120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_45251 on replicon NC_011674
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011674  PHATRDRAFT_45251  predicted protein  100 
 
 		 656 aa  1362    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_46601  predicted protein  27.67 
 
 		 680 aa  229  1e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.628004  normal  0.0180876 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34867  predicted protein  29.03 
 
 		 652 aa  225  2e-57  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.437532 
 
 
-
 
NC_006693  CNH03600  pseudouridine synthase, putative  30.74 
 
 		 863 aa  189  1e-46  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00984  pseudouridine synthase TruD/Pus7, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G16730)  26.92 
 
 		 745 aa  173  1e-41  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.584678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0398  tRNA pseudouridine synthase D  28.68 
 
 		 433 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0520  hypothetical protein  28.08 
 
 		 408 aa  120  6e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0892738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1701  pseudouridylate synthase  28.08 
 
 		 400 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000153174  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3033  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  32.27 
 
 		 404 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00845605  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0971  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  27.49 
 
 		 399 aa  113  1.0000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2776  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.83 
 
 		 420 aa  107  6e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.664077  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0808  pseudouridylate synthase  26.6 
 
 		 422 aa  103  9e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.110756  normal  0.32964 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1445  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.91 
 
 		 398 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1281  tRNA pseudouridine synthase D  30.25 
 
 		 439 aa  100  1e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3206  tRNA pseudouridine synthase D  30.95 
 
 		 438 aa  97.1  9e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.688587  hitchhiker  0.00519063 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1399  pseudouridylate synthase  31.51 
 
 		 423 aa  95.1  3e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.770816  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1240  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.06 
 
 		 410 aa  94  7e-18  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0803  hypothetical protein  31.93 
 
 		 422 aa  93.6  1e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.929073  hitchhiker  0.0000530348 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2406  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.14 
 
 		 480 aa  92.4  2e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.967787  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2096  tRNA pseudouridine synthase D TruD  29.18 
 
 		 422 aa  89  3e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3118  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.51 
 
 		 432 aa  87  9e-16  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.709417  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0760  hypothetical protein  28.48 
 
 		 398 aa  86.7  0.000000000000001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000392805  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0906  pseudouridylate synthase  30.98 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.0000103937 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0685  pseudouridylate synthase  27.08 
 
 		 444 aa  83.2  0.00000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1670  tRNA pseudouridine synthase D  29.54 
 
 		 389 aa  82.8  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0935  tRNA pseudouridine synthase D  27.02 
 
 		 389 aa  82.4  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1160  tRNA pseudouridine synthase D  25.93 
 
 		 399 aa  82  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00000300328  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1011  tRNA pseudouridine synthase D  28.09 
 
 		 389 aa  80.1  0.0000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1009  tRNA pseudouridine synthase D  36.96 
 
 		 365 aa  80.1  0.0000000000001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0017  tRNA pseudouridine synthase D  25 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1207  tRNA pseudouridine synthase D  28.26 
 
 		 389 aa  78.6  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1041  tRNA pseudouridine synthase D  38.35 
 
 		 374 aa  79  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0766791  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1684  pseudouridylate synthase  28.17 
 
 		 413 aa  78.2  0.0000000000005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.667214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1576  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.07 
 
 		 443 aa  77.8  0.0000000000005  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0247581  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0406  tRNA pseudouridine synthase D  35.29 
 
 		 375 aa  78.2  0.0000000000005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0511  pseudouridylate synthase  26.72 
 
 		 412 aa  77  0.000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.0173312 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1450  tRNA pseudouridine synthase D  38.06 
 
 		 372 aa  77  0.000000000001  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0756  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.68 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.476979  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1488  tRNA pseudouridine synthase D TruD  25.5 
 
 		 390 aa  75.5  0.000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1631  tRNA pseudouridine synthase D  38.06 
 
 		 372 aa  74.7  0.000000000005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1474  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.86 
 
 		 454 aa  74.7  0.000000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1792  tRNA pseudouridine synthase D  37.31 
 
 		 372 aa  74.3  0.000000000007  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0089  tRNA pseudouridine synthase D  30.63 
 
 		 377 aa  73.2  0.00000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0276  tRNA pseudouridine synthase D TruD  27.82 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0990  pseudouridylate synthase  27.42 
 
 		 390 aa  72.8  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1638  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.72 
 
 		 430 aa  72.4  0.00000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.197782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0774  tRNA pseudouridine synthase D  35.34 
 
 		 374 aa  72.8  0.00000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1181  tRNA pseudouridine synthase D TruD  37.31 
 
 		 361 aa  70.5  0.00000000009  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1782  pseudouridylate synthase  24.24 
 
 		 411 aa  70.1  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000171757 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4647  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.08 
 
 		 355 aa  67  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2665  tRNA pseudouridine synthase D  26 
 
