119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_2646 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_2646  PKD domain-containing protein  100 
 
 		 540 aa  1129    Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.671954  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2654  PKD domain-containing protein  34.06 
 
 		 690 aa  319  1e-85  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1651  Basic Secretory Protein  32.13 
 
 		 277 aa  120  4.9999999999999996e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.17013 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6161  alpha-1,2-mannosidase  40.48 
 
 		 1426 aa  91.7  3e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.241568  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3265  putative alpha-1,2-mannosidase  36.43 
 
 		 1427 aa  87  7e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.454408 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3495  putative alpha-1,2-mannosidase  37.21 
 
 		 1422 aa  86.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.129692  decreased coverage  0.00652278 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0334  Fibronectin type III domain protein  34.44 
 
 		 861 aa  86.3  0.000000000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.00000091275  normal  0.913538 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2599  alpha-1,2-mannosidase, putative  36.59 
 
 		 1322 aa  80.5  0.00000000000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0232  zinc carboxypeptidase, putative  35.34 
 
 		 821 aa  77.8  0.0000000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1786  hypothetical protein  35.71 
 
 		 475 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5834  PKD domain-containing protein  32.37 
 
 		 206 aa  68.9  0.0000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.552498  normal  0.42039 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4218  PKD domain containing protein  41.1 
 
 		 788 aa  66.2  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.243285  normal  0.953666 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  35.77 
 
 		 1667 aa  65.1  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0123  coagulation factor 5/8 type-like  32.87 
 
 		 944 aa  65.5  0.000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  40.74 
 
 		 1862 aa  64.7  0.000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  31.58 
 
 		 1882 aa  64.3  0.000000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  39.36 
 
 		 615 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  39.13 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.04 
 
 		 2000 aa  63.5  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0296  coagulation factor 5/8 type protein  34.65 
 
 		 954 aa  62.8  0.00000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.464689  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  33.01 
 
 		 1842 aa  60.8  0.00000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  33.33 
 
 		 1361 aa  59.7  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  33.72 
 
 		 848 aa  59.7  0.0000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  36.9 
 
 		 675 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  38.55 
 
 		 752 aa  58.9  0.0000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4279  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  30.87 
 
 		 718 aa  59.3  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1794  cell surface protein  35.44 
 
 		 1328 aa  58.5  0.0000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.193749  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  27.91 
 
 		 1292 aa  58.5  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  35.71 
 
 		 1094 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  37.35 
 
 		 658 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  35.71 
 
 		 679 aa  58.2  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2675  coagulation factor 5/8 type domain-containing protein  29.82 
 
 		 834 aa  58.2  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.343316 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  36.9 
 
 		 713 aa  57.4  0.0000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0726  hypothetical protein  31.87 
 
 		 560 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  35.96 
 
 		 2272 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  35.71 
 
 		 1969 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  31.03 
 
 		 978 aa  57  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  34.78 
 
 		 669 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  38.36 
 
 		 1241 aa  57  0.0000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  37.35 
 
 		 581 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  31.58 
 
 		 1282 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  35.48 
 
 		 551 aa  56.6  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  39.24 
 
 		 1356 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  36.25 
 
 		 1682 aa  56.2  0.000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  30.91 
 
 		 3295 aa  56.6  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  33.91 
 
 		 735 aa  55.5  0.000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  30.4 
 
 		 530 aa  55.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  37.97 
 
 		 685 aa  55.1  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3437  PKD domain containing protein  32.93 
 
 		 487 aa  55.5  0.000003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.639471  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  37.8 
 
 		 1120 aa  55.5  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1084  coagulation factor 5/8 type domain protein  31.31 
 
 		 675 aa  54.7  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00047148  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  32.29 
 
 		 1732 aa  54.7  0.000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.94 
 
 		 2036 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  40.74 
 
 		 861 aa  54.3  0.000005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  37.8 
 
 		 1300 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  37.8 
 
 		 2122 aa  54.3  0.000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  33.73 
 
 		 859 aa  53.9  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  38.75 
 
 		 575 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1626  hypothetical protein  37.8 
 
 		 644 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  38.27 
 
 		 547 aa  53.1  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  27.66 
 
 		 2176 aa  53.1  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.95 
 
 		 963 aa  53.5  0.00001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2651  Cell wall assembly/cell proliferation coordinating protein, KNR4  30.95 
 
 		 506 aa  53.5  0.00001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.144451  normal  0.54026 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0787  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 561 aa  52.8  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.605081  normal  0.12809 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  33 
 
 		 460 aa  53.1  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  30.39 
 
 		 2554 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  27.66 
 
 		 786 aa  53.1  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1714  glycoside hydrolase family protein  37.21 
 
 		 951 aa  52.4  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  32.56 
 
 		 958 aa  52.4  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  41.54 
 
 		 971 aa  52  0.00003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0367  VCBS  30.56 
 
 		 6678 aa  51.6  0.00003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.410615 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1485  putative surface layer protein  37.97 
 
 		 184 aa  51.6  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.461481  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  40.51 
 
 		 791 aa  51.2  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1920  Carbohydrate binding family 6  28.45 
 
 		 777 aa  51.6  0.00004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.208758 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2419  PKD domain-containing protein  31.52 
 
 		 684 aa  51.2  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2070  Carbohydrate binding family 6  34.48 
 
 		 802 aa  51.2  0.00005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.002169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1683  PKD  35.06 
 
 		 211 aa  50.4  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.657327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0420  PKD  31.46 
 
 		 1236 aa  50.4  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0326903  normal  0.301523 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0425  PKD  42.53 
 
 		 1231 aa  50.4  0.00009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2950  PKD  37.97 
 
 		 439 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.735619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1336  PKD domain containing protein  33.33 
 
 		 567 aa  50.1  0.0001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  34.04 
 
 		 838 aa  48.9  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3325  cell surface protein  33.73 
 
 		 938 aa  48.9  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00941994 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3003  alpha-1,2-mannosidase  30.77 
 
 		 1053 aa  48.9  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.671088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  28.12 
 
 		 528 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  39.06 
 
 		 870 aa  49.3  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2762  PKD  34.25 
 
 		 500 aa  47.8  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3324  carbohydrate-binding family 6 protein  32.32 
 
 		 972 aa  47.8  0.0005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0639  PKD domain-containing protein  34.48 
 
 		 769 aa  47.8  0.0006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.292646  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2844  hypothetical protein  33.33 
 
 		 1001 aa  47.4  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0777438  normal  0.0344466 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0907  Carbohydrate binding family 6  35.94 
 
 		 845 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00955406  normal  0.403954 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1473  Carbohydrate binding family 6  30.53 
 
 		 719 aa  47.4  0.0007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.0000967191  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2440  PKD  25.83 
 
 		 1042 aa  47  0.0008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.120372  normal  0.562563 
 
 
-
 
NC_007349  Mbar_B3754  hypothetical protein  34.48 
 
 		 1830 aa  46.6  0.001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.301903 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  31.4 
 
 		 1528 aa  46.2  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  33.73 
 
 		 941 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  30 
 
 		 1531 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1016  glycoside hydrolase family protein  30.86 
 
 		 880 aa  46.6  0.001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1961  Carbohydrate binding family 6  30.48 
 
 		 840 aa  46.6  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  unclonable  0.00050409  normal  0.0219561 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1970  periplasmic copper-binding  31.25 
 
 		 1931 aa  47  0.001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.21259 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>