More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_4546 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  100 
 
 		 876 aa  1770    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  33.22 
 
 		 923 aa  415  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.42 
 
 		 554 aa  393  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3766  GMC oxidoreductase  39.05 
 
 		 582 aa  383  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  35.59 
 
 		 545 aa  256  1.0000000000000001e-66  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  36.55 
 
 		 579 aa  254  6e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  33.33 
 
 		 567 aa  254  6e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  35.92 
 
 		 579 aa  251  4e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  37.73 
 
 		 547 aa  250  8e-65  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2465  FAD dependent oxidoreductase  35.16 
 
 		 581 aa  250  1e-64  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.480647  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  33.92 
 
 		 554 aa  236  1.0000000000000001e-60  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  35.37 
 
 		 546 aa  234  4.0000000000000004e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1858  FAD dependent oxidoreductase  32.95 
 
 		 513 aa  234  7.000000000000001e-60  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.412322  normal  0.198302 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  33.74 
 
 		 562 aa  216  9.999999999999999e-55  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5013  hypothetical protein  32.32 
 
 		 524 aa  201  3.9999999999999996e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0102781  normal  0.201435 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  33.09 
 
 		 570 aa  201  3.9999999999999996e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  33.58 
 
 		 581 aa  200  9e-50  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  30.49 
 
 		 509 aa  197  6e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1183  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.44 
 
 		 530 aa  190  9e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 518 aa  190  9e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0422  GMC oxidoreductase  32.41 
 
 		 568 aa  180  1e-43  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2912  GMC oxidoreductase  29.81 
 
 		 488 aa  178  4e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0632  FAD dependent oxidoreductase  31.28 
 
 		 534 aa  168  2.9999999999999998e-40  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  30.82 
 
 		 571 aa  167  1.0000000000000001e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2722  GMC oxidoreductase  28.21 
 
 		 488 aa  166  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.305214  normal  1 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 528 aa  162  3e-38  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3133  GMC oxidoreductase  27.96 
 
 		 488 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.275059 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2581  GMC oxidoreductase  27.77 
 
 		 488 aa  157  1e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2692  GMC oxidoreductase  29.47 
 
 		 562 aa  149  2.0000000000000003e-34  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0204  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 535 aa  141  3.9999999999999997e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.32401 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.05 
 
 		 531 aa  127  1e-27  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.4 
 
 		 533 aa  125  3e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.84 
 
 		 545 aa  122  3e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 		 545 aa  111  5e-23  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  29.17 
 
 		 489 aa  108  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.24 
 
 		 522 aa  106  2e-21  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0978  hypothetical protein  27.54 
 
 		 502 aa  105  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.667371  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.22 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.22 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.2 
 
 		 522 aa  103  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 		 534 aa  99.8  2e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 553 aa  99  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.24 
 
 		 533 aa  97.8  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 		 522 aa  97.4  9e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.25 
 
 		 526 aa  97.1  1e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  24.09 
 
 		 522 aa  96.3  2e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2515  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.63 
 
 		 518 aa  95.9  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.611733  normal  0.0157209 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 		 501 aa  95.5  4e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.69 
 
 		 527 aa  95.5  4e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  26.08 
 
 		 523 aa  95.1  5e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.51 
 
 		 528 aa  94.7  7e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  26.48 
 
 		 522 aa  94.7  7e-18  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 		 539 aa  94.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 		 539 aa  94.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.7 
 
 		 539 aa  94.4  8e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.42 
 
 		 523 aa  94  1e-17  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.37 
 
 		 539 aa  93.2  2e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  26.08 
 
 		 528 aa  92.8  2e-17  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.37 
 
 		 556 aa  93.2  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 524 aa  93.2  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.611516 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.63 
 
 		 539 aa  92  4e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.45 
 
 		 534 aa  92  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.82 
 
 		 534 aa  90.9  9e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.82 
 
 		 534 aa  90.9  9e-17  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.97 
 
 		 526 aa  90.5  1e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 512 aa  89.7  2e-16  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.26 
 
 		 533 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.26 
 
 		 533 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.26 
 
 		 533 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.49 
 
 		 556 aa  89  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  26.06 
 
 		 534 aa  89.4  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 		 536 aa  88.6  5e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.4 
 
 		 539 aa  87  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.13 
 
 		 540 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.31 
 
 		 522 aa  87  0.000000000000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  27.85 
 
 		 662 aa  85.5  0.000000000000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.19 
 
 		 662 aa  85.1  0.000000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1415  hypothetical protein  28.36 
 
 		 537 aa  84.7  0.000000000000006  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.78 
 
 		 550 aa  84.3  0.000000000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.55 
 
 		 547 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 534 aa  84  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.12 
 
 		 662 aa  83.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.09 
 
 		 662 aa  83.2  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1434  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.78 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1245  hypothetical protein  26.65 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.904528  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2589  glucose dehydrogenase  27.78 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1083  hypothetical protein  26.65 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0832661  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1349  glucose dehydrogenase, alpha subunit  27.78 
 
 		 537 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.13 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.15 
 
 		 539 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4442  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 		 539 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.795175  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0216  hypothetical protein  26.65 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0489  hypothetical protein  26.65 
 
 		 537 aa  82.8  0.00000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.143088  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 522 aa  82  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1160  putative glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.67 
 
 		 552 aa  82  0.00000000000004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.64 
 
 		 538 aa  81.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  23.57 
 
 		 551 aa  81.6  0.00000000000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 		 539 aa  81.3  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.34 
 
 		 512 aa  81.3  0.00000000000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>