More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4526 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  86.48 
 
 		 481 aa  798    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  100 
 
 		 468 aa  934    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 1014 aa  366  1e-100  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  46.07 
 
 		 618 aa  342  1e-92  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  41.54 
 
 		 966 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  43.87 
 
 		 948 aa  309  5e-83  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 493 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  43.2 
 
 		 493 aa  307  2.0000000000000002e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  42.12 
 
 		 973 aa  307  3e-82  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  42.21 
 
 		 973 aa  297  2e-79  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  41.42 
 
 		 973 aa  297  3e-79  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  42.7 
 
 		 948 aa  295  9e-79  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  39.74 
 
 		 921 aa  259  7e-68  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  42.64 
 
 		 502 aa  259  1e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  37.92 
 
 		 950 aa  257  3e-67  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  37.58 
 
 		 877 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.63 
 
 		 950 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  38.7 
 
 		 1010 aa  254  2.0000000000000002e-66  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  39.43 
 
 		 972 aa  253  6e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 591 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  38.21 
 
 		 591 aa  241  1e-62  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  38.84 
 
 		 953 aa  242  1e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  38.43 
 
 		 601 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  38.18 
 
 		 658 aa  239  6.999999999999999e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  36.66 
 
 		 1001 aa  239  1e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  36.85 
 
 		 961 aa  237  3e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  35.71 
 
 		 922 aa  233  6e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  38.65 
 
 		 601 aa  232  1e-59  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.62 
 
 		 928 aa  231  2e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  37.04 
 
 		 959 aa  230  4e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  35.38 
 
 		 490 aa  228  2e-58  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  36.73 
 
 		 954 aa  227  3e-58  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  34.7 
 
 		 956 aa  223  4e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  37.23 
 
 		 946 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  35.2 
 
 		 906 aa  220  5e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  32.97 
 
 		 504 aa  206  9e-52  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  35.42 
 
 		 901 aa  187  4e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  37.63 
 
 		 1050 aa  180  5.999999999999999e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  38.89 
 
 		 1092 aa  173  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  38.07 
 
 		 1102 aa  172  1e-41  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  38.44 
 
 		 886 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  39.31 
 
 		 781 aa  171  3e-41  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  37.09 
 
 		 1058 aa  168  2e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  37.03 
 
 		 1017 aa  166  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  37.04 
 
 		 1085 aa  164  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  37.7 
 
 		 1049 aa  164  2.0000000000000002e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  38.34 
 
 		 1066 aa  164  4.0000000000000004e-39  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  37.08 
 
 		 1042 aa  164  4.0000000000000004e-39  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.72 
 
 		 1137 aa  163  7e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  38.72 
 
 		 1119 aa  163  8.000000000000001e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  40.8 
 
 		 765 aa  162  1e-38  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  37.13 
 
 		 1087 aa  162  1e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  38.69 
 
 		 1085 aa  162  1e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  36.39 
 
 		 824 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  36.26 
 
 		 999 aa  161  2e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  40.24 
 
 		 1055 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  36.34 
 
 		 1125 aa  162  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  38.34 
 
 		 775 aa  161  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.91 
 
 		 1227 aa  160  4e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  39.18 
 
 		 1093 aa  159  1e-37  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  38.68 
 
 		 1056 aa  159  1e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.78 
 
 		 882 aa  157  3e-37  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  34.6 
 
 		 1097 aa  156  6e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  35.6 
 
 		 701 aa  156  8e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  36.53 
 
 		 1058 aa  155  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  37.72 
 
 		 1141 aa  153  5.9999999999999996e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  27.86 
 
 		 888 aa  152  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  36.99 
 
 		 1060 aa  151  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  38.98 
 
 		 960 aa  151  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  37.82 
 
 		 887 aa  152  2e-35  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  37.36 
 
 		 1103 aa  150  5e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1995  transcriptional regulator, winged helix family  38.07 
 
 		 878 aa  149  1.0000000000000001e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  34.73 
 
 		 818 aa  148  2.0000000000000003e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  36.14 
 
 		 792 aa  147  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  38.48 
 
 		 1158 aa  147  4.0000000000000006e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  36.09 
 
 		 1049 aa  146  6e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4962  transcriptional activator domain-containing protein  32.37 
 
 		 1018 aa  145  2e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  0.0162607 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  37.24 
 
 		 840 aa  144  3e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  34.45 
 
 		 827 aa  144  4e-33  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4666  transcriptional regulator, winged helix family  38.87 
 
 		 1100 aa  143  7e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0465391  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1121  transcriptional regulator, winged helix family  35.88 
 
 		 1060 aa  142  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.225478  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  33.42 
 
 		 943 aa  141  1.9999999999999998e-32  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3102  winged helix family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 1034 aa  141  3e-32  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.306498  normal  0.034161 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  36.39 
 
 		 916 aa  140  4.999999999999999e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  34.35 
 
 		 799 aa  140  6e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  34.77 
 
 		 957 aa  139  1e-31  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  37 
 
 		 952 aa  139  1e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.68 
 
 		 1110 aa  139  1e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  36.42 
 
 		 760 aa  139  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1038  ATPase-like protein  37.08 
 
 		 1036 aa  137  4e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.676249  normal  0.10477 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1621  transcriptional activator domain protein  33.04 
 
 		 1064 aa  136  6.0000000000000005e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.77523  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2022  transcriptional regulator  34.81 
 
 		 1161 aa  136  7.000000000000001e-31  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.899246 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  37.82 
 
 		 938 aa  136  9e-31  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  33.83 
 
 		 1082 aa  135  9.999999999999999e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  31.73 
 
 		 816 aa  135  9.999999999999999e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3338  transcriptional regulator, LuxR family  36.2 
 
 		 919 aa  135  1.9999999999999998e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.682048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_22020  predicted ATPase  34.55 
 
 		 1131 aa  135  1.9999999999999998e-30  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4657  transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 1076 aa  134  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>