More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_04095 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_04095  putative TonB-linked outer membrane receptor  100 
 
 		 767 aa  1568    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.221249  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3315  TonB-dependent receptor, plug  29.85 
 
 		 781 aa  338  2.9999999999999997e-91  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1453  TonB-dependent receptor  29.39 
 
 		 798 aa  336  7e-91  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.545362  normal  0.722557 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4269  TonB-dependent receptor, plug  29.28 
 
 		 797 aa  331  3e-89  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5346  TonB-dependent receptor plug  29.27 
 
 		 763 aa  313  1e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0259  TonB-linked outer membrane receptor  29.07 
 
 		 782 aa  308  3e-82  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1428  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 791 aa  297  4e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000022223  normal  0.0329458 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3179  TonB-dependent receptor, plug  30.15 
 
 		 788 aa  285  3.0000000000000004e-75  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2516  TonB-dependent receptor plug  28.59 
 
 		 772 aa  281  5e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.839663  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3755  tonB-linked outer membrane receptor P92  27.17 
 
 		 799 aa  280  6e-74  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0688  TonB-dependent receptor plug  27.59 
 
 		 1117 aa  268  4e-70  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.850484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2028  TonB family protein  27.38 
 
 		 960 aa  263  1e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.38309 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0621  TonB-dependent receptor plug  27.61 
 
 		 713 aa  248  3e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4071  TonB-dependent receptor  26.75 
 
 		 792 aa  244  6e-63  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1669  TonB-dependent receptor plug  25.31 
 
 		 823 aa  210  8e-53  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.306127 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0928  TonB-dependent receptor, plug  24.26 
 
 		 750 aa  78.2  0.0000000000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.228004  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4561  TonB-dependent receptor  27.91 
 
 		 824 aa  74.7  0.000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0251417  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0121  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 760 aa  73.9  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2204  TonB-dependent receptor  25 
 
 		 845 aa  70.5  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.316106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2398  TonB-dependent receptor plug  28.14 
 
 		 932 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0256  ferric siderophore receptor  21.72 
 
 		 807 aa  69.3  0.0000000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.027165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2580  TonB-dependent receptor  24.81 
 
 		 836 aa  68.2  0.0000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3424  TonB-dependent receptor  29.63 
 
 		 815 aa  67.4  0.0000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.053865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5636  TonB-dependent receptor  28.63 
 
 		 793 aa  67  0.000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.734932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1487  TonB-dependent receptor  24.42 
 
 		 958 aa  67  0.000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0464  TonB-dependent receptor plug  27.2 
 
 		 748 aa  66.2  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2886  putative outer membrane associated TonB dependent receptor  39.33 
 
 		 618 aa  65.9  0.000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0141972  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5776  TonB-dependent receptor  26.81 
 
 		 779 aa  65.5  0.000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1095  TonB-dependent receptor plug  27.4 
 
 		 747 aa  65.1  0.000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.189088  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3588  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 986 aa  64.7  0.000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00353353  hitchhiker  0.00053116 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0363  TonB-dependent receptor plug  24.02 
 
 		 649 aa  64.3  0.000000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  29.22 
 
 		 988 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0350  TonB-dependent receptor  24.02 
 
 		 651 aa  63.2  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.513607  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1167  TonB-dependent receptor plug  30.59 
 
 		 1071 aa  63.2  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2435  TonB-dependent receptor  27.85 
 
 		 1175 aa  63.2  0.00000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00485426  normal  0.906508 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1968  TonB-dependent receptor  21.97 
 
 		 828 aa  62.4  0.00000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0569  TonB-dependent receptor  23.45 
 
 		 778 aa  62  0.00000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.147079 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2153  TonB-dependent receptor  23.34 
 
 		 828 aa  62  0.00000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.453581  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2368  TonB-dependent receptor, plug  24.41 
 
 		 617 aa  61.6  0.00000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.848515  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0176  TonB-dependent receptor  28.64 
 
 		 763 aa  61.2  0.00000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  32.5 
 
 		 1086 aa  60.5  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0736  TonB-dependent receptor, plug  24.88 
 
 		 942 aa  60.1  0.0000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.877946  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1493  hypothetical protein  24.5 
 
 		 891 aa  60.1  0.0000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.208362 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3133  TonB-dependent siderophore receptor  26.89 
 
 		 776 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.989614  normal  0.593866 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1139  TonB-dependent receptor plug  36.17 
 
 		 1064 aa  59.3  0.0000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.278361  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4146  TonB-dependent receptor  26.48 
 
 		 961 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0960595  normal  0.432652 
 
 
-
 
NC_002950  PG0707  TonB-dependent receptor, putative  22.92 
 
 		 848 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000125429 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3462  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 668 aa  59.3  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2320  TonB-dependent receptor  26.72 
 
 		 947 aa  58.9  0.0000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.500689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1875  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 		 681 aa  58.9  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2020  TonB-dependent receptor, plug  28.7 
 
