9999999999999996e-26  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  27.94 
 
 
2176 aa  121  9.999999999999999e-26  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  32.08 
 
 
1371 aa  122  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.17 
 
 
910 aa  120  3e-25  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  37.6 
 
 
1732 aa  120  3e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3654  hypothetical protein  33.94 
 
 
2411 aa  119  3.9999999999999997e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.34 
 
 
971 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  30.87 
 
 
1011 aa  119  3.9999999999999997e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3435  hypothetical protein  33.94 
 
 
2367 aa  119  6.9999999999999995e-25  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  28.87 
 
 
838 aa  119  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1069  PKD domain-containing protein  29.3 
 
 
1783 aa  116  4.0000000000000004e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.62393 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3756  hypothetical protein  30.62 
 
 
4071 aa  115  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00737008 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3251  hypothetical protein  39.5 
 
 
976 aa  108  8e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4166  hypothetical protein  30.47 
 
 
2833 aa  108  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000299204 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  33.75 
 
 
930 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  43.35 
 
 
560 aa  107  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0421  PKD  27.97 
 
 
952 aa  107  3e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.134923 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  29.26 
 
 
1814 aa  105  7e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  41.77 
 
 
644 aa  105  9e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1163  PKD  34.72 
 
 
1189 aa  105  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.185385  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  30.99 
 
 
869 aa  103  2e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  27.5 
 
 
1389 aa  104  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3220  hypothetical protein  25.86 
 
 
1980 aa  104  2e-20  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.782341  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  43.03 
 
 
184 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  34.87 
 
 
2552 aa  101  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  25.35 
 
 
865 aa  101  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  44.16 
 
 
500 aa  100  2e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2603  mannosidase-related  27.14 
 
 
1466 aa  99.8  5e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.252324  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  31.23 
 
 
719 aa  99.4  6e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  30.5 
 
 
929 aa  99  8e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  39.33 
 
 
1095 aa  98.2  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  32.35 
 
 
845 aa  98.6  1e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4750  PKD domain-containing protein  27.7 
 
 
1463 aa  97.4  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  37.35 
 
 
1292 aa  97.4  2e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  30.92 
 
 
1531 aa  97.1  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.03 
 
 
802 aa  95.5  8e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  42.21 
 
 
1311 aa  95.5  8e-18  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  40.79 
 
 
1231 aa  95.5  9e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  29.54 
 
 
786 aa  94.4  2e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  36.79 
 
 
819 aa  94  3e-17  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3248  hypothetical protein  29.9 
 
 
953 aa  93.2  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2421  PKD domain-containing protein  31.65 
 
 
443 aa  93.2  5e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>