 		 452 aa  65.9  0.000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1340  pseudouridylate synthase  32.33 
 
 		 291 aa  65.5  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.185288  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1378  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.33 
 
 		 455 aa  62.8  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.416221  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0572  tRNA pseudouridine synthase D  24.54 
 
 		 483 aa  62.8  0.00000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.0939983  normal  0.837825 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1617  tRNA pseudouridine synthase D TruD  36.13 
 
 		 357 aa  62.4  0.00000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0830625 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0528  tRNA pseudouridine synthase D TruD  28.51 
 
 		 385 aa  62  0.00000003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0245  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.3 
 
 		 388 aa  61.6  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.107807  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0542  tRNA pseudouridine synthase D TruD  35.4 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.238992  hitchhiker  0.000000811718 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0372  tRNA pseudouridine synthase D  35.4 
 
 		 362 aa  60.8  0.00000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1745  pseudouridylate synthase  22.25 
 
 		 386 aa  60.5  0.00000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000122124  normal  0.627089 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1594  tRNA pseudouridine synthase D TruD  23.71 
 
 		 412 aa  60.1  0.0000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3784  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30.46 
 
 		 348 aa  59.3  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1032  tRNA pseudouridine synthase D  33.33 
 
 		 357 aa  58.5  0.0000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.589732  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1499  tRNA pseudouridine synthase D  34.96 
 
 		 335 aa  58.5  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.128377  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1198  tRNA pseudouridine synthase TruD  25.37 
 
 		 398 aa  58.5  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1463  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.95 
 
 		 455 aa  57  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.278436  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2489  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  23.77 
 
 		 457 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.983394  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3769  tRNA pseudouridine synthase D TruD  26.86 
 
 		 349 aa  56.2  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1366  tRNA pseudouridine synthase D TruD  22.54 
 
 		 455 aa  55.5  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.206358  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2519  tRNA pseudouridine synthase D  32.74 
 
 		 354 aa  54.3  0.000007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3123  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.33 
 
 		 377 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.739944  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3275  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.33 
 
 		 377 aa  54.3  0.000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0594  pseudouridylate synthase  31.85 
 
 		 359 aa  53.9  0.000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.124721  normal  0.779245 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1189  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.33 
 
 		 354 aa  53.9  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3132  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.81 
 
 		 377 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1148  tRNA pseudouridine synthase D TruD  31.86 
 
 		 363 aa  53.5  0.00001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1241  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.33 
 
 		 377 aa  53.5  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.148473  hitchhiker  0.0000000000992324 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1293  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30 
 
 		 354 aa  52.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.970908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1005  tRNA pseudouridine synthase D TruD  30 
 
 		 359 aa  53.1  0.00002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.604587  normal  0.323448 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3134  tRNA pseudouridine synthase D  31.86 
 
 		 349 aa  52.8  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0800342 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3118  tRNA pseudouridine synthase D  31.86 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3079  tRNA pseudouridine synthase D  31.86 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.737275 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3053  tRNA pseudouridine synthase D  31.86 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3238  tRNA pseudouridine synthase D  31.86 
 
 		 349 aa  53.1  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0138  pseudouridylate synthase  34.09 
 
 		 350 aa  52.4  0.00003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0151671  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3346  tRNA pseudouridine synthase D TruD  33.33 
 
 		 355 aa  52.4  0.00003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00141322  hitchhiker  0.000000295162 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1411  tRNA pseudouridine synthase D TruD  32.48 
 
 		 345 aa  51.6  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1294  pseudouridylate synthase  32.54 
 
 		 356 aa  51.6  0.00005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.918905  hitchhiker  0.00000000169172 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1040  pseudouridylate synthase  34.19 
 
 		 360 aa  51.2  0.00006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.871922 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2197  tRNA pseudouridine synthase D TruD  24.48 
 
 		 395 aa  51.2  0.00006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000286837  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3643  pseudouridylate synthase  29.8 
 
 		 347 aa  50.8  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.320312  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0216  pseudouridylate synthase  30.97 
 
 		 346 aa  50.1  0.0001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1056  pseudouridylate synthase  30.95 
 
 		 357 aa  50.4  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1120  tRNA pseudouridine synthase D, TruD  30.66 
 
 		 375 aa  50.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1456  tRNA pseudouridine synthase D  26.67 
 
 		 343 aa  50.1  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03723  Pseudouridylate synthase  28.82 
 
 		 361 aa  50.4  0.0001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.143609  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3436  hypothetical protein  33.91 
 
 		 370 aa  49.7  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1400  hypothetical protein  30.25 
 
 		 338 aa  49.3  0.0002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0856  tRNA pseudouridine synthase D  31.58 
 
 		 358 aa  49.7  0.0002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3351  tRNA pseudouridine synthase D  28.81 
 
 		 348 aa  49.7  0.0002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>