 		 1005 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4169  TonB-dependent receptor  29.65 
 
 		 1094 aa  59.3  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1121  TonB-dependent receptor plug  28.9 
 
 		 1003 aa  59.3  0.0000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3545  TonB-dependent receptor  24.14 
 
 		 666 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3613  TonB-dependent receptor plug  24.14 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.659898  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0628  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 975 aa  58.5  0.0000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3164  TonB-dependent receptor plug  29 
 
 		 1093 aa  58.5  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1314  TonB-dependent receptor  22.83 
 
 		 735 aa  58.5  0.0000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3572  TonB-dependent receptor plug  26.52 
 
 		 653 aa  58.5  0.0000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.102808  normal  0.0129675 
 
 
-
 
NC_004310  BR1347  iron compound TonB-dependent receptor, putative  29.32 
 
 		 620 aa  58.2  0.0000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6129  TonB-dependent receptor plug  24.5 
 
 		 721 aa  58.5  0.0000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0250  TonB-dependent receptor plug  24.68 
 
 		 597 aa  58.5  0.0000005  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6880  TonB-dependent receptor plug  29.41 
 
 		 1081 aa  58.2  0.0000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0740093  normal  0.354898 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1560  TonB-dependent receptor  32.61 
 
 		 1049 aa  58.2  0.0000006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2472  TonB-dependent receptor  24.66 
 
 		 1004 aa  57.8  0.0000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0192  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  27.81 
 
 		 631 aa  57.8  0.0000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.051851  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5926  TonB-dependent receptor  24.47 
 
 		 924 aa  57.8  0.0000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.61038 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2282  TonB-dependent siderophore receptor  25.28 
 
 		 809 aa  57.8  0.0000007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.664141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5203  TonB-dependent receptor  30.51 
 
 		 1004 aa  57.8  0.0000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00178942  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1897  TonB-dependent receptor plug  27.06 
 
 		 1102 aa  57.4  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.734415  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2720  iron complex outermembrane recepter protein  30.3 
 
 		 631 aa  57.4  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.83965  normal  0.415567 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0895  TonB-dependent receptor plug  27.98 
 
 		 806 aa  57  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0122  TonB-dependent receptor  29.14 
 
 		 624 aa  57  0.000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4483  TonB-dependent receptor  25.11 
 
 		 737 aa  57.4  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.00000231942  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01815  TonB-dependent receptor  25.48 
 
 		 927 aa  57  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1096  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 626 aa  57  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0745  TonB-dependent receptor, plug  25.38 
 
 		 758 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3505  outer membrane insertion C-terminal signal  25.38 
 
 		 758 aa  57  0.000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1567  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 780 aa  57.4  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0615105  normal  0.74927 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1012  TonB-dependent receptor  26.87 
 
 		 626 aa  57  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0336  TonB-dependent receptor  22.92 
 
 		 649 aa  56.6  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3340  TonB-dependent receptor, plug  26.58 
 
 		 613 aa  56.6  0.000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0198  vitamin B12/cobalamin outer membrane transporter  32.63 
 
 		 631 aa  56.2  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0194454  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1405  TonB-dependent receptor, plug  31.03 
 
 		 993 aa  56.2  0.000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00000855387  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4223  TonB-dependent receptor plug  27.75 
 
 		 1012 aa  56.2  0.000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.000000201846  normal  0.958019 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1306  putative iron compound TonB-dependent receptor  28.57 
 
 		 697 aa  56.2  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3573  TonB-dependent receptor plug  25.38 
 
 		 758 aa  56.6  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01250  TonB-dependent receptor  22.94 
 
 		 882 aa  56.2  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5579  TonB-dependent siderophore receptor  21.48 
 
 		 812 aa  56.2  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.761851 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1925  TonB-dependent receptor  26.7 
 
 		 642 aa  55.8  0.000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.55144  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7043  TonB-dependent receptor plug  28.1 
 
 		 1189 aa  55.8  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01565  putative TonB-dependent receptor  25.2 
 
 		 874 aa  55.8  0.000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0773704  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1459  TonB-dependent receptor  29.02 
 
 		 647 aa  55.8  0.000003  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.208108  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3695  outer membrane insertion C-terminal signal  25.38 
 
 		 758 aa  55.8  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.122908 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1447  TonB-dependent receptor  29.67 
 
 		 632 aa  55.5  0.000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1460  TonB-dependent receptor  24.67 
 
 		 1189 aa  55.5  0.000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.198313 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2764  TonB-dependent receptor plug  26.69 
 
 		 1103 aa  55.5  0.000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.533832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4671  TonB-dependent receptor, plug  27.33 
 
 		 1111 aa  55.5  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.505858  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0782  TonB-dependent receptor, plug  28.18 
 
 		 1043 aa  55.1  0.000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2403  hypothetical protein  32.98 
 
 		 848 aa  55.1  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  0.265597 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>