More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_4992 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_4992  TonB-dependent receptor plug  100 
 
 		 1033 aa  2112    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00275317  normal  0.224873 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4782  TonB-dependent receptor  38.61 
 
 		 1144 aa  650    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1497  TonB-dependent receptor plug  37.89 
 
 		 1102 aa  642    Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0349817  normal  0.348136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1259  TonB-dependent receptor plug  34.29 
 
 		 1106 aa  625  1e-177  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.394544 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5508  TonB-dependent receptor plug  37.27 
 
 		 986 aa  610  1e-173  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000560804  hitchhiker  0.00878967 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0441  TonB-dependent receptor plug  33.72 
 
 		 1034 aa  531  1e-149  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.000408448  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5672  TonB-dependent receptor plug  32.64 
 
 		 1017 aa  517  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00146027  normal  0.794297 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7253  TonB-dependent receptor plug  34.52 
 
 		 996 aa  519  1.0000000000000001e-145  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0939847  normal  0.604549 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2302  TonB-dependent receptor plug  34.36 
 
 		 1096 aa  506  9.999999999999999e-143  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3981  TonB-dependent receptor plug  32.65 
 
 		 1006 aa  504  1e-141  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.50745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2893  TonB-dependent receptor plug  34.49 
 
 		 1077 aa  481  1e-134  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.636312  normal  0.702134 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1708  TonB-dependent receptor plug  32.3 
 
 		 1042 aa  474  1e-132  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0323206 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0793  TonB-dependent receptor plug  31.97 
 
 		 1050 aa  450  1e-125  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.795516  normal  0.0167144 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0754  TonB-dependent receptor plug  31.49 
 
 		 1038 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  30.81 
 
 		 1105 aa  444  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  31.99 
 
 		 1116 aa  443  1e-123  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6433  TonB-dependent receptor plug  33.46 
 
 		 1013 aa  444  1e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.234793  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  31.92 
 
 		 1161 aa  441  9.999999999999999e-123  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3882  TonB-dependent receptor, plug  31.23 
 
 		 1030 aa  439  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.202401  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4194  TonB-dependent receptor  31.05 
 
 		 1000 aa  437  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.173861  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1015  TonB-dependent receptor plug  31.2 
 
 		 993 aa  437  1e-121  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.045736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  30.64 
 
 		 1006 aa  434  1e-120  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2077  TonB-dependent receptor  31.04 
 
 		 1008 aa  433  1e-120  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1077  TonB-dependent receptor plug  31.52 
 
 		 1147 aa  431  1e-119  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2116  TonB-dependent receptor plug  31.29 
 
 		 1114 aa  429  1e-118  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.398452  normal  0.942953 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0868  TonB-dependent receptor plug  31.18 
 
 		 1117 aa  426  1e-117  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.503541  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2412  TonB-dependent receptor  30.39 
 
 		 1029 aa  419  9.999999999999999e-116  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.525644  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  31.51 
 
 		 1008 aa  417  9.999999999999999e-116  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0997  TonB-dependent receptor plug  31.07 
 
 		 979 aa  418  9.999999999999999e-116  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4255  TonB-dependent receptor, plug  30.78 
 
 		 1034 aa  413  1e-114  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 1038 aa  411  1e-113  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0932  TonB-dependent receptor plug  31.7 
 
 		 1012 aa  406  1.0000000000000001e-112  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.112276  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2262  TonB-dependent receptor plug  30.29 
 
 		 1087 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.418018  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1425  TonB-dependent receptor plug  31.14 
 
 		 1168 aa  405  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.3493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  30.19 
 
 		 1175 aa  398  1e-109  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5599  TonB-dependent receptor  30.33 
 
 		 982 aa  395  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.89451 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  30.88 
 
 		 1028 aa  393  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1124 aa  396  1e-108  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  30.79 
 
 		 1132 aa  394  1e-108  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  31.3 
 
 		 1051 aa  390  1e-107  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0679  TonB-dependent receptor plug  30.65 
 
 		 1148 aa  393  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0517707  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1584  TonB-dependent receptor plug  29.84 
 
 		 1177 aa  390  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.268471  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2137  TonB-dependent receptor  30.02 
 
 		 1050 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.341252 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  30.43 
 
 		 1106 aa  392  1e-107  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  29.74 
 
 		 986 aa  389  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  29.5 
 
 		 1181 aa  387  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4206  TonB-dependent receptor plug  30.83 
 
 		 1023 aa  387  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.43352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1390  TonB-dependent receptor plug  29.36 
 
 		 1037 aa  388  1e-106  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.488249  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4434  TonB-dependent receptor, plug  30.83 
 
