96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0576 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009441  Fjoh_0576  hypothetical protein  100 
 
 
831 aa  1685    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04045  hypothetical protein  38.97 
 
 
814 aa  596  1e-169  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13268  hypothetical protein  26.35 
 
 
828 aa  190  9e-47  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.923691  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1719  hypothetical protein  24.33 
 
 
811 aa  181  2.9999999999999997e-44  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0193339  normal  0.191572 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1476  hypothetical protein  24.53 
 
 
841 aa  179  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2647  hypothetical protein  23.51 
 
 
839 aa  176  9.999999999999999e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.567832  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1641  hypothetical protein  24.14 
 
 
853 aa  174  9e-42  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.819235  normal  0.0314988 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3440  hypothetical protein  25.15 
 
 
853 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3158  hypothetical protein  23.75 
 
 
857 aa  154  8.999999999999999e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.909082  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2875  hypothetical protein  22.92 
 
 
843 aa  153  1e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.211795  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  23.67 
 
 
848 aa  146  2e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1525  hypothetical protein  24.03 
 
 
855 aa  144  7e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0931717  normal  0.114595 
 
 
-
 
NC_002950  PG0788  hypothetical protein  22.71 
 
 
877 aa  118  5e-25  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1513  hypothetical protein  20.48 
 
 
838 aa  95.1  5e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2554  hypothetical protein  22.25 
 
 
856 aa  94.7  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0129  hypothetical protein  25.78 
 
 
829 aa  80.9  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0572036  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12863  hypothetical protein  27.07 
 
 
828 aa  65.5  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10568  hypothetical protein  31.84 
 
 
425 aa  63.2  0.00000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0268859  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4951  TonB-dependent receptor, plug  40.59 
 
 
1063 aa  59.7  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00522057  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2711  TonB-dependent receptor, plug  32.71 
 
 
1032 aa  60.1  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3629  hypothetical protein  22.18 
 
 
816 aa  59.3  0.0000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  38.24 
 
 
1023 aa  58.9  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1473  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 
1021 aa  56.6  0.000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0507296  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0263  hypothetical protein  28.86 
 
 
905 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0236828 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06835  putative TonB-dependent outer membrane receptor protein  37.74 
 
 
914 aa  55.5  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.954861  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3127  TonB-dependent receptor  37.11 
 
 
1003 aa  55.1  0.000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00375079  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  40.91 
 
 
815 aa  54.7  0.000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1983  TonB-dependent receptor plug  35.87 
 
 
1101 aa  52.8  0.00003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.445269  hitchhiker  0.00000345601 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 
1023 aa  52.8  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  31.73 
 
 
1049 aa  52  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  29.63 
 
 
942 aa  51.6  0.00005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0821  TonB-dependent receptor  29.66 
 
 
929 aa  51.6  0.00006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4660  TonB-dependent receptor plug  34.15 
 
 
894 aa  50.4  0.0001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0120659  unclonable  0.0000000000000956087 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1342  TonB-dependent receptor plug  30.77 
 
 
1047 aa  50.4  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00542277  normal  0.165874 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0252  TonB-dependent receptor, plug  33.33 
 
 
805 aa  50.8  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0553  TonB-dependent receptor plug  30.48 
 
 
1036 aa  50.1  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 
1051 aa  49.7  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3871  TonB-dependent receptor, plug  32.04 
 
 
1002 aa  49.7  0.0002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.929379  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  30.77 
 
 
874 aa  49.7  0.0002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 
1081 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4884  TonB-dependent receptor plug  31.62 
 
 
800 aa  49.3  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.954855 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1702  TonB-dependent receptor plug  33.01 
 
 
1016 aa  49.3  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.784403 
 
 
-
 
NC_002950  PG1102  hypothetical protein  23.44 
 
 
925 aa  49.7  0.0003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.778272 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1850  TonB-dependent receptor plug  33.65 
 
 
1019 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.5615  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2043  TonB-dependent receptor, plug  29.52 
 
 
1028 aa  49.7  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.495836  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3556  TonB-dependent receptor, plug  34.19 
 
 
1011 aa  49.3  0.0003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.70913  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0613  TonB-dependent receptor plug  33.98 
 
