More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LEUM_1564 on replicon NC_008531
Organism: Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  35.19 
 
 		 1189 aa  663    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  35.79 
 
 		 1189 aa  711    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  35.98 
 
 		 1189 aa  707    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  35.84 
 
 		 1189 aa  708    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  35.63 
 
 		 1189 aa  707    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  37.25 
 
 		 1187 aa  714    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  35.79 
 
 		 1189 aa  711    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  36.19 
 
 		 1189 aa  724    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  35.32 
 
 		 1188 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  35.98 
 
 		 1189 aa  707    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  37.6 
 
 		 1187 aa  774    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  36.22 
 
 		 1189 aa  708    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  35.64 
 
 		 1189 aa  719    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  35.32 
 
 		 1188 aa  682    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  36.31 
 
 		 1189 aa  729    Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  37.06 
 
 		 1189 aa  735    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  40.29 
 
 		 1187 aa  794    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  35.95 
 
 		 1174 aa  650    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  41.14 
 
 		 1184 aa  788    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  35.74 
 
 		 1186 aa  651    Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  100 
 
 		 1185 aa  2412    Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  35.17 
 
 		 1179 aa  625  1e-177  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  33.58 
 
 		 1190 aa  618  1e-175  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  35.95 
 
 		 1177 aa  609  9.999999999999999e-173  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  33.47 
 
 		 1190 aa  604  1.0000000000000001e-171  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1716  chromosome segregation protein SMC  32.5 
 
 		 1196 aa  597  1e-169  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.651651  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  33.61 
 
 		 1186 aa  582  1e-164  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  30.85 
 
 		 1185 aa  578  1.0000000000000001e-163  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  32.74 
 
 		 1190 aa  576  1.0000000000000001e-162  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  31.43 
 
 		 1191 aa  567  1e-160  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  29.95 
 
 		 1177 aa  524  1e-147  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  31.45 
 
 		 1175 aa  512  1e-143  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3319  chromosome segregation protein SMC  31.21 
 
 		 1176 aa  511  1e-143  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.240957  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  31.33 
 
 		 1176 aa  509  9.999999999999999e-143  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1094  chromosome segregation protein SMC  30.95 
 
 		 1176 aa  504  1e-141  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2356  chromosome segregation SMC protein  30.88 
 
 		 1173 aa  500  1e-140  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0899656  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  29.32 
 
 		 1204 aa  475  1e-132  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.37 
 
 		 1191 aa  460  9.999999999999999e-129  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  29.16 
 
 		 1181 aa  451  1e-125  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  28.92 
 
 		 1175 aa  441  9.999999999999999e-123  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0412  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 		 1148 aa  437  1e-121  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0643  chromosome segregation protein SMC  29.6 
 
 		 1185 aa  434  1e-120  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.126357  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  29.21 
 
 		 1167 aa  421  1e-116  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  28.1 
 
 		 1170 aa  419  9.999999999999999e-116  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.89 
 
 		 1170 aa  411  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1186 aa  411  1e-113  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  27.82 
 
 		 1185 aa  406  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.94 
 
 		 1403 aa  387  1e-106  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  25.81 
 
 		 1164 aa  384  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2543  hypothetical protein  28.79 
 
 		 1164 aa  380  1e-104  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2673  hypothetical protein  28.3 
 
 		 1164 aa  380  1e-103  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0419  chromosome segregation protein SMC  29.9 
 
 		 1190 aa  379  1e-103  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.327904  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2443  chromosome segregation protein SMC  34.97 
 
 		 1185 aa  369  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.211812  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  26.82 
 
 		 1153 aa  364  5.0000000000000005e-99  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  26.27 
 
 		 1174 aa  363  1e-98  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0753  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 		 1150 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0900  chromosome segregation protein SMC  27.29 
 
 		 1150 aa  338  2.9999999999999997e-91  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.188992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  24.39 
 
 		 1184 aa  332  2e-89  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  25.57 
 
 		 1189 aa  327  1e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  24.84 
 
 		 1175 aa  318  4e-85  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  25.78 
 
 		 1189 aa  316  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2587  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1189 aa  312  2e-83  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 		 1188 aa  311  5e-83  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2440  chromosome segregation SMC protein  26.26 
 
 		 1109 aa  308  4.0000000000000004e-82  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.129774  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.71 
 
 		 1217 aa  301  4e-80  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  24.68 
 
 		 1189 aa  300  8e-80  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.94 
 
 		 1174 aa  300  9e-80  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  29.07 
 
 		 1172 aa  296  1e-78  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3002  chromosome segregation protein SMC  25.62 
 
 		 1192 aa  291  6e-77  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  25.14 
 
 		 1149 aa  289  2e-76  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1464  chromosome segregation protein SMC  25.54 
 
 		 1226 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1491  chromosome segregation protein SMC  25.31 
 
 		 1226 aa  284  7.000000000000001e-75  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  25.56 
 
 		 1146 aa  281  7e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  25.96 
 
 		 1147 aa  279  2e-73  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0331  chromosome segregation protein SMC  30.7 
 
 		 1201 aa  272  2e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.535871  normal  0.0329796 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  24.09 
 
 		 1219 aa  270  8.999999999999999e-71  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0962  chromosome segregation protein SMC  29.48 
 
 		 1176 aa  267  1e-69  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.910781  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3299  chromosome segregation protein SMC  29.63 
 
 		 1176 aa  266  2e-69  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.207651 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  50.62 
 
 		 1185 aa  263  1e-68  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3916  chromosome segregation protein SMC  29.29 
 
 		 1301 aa  261  5.0000000000000005e-68  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.581201  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  50.21 
 
 		 1185 aa  261  7e-68  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  30.58 
 
 		 1188 aa  260  1e-67  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3494  chromosome segregation protein SMC  29.28 
 
 		 1177 aa  258  4e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0101958  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2124  chromosome segregation protein SMC  29.37 
 
 		 1191 aa  255  4.0000000000000004e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00819579 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  48.99 
 
 		 1198 aa  254  9.000000000000001e-66  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.24 
 
 		 1194 aa  250  1e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.82 
 
 		 1196 aa  249  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.24 
 
 		 1196 aa  249  2e-64  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4025  chromosome segregation protein SMC  53.11 
 
 		 1188 aa  248  6e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.115508  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1291  chromosome segregation protein SMC  53.11 
 
 		 1198 aa  248  6e-64  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.898682 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1181  chromosome segregation protein SMC  53.11 
 
 		 1198 aa  248  6e-64  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.733756  hitchhiker  0.000532551 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0953  condensin subunit Smc  51.96 
 
 		 1187 aa  244  6e-63  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8008  chromosome segregation protein SMC  29.17 
 
 		 1224 aa  244  7.999999999999999e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0651  SMC domain-containing protein  22.93 
 
 		 1174 aa  244  1e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.721251 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0947  SMC domain protein  23.84 
 
 		 1082 aa  243  1e-62  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.823623  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1390  chromosome segregation protein SMC  51.89 
 
 		 1191 aa  243  1e-62  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0475682 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1159  chromosome segregation protein SMC  50.72 
 
 		 1203 aa  243  1e-62  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3597  chromosome segregation protein SMC  52.63 
 
 		 1222 aa  242  2.9999999999999997e-62  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1587  chromosome segregation protein SMC  51.67 
 
 		 1194 aa  242  4e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_00651  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  25.43 
 
 		 1207 aa  241  4e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.929261  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>