132 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_3280 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009441  Fjoh_3280  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 350 aa  712    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2307  PKD domain containing protein  28.13 
 
 		 356 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.625319 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4876  PKD domain containing protein  30 
 
 		 313 aa  84.3  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.480301  normal  0.596683 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  31.41 
 
 		 1862 aa  73.6  0.000000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0884  KP-43 peptidase  35.34 
 
 		 2552 aa  73.2  0.000000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.92948  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1978  Carbohydrate binding family 6  31.36 
 
 		 823 aa  72.4  0.00000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.410685 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0423  PKD  33.33 
 
 		 1095 aa  72  0.00000000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.48667 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  28.78 
 
 		 777 aa  71.2  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  28.97 
 
 		 861 aa  70.5  0.00000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  27.62 
 
 		 719 aa  70.1  0.00000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  31.41 
 
 		 786 aa  66.6  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  36.36 
 
 		 938 aa  67  0.0000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  29.8 
 
 		 1667 aa  67  0.0000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  28.48 
 
 		 870 aa  64.7  0.000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  30.66 
 
 		 1361 aa  64.3  0.000000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  30.67 
 
 		 2272 aa  63.9  0.000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  27.49 
 
 		 528 aa  63.9  0.000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  24.88 
 
 		 802 aa  63.2  0.000000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  26.89 
 
 		 845 aa  63.2  0.000000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2845  cell surface protein  30.46 
 
 		 960 aa  62.8  0.000000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.726454  normal  0.0327621 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1991  cell surface protein  29.31 
 
 		 1311 aa  62.8  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.995987 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.03 
 
 		 1606 aa  62.4  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  28.28 
 
 		 530 aa  62.4  0.00000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1915  cell surface protein  27.33 
 
 		 408 aa  61.6  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.586608  normal  0.970556 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  25.95 
 
 		 978 aa  62  0.00000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3042  PKD  29.03 
 
 		 428 aa  61.2  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.971034  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0408  legume lectin beta domain protein  29.89 
 
 		 650 aa  61.2  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.223711  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.65 
 
 		 1667 aa  60.8  0.00000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  29.61 
 
 		 840 aa  60.5  0.00000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2067  Carbohydrate binding family 6  27.45 
 
 		 819 aa  60.1  0.00000006  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.517806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2931  cell surface protein  32.35 
 
 		 940 aa  59.7  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0750354  hitchhiker  0.00446431 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  28.49 
 
 		 1356 aa  59.7  0.00000007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  30.49 
 
 		 941 aa  59.7  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  27.34 
 
 		 1969 aa  59.7  0.00000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2670  PKD domain containing protein  29.61 
 
 		 1387 aa  59.3  0.00000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.195027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  29.03 
 
 		 2176 aa  58.9  0.0000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4102  PKD domain containing protein  24.85 
 
 		 295 aa  58.2  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.774924  normal  0.123442 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  27.4 
 
 		 1300 aa  58.5  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0945  PKD  31.72 
 
 		 400 aa  58.5  0.0000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0321652  normal  0.217616 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  30 
 
 		 1732 aa  58.2  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  26.97 
 
 		 1292 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.75 
 
 		 963 aa  57.8  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  31.37 
 
 		 684 aa  57.8  0.0000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.26 
 
 		 2122 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  26.58 
 
 		 1682 aa  57  0.0000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0426  PKD  31.82 
 
 		 816 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  28.67 
 
 		 1531 aa  57  0.0000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1273  PKD repeat-containing protein  34.33 
 
 		 275 aa  57  0.0000005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  29.03 
 
 		 2554 aa  57  0.0000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3706  hypothetical protein  30 
 
 		 771 aa  55.8  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0242  PKD domain containing protein  28.29 
 
 		 1987 aa  56.2  0.0000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  29.89 
 
 		 1094 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  28 
 
 		 575 aa  55.5  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  27.63 
 
 		 460 aa  55.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  29.26 
 
 		 958 aa  55.8  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1739  PKD domain containing protein  27.27 
 
 		 1371 aa  55.1  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.665566  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  30.5 
 
 		 930 aa  55.1  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  29.37 
 
 		 3295 aa  54.7  0.000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2196  PKD domain containing protein  30.2 
 
 		 1389 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00127205  decreased coverage  0.00000000000751433 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  30.5 
 
 		 1602 aa  54.7  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  28.32 
 
 		 644 aa  53.5  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6914  PKD domain containing protein  26.76 
 
 		 1230 aa  53.1  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.791175 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  29.11 
 
 		 1001 aa  52.8  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  30.14 
 
 		 1842 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  29.32 
 
 		 2000 aa  52.4  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  26.39 
 
 		 1565 aa  52  0.00001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  26.59 
 
 		 735 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  28.92 
 
 		 1282 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3143  cell surface protein  29.8 
 
 		 819 aa  51.6  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.302282  normal  0.566596 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  26.63 
 
 		 1528 aa  51.6  0.00002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.37 
 
 		 1620 aa  52  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0698  cell surface protein  25.42 
 
 		 586 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.497702 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  32.81 
 
 		 971 aa  51.2  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  28.46 
 
 		 561 aa  50.8  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  26.09 
 
 		 1236 aa  50.4  0.00004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  29.93 
 
 		 910 aa  50.8  0.00004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  26.11 
 
 		 1027 aa  50.4  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6157  Fibronectin type III domain protein  26.58 
 
 		 918 aa  50.8  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.622603  normal  0.669224 
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  26.27 
 
 		 821 aa  50.1  0.00006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2522  PKD  30.22 
 
 		 865 aa  49.7  0.00008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.220343  normal  1 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  44.68 
 
 		 1830 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  30.26 
 
 		 615 aa  49.7  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  31.5 
 
 		 752 aa  49.3  0.00009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  28 
 
 		 769 aa  49.7  0.00009  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0305  PKD domain containing protein  27.66 
 
 		 317 aa  48.9  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.0000000757155  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  28.86 
 
 		 859 aa  48.9  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  28.22 
 
 		 791 aa  49.3  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  25.71 
 
 		 1011 aa  49.3  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  30.52 
 
 		 581 aa  48.1  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  27.05 
 
 		 1814 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  28.89 
 
 		 500 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3689  PKD domain containing protein  41.07 
 
 		 938 aa  47.8  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.222352 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  27.61 
 
 		 547 aa  47.8  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  35 
 
 		 561 aa  47.4  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  26.22 
 
 		 930 aa  47.4  0.0004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2170  hypothetical protein  26.71 
 
 		 525 aa  47.4  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  26.83 
 
 		 929 aa  47.4  0.0004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  29.56 
 
 		 560 aa  47  0.0005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  34.04 
 
 		 1042 aa  46.6  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0644  periplasmic copper-binding  40.82 
 
 		 1092 aa  46.6  0.0007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.167347  normal  0.0259302 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>