 
1059 aa  48.9  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1022  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 
1094 aa  48.9  0.0004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0353971  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1097  TonB-dependent receptor plug  27.08 
 
 
1148 aa  48.9  0.0004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00128264  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  30.69 
 
 
1030 aa  48.9  0.0004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0616  TonB-dependent receptor plug  31.76 
 
 
1063 aa  48.5  0.0005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1213  TonB-dependent receptor  33.73 
 
 
1090 aa  48.1  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1354  TonB-dependent receptor plug  36.78 
 
 
1230 aa  48.1  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.173516  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6878  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 
1078 aa  48.5  0.0006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.581395  normal  0.385444 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  29.52 
 
 
1102 aa  48.1  0.0007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3000  TonB-dependent receptor  32.14 
 
 
854 aa  47.8  0.0008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.249213  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  34.88 
 
 
1094 aa  47.8  0.0009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
824 aa  47.4  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2244  TonB-dependent receptor plug  30.12 
 
 
1109 aa  47.4  0.001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1886  TonB-dependent receptor plug  28.3 
 
 
1063 aa  47.4  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4491  TonB-dependent receptor, plug  33.72 
 
 
1129 aa  47.8  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  30.1 
 
 
1003 aa  47.4  0.001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2857  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 
1148 aa  47.8  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.22615  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0185  TonB-dependent receptor, plug  31.68 
 
 
1080 aa  47.4  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.00605968  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0328  TonB-dependent receptor plug  31.82 
 
 
1127 aa  46.6  0.002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  36.14 
 
 
1023 aa  47  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2226  hypothetical protein  31.13 
 
 
740 aa  47  0.002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000689812 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2739  TonB-dependent receptor plug  32.48 
 
 
1074 aa  46.6  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.84904  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1023  TonB-dependent receptor plug  26.92 
 
 
769 aa  45.8  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.302797  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3789  TonB-dependent receptor plug  29.17 
 
 
1169 aa  45.8  0.003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.474486  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  34.78 
 
 
1034 aa  45.8  0.003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1601  TonB-dependent receptor  29.05 
 
 
1055 aa  46.2  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.709185 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2316  hypothetical protein  27.17 
 
 
866 aa  46.2  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.824305  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4949  TonB-dependent receptor plug  32.41 
 
 
1062 aa  45.4  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.188744  normal  0.822466 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  30.56 
 
 
735 aa  45.4  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4373  TonB-dependent receptor, plug  31.93 
 
 
1009 aa  45.8  0.004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0229973  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2367  hypothetical protein  28.57 
 
 
767 aa  45.1  0.005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3363  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 
1043 aa  45.4  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0179499  normal  0.688062 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1074  TonB-dependent receptor plug  29.81 
 
 
1114 aa  45.1  0.005  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4975  TonB-dependent receptor plug  32.93 
 
 
1055 aa  44.7  0.006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.416467  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3384  TonB-dependent receptor  32.18 
 
 
1166 aa  45.1  0.006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.880161  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4039  TonB-dependent siderophore receptor  34.58 
 
 
814 aa  44.7  0.007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  35.63 
 
 
1132 aa  44.7  0.007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3262  hypothetical protein  28.95 
 
 
1067 aa  44.7  0.007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3196  TonB-dependent receptor plug  28.24 
 
 
1099 aa  44.7  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.377332 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1702  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 
1176 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.456283  normal  0.767755 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0443  TonB-dependent receptor plug  25 
 
 
989 aa  44.7  0.008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7234  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 
1119 aa  44.3  0.008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.507309  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0560  TonB-dependent receptor plug  31.33 
 
 
971 aa  44.7  0.008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0108635  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1131  hypothetical protein  31.58 
 
 
236 aa  44.3  0.009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.543698 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  27.66 
 
 
1064 aa  44.3  0.009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  29.67 
 
 
1103 aa  44.3  0.009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4827  TonB-dependent receptor, plug  28.91 
 
 
748 aa  44.3  0.009  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2894  TonB-dependent receptor, plug  30.95 
 
 
1237 aa  44.3  0.01  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.403551  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0905  TonB-dependent receptor  35.29 
 
 
1181 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000345884 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0120  TonB-dependent receptor  33.59 
 
 
833 aa  44.3  0.01  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>