More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpin_1495 on replicon NC_013132
Organism: Chitinophaga pinensis DSM 2588



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 506 aa  1048    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  44.15 
 
 		 499 aa  374  1e-102  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3524  RagB/SusD domain-containing protein  38.79 
 
 		 487 aa  291  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  36.1 
 
 		 508 aa  249  1e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  35.54 
 
 		 506 aa  235  2.0000000000000002e-60  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1122  RagB/SusD domain protein  32.83 
 
 		 511 aa  216  9.999999999999999e-55  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  32.95 
 
 		 494 aa  213  5.999999999999999e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  32.14 
 
 		 500 aa  196  1e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  30.74 
 
 		 479 aa  192  9e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  33.27 
 
 		 494 aa  189  1e-46  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 541 aa  184  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  28.96 
 
 		 488 aa  183  5.0000000000000004e-45  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  31.4 
 
 		 486 aa  179  8e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  30.49 
 
 		 499 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  30.42 
 
 		 476 aa  179  1e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  32.37 
 
 		 483 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 493 aa  176  9.999999999999999e-43  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6739  RagB/SusD domain protein  31.09 
 
 		 513 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  31.16 
 
 		 477 aa  174  5e-42  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  28.39 
 
 		 520 aa  163  6e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  32.13 
 
 		 473 aa  162  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1561  RagB/SusD domain-containing protein  29.67 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 511 aa  159  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  28.19 
 
 		 477 aa  157  5.0000000000000005e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 504 aa  154  2e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.16 
 
 		 478 aa  154  2e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  29.38 
 
 		 481 aa  154  2.9999999999999998e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  27.55 
 
 		 448 aa  153  7e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  28.08 
 
 		 460 aa  152  2e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  28.17 
 
 		 497 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  26 
 
 		 491 aa  152  2e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  27.97 
 
 		 490 aa  149  9e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  27.75 
 
 		 483 aa  149  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5797  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 601 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.13947 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4005  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 495 aa  147  5e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0243804  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  28.84 
 
 		 503 aa  147  6e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  27.81 
 
 		 494 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2434  RagB/SusD domain protein  27.72 
 
 		 588 aa  144  3e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00000109153  normal  0.490439 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.51 
 
 		 507 aa  144  4e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  28.79 
 
 		 486 aa  143  6e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1602  RagB/SusD domain protein  26.98 
 
 		 570 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.71543 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.72 
 
 		 476 aa  140  3.9999999999999997e-32  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27.36 
 
 		 502 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  30.06 
 
 		 514 aa  139  8.999999999999999e-32  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  28.32 
 
 		 447 aa  139  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  26.71 
 
 		 549 aa  137  4e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  30.37 
 
 		 522 aa  137  5e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0956  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 498 aa  136  7.000000000000001e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.587305  normal  0.507784 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  28.21 
 
 		 498 aa  136  9e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0276  RagB/SusD domain protein  28.6 
 
 		 582 aa  136  9.999999999999999e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.125375  normal  0.63958 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  27.69 
 
 		 481 aa  136  9.999999999999999e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  30.05 
 
 		 532 aa  135  1.9999999999999998e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  28.74 
 
 		 447 aa  135  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  28.24 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7270  RagB/SusD domain protein  26.33 
 
 		 598 aa  134  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0568221  normal  0.664378 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 508 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  30.14 
 
 		 488 aa  132  2.0000000000000002e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.78 
 
 		 503 aa  131  3e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  29.75 
 
 		 501 aa  131  3e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1035  RagB/SusD domain protein  31.44 
 
 		 503 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.896019  normal  0.0661736 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  27.17 
 
 		 457 aa  130  7.000000000000001e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  28.28 
 
 		 466 aa  130  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  25.61 
 
 		 512 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1459  RagB/SusD domain protein  28.11 
 
 		 592 aa  129  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.983922  normal  0.298849 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  26.93 
 
 		 511 aa  128  2.0000000000000002e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 466 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  26.39 
 
 		 579 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  26.36 
 
 		 506 aa  127  4.0000000000000003e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5259  RagB/SusD domain protein  25.5 
 
 		 592 aa  127  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  28.05 
 
 		 486 aa  126  8.000000000000001e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  27.5 
 
 		 484 aa  126  1e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1078  RagB/SusD domain protein  27.94 
 
 		 509 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.227742  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  26.44 
 
 		 531 aa  124  3e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2293  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 514 aa  124  3e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  25.54 
 
 		 471 aa  124  4e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3864  RagB/SusD domain-containing protein  30.72 
 
 		 507 aa  124  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0348002  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 470 aa  124  5e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  28.15 
 
 		 521 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  25.96 
 
 		 510 aa  122  9.999999999999999e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 456 aa  122  1.9999999999999998e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3283  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 579 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.355716  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4950  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 592 aa  122  1.9999999999999998e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0441936  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  28.85 
 
 		 521 aa  121  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1910  RagB/SusD domain protein  25.57 
 
 		 594 aa  121  3.9999999999999996e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.289351 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3496  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 519 aa  120  4.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.0000423782  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  25.74 
 
 		 523 aa  120  7e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2992  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 576 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.145444  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  27.89 
 
 		 521 aa  120  7.999999999999999e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0788  RagB/SusD domain protein  28.57 
 
 		 603 aa  119  9.999999999999999e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 480 aa  119  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  25.43 
 
 		 505 aa  118  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  24.96 
 
 		 531 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  25.69 
 
 		 499 aa  117  6e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5507  RagB/SusD domain protein  25.84 
 
 		 549 aa  115  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000082911  hitchhiker  0.00267886 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  25.75 
 
 		 511 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  27.13 
 
 		 613 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2244  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 532 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.170816  normal  0.955018 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4783  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 548 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  27.08 
 
 		 511 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  25.88 
 
 		 527 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>