 		 1023 aa  385  1e-105  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  31.42 
 
 		 1155 aa  384  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3418  TonB-dependent receptor plug  29.85 
 
 		 1076 aa  386  1e-105  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  29.86 
 
 		 1163 aa  381  1e-104  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0633  TonB-dependent receptor plug  28.85 
 
 		 1051 aa  382  1e-104  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  31.13 
 
 		 1076 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1155 aa  382  1e-104  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1274  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1066 aa  379  1e-103  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1383  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1154 aa  380  1e-103  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.219265  normal  0.257074 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2231  TonB-dependent receptor  29.79 
 
 		 1037 aa  375  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3704  TonB-dependent receptor plug  29.99 
 
 		 1128 aa  374  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3420  TonB-dependent receptor plug  29.02 
 
 		 1076 aa  372  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0439065  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  28.76 
 
 		 1152 aa  368  1e-100  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0339  TonB-dependent receptor  29.11 
 
 		 1043 aa  369  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4210  TonB-dependent receptor plug  29.43 
 
 		 1027 aa  365  3e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  28.87 
 
 		 1140 aa  365  3e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2844  TonB-dependent receptor plug  28.69 
 
 		 1049 aa  363  9e-99  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0308966 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4381  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1071 aa  363  1e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.380441  normal  0.425173 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4708  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1097 aa  362  1e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2082  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1173 aa  362  2e-98  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.843003  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  27.95 
 
 		 1010 aa  359  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5648  TonB-dependent receptor plug  29.39 
 
 		 1041 aa  358  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0196  TonB-dependent receptor plug  29.18 
 
 		 1034 aa  359  1.9999999999999998e-97  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1343  TonB-dependent receptor plug  29.1 
 
 		 1014 aa  356  1e-96  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.253983  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4645  TonB-dependent receptor, plug  28.66 
 
 		 1041 aa  356  2e-96  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.342481  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1023 aa  355  4e-96  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  29.26 
 
 		 1039 aa  354  5e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0725  TonB-dependent receptor plug  28.89 
 
 		 1129 aa  350  5e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6053  TonB-dependent receptor plug  28.72 
 
 		 1006 aa  350  6e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3497  TonB-dependent receptor plug  28.27 
 
 		 1036 aa  350  7e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.124606  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5330  TonB-dependent receptor  28.94 
 
 		 1177 aa  350  9e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.0000015057  normal  0.0697872 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  29.31 
 
 		 1168 aa  350  9e-95  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2652  TonB-dependent receptor plug  30.08 
 
 		 1040 aa  349  1e-94  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0446774  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2533  TonB-dependent receptor plug  27.71 
 
 		 1103 aa  350  1e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.225458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1620  TonB-dependent receptor  28.32 
 
 		 1014 aa  349  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.603085  normal  0.770482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0955  TonB-dependent receptor plug  28.47 
 
 		 1079 aa  348  2e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.14605  normal  0.53847 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4456  TonB-dependent receptor plug  29.29 
 
 		 1010 aa  348  4e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000450006  normal  0.634618 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2845  TonB-dependent receptor  28.49 
 
 		 1025 aa  347  6e-94  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.346257  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  28.26 
 
 		 1071 aa  347  8e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5260  TonB-dependent receptor plug  28.22 
 
 		 1060 aa  347  8.999999999999999e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  27.31 
 
 		 1080 aa  346  1e-93  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1036  TonB-dependent receptor plug  27.83 
 
 		 1081 aa  346  1e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.105271 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1042  TonB-dependent receptor plug  29.3 
 
 		 1058 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.951864  normal  0.539314 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2523  TonB-dependent receptor  29.41 
 
 		 1019 aa  345  2e-93  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1128  TonB-dependent receptor plug  29.68 
 
 		 1004 aa  343  7e-93  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.979284  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0956  TonB-dependent receptor plug  29.56 
 
 		 1154 aa  342  2e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.648971  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1023 aa  342  2.9999999999999998e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2829  TonB-dependent receptor plug  26.84 
 
 		 1053 aa  342  2.9999999999999998e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.16137  normal  0.0213731 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0517  TonB-dependent receptor plug  27.26 
 
 		 1079 aa  340  8e-92  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00691283 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2729  TonB-dependent receptor plug  27.46 
 
 		 999 aa  340  9e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0287081 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3863  TonB-dependent receptor  28.93 
 
 		 1034 aa  339  9.999999999999999e-92  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.711761  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1723  TonB-dependent receptor plug  27.69 
 
 		 1071 aa  340  9.999999999999999e-92  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000845953  normal  0.63993 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>