More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_6123 on replicon NC_010512
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008060  Bcen_1308  transcriptional regulator  98.38 
 
 		 493 aa  967    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6521  transcriptional regulator  98.38 
 
 		 493 aa  967    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0681996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6123  transcriptional regulator  100 
 
 		 493 aa  991    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6136  transcriptional regulator, winged helix family  51.04 
 
 		 1014 aa  415  9.999999999999999e-116  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2380  transcriptional regulator  49.58 
 
 		 618 aa  409  1e-113  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.341118  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7016  transcriptional regulator  44.33 
 
 		 973 aa  367  1e-100  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.252317  normal  0.0265916 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6350  transcriptional regulator  44.28 
 
 		 973 aa  364  2e-99  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00620791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5717  transcriptional regulator  44.4 
 
 		 973 aa  350  3e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5826  transcriptional regulator  46.53 
 
 		 948 aa  349  6e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5609  transcriptional regulator  46.09 
 
 		 948 aa  348  1e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0160081  normal  0.519557 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1232  transcriptional regulator  44.08 
 
 		 481 aa  325  1e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5597  transcriptional regulator  42.62 
 
 		 591 aa  319  7e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.354046  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5813  transcriptional regulator  42.74 
 
 		 591 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.183605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1479  transcriptional regulator  45.39 
 
 		 502 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5719  transcriptional regulator  40.17 
 
 		 966 aa  313  4.999999999999999e-84  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_7033  transcriptional regulator  44.04 
 
 		 601 aa  313  5.999999999999999e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00572019  normal  0.346224 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4526  transcriptional regulator  43.86 
 
 		 468 aa  309  6.999999999999999e-83  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1462  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6366  transcriptional regulator  43.82 
 
 		 601 aa  304  3.0000000000000004e-81  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6123  transcriptional regulator, winged helix family  40.74 
 
 		 1010 aa  303  6.000000000000001e-81  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1892  transcriptional regulator  40.8 
 
 		 972 aa  301  1e-80  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.642884  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5187  transcriptional regulator, winged helix family  38.38 
 
 		 950 aa  301  2e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4972  transcriptional regulator  41.72 
 
 		 877 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.36225  normal  0.311827 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5711  transcriptional regulator  41.31 
 
 		 658 aa  295  2e-78  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.591372 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6834  transcriptional regulator, winged helix family  40.58 
 
 		 921 aa  292  7e-78  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.037754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2376  transcriptional regulator  39.96 
 
 		 1001 aa  291  2e-77  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5714  transcriptional regulator  35.29 
 
 		 950 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.140329 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1958  transcriptional regulator  36.18 
 
 		 928 aa  244  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2391  transcriptional regulator  39.2 
 
 		 954 aa  244  1.9999999999999999e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.814373 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2248  transcriptional regulator  34.45 
 
 		 959 aa  241  2e-62  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6167  transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 961 aa  240  4e-62  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1207  transcriptional regulator  38.74 
 
 		 922 aa  233  4.0000000000000004e-60  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.598339  normal  0.808052 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1957  transcriptional regulator  33.83 
 
 		 490 aa  232  1e-59  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2185  transcriptional regulator, winged helix family  35.23 
 
 		 956 aa  229  9e-59  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5401  transcriptional regulator, winged helix family  36.26 
 
 		 906 aa  223  6e-57  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5408  transcriptional regulator, winged helix family  35 
 
 		 953 aa  204  2e-51  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.17847  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6694  transcriptional regulator, winged helix family  32.43 
 
 		 504 aa  203  7e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.795253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0836  ATPase-like protein  39.23 
 
 		 1017 aa  198  2.0000000000000003e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.748531  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4035  transcriptional regulator, winged helix family  33.62 
 
 		 946 aa  197  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5928  regulatory protein, LuxR  35.78 
 
 		 1085 aa  196  1e-48  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.9439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12510  LuxR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 1137 aa  189  7e-47  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000380393  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5402  transcriptional regulator, winged helix family  37.25 
 
 		 901 aa  187  3e-46  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6897  ATPase-like protein  35.78 
 
 		 1125 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.326913  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6264  transcriptional regulator, winged helix family  35.24 
 
 		 1066 aa  185  1.0000000000000001e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.616915  normal  0.333942 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2737  transcriptional activator domain-containing protein  35.22 
 
 		 1102 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.247337  normal  0.588178 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2859  transcriptional activator domain protein  33.94 
 
 		 999 aa  184  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7942  protein kinase  33.53 
 
 		 824 aa  182  9.000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0829  ATPase-like protein  36.43 
 
 		 1092 aa  179  7e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10391  LuxR family transcriptional regulator  33.59 
 
 		 1085 aa  179  1e-43  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000074536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5260  transcriptional regulator, winged helix family  37.2 
 
 		 1093 aa  176  6e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1025  ATPase-like protein  37.16 
 
 		 1055 aa  176  7e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0472281  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1372  transcriptional regulator, winged helix family  37.8 
 
 		 1227 aa  174  2.9999999999999996e-42  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291577  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2946  LuxR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 781 aa  174  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2409  transcriptional activator domain protein  35.54 
 
 		 1119 aa  173  5e-42  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00237404 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4552  transcriptional regulator  36.52 
 
 		 1043 aa  173  6.999999999999999e-42  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.01867 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11389  transcriptional regulator  38.05 
 
 		 887 aa  172  2e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6865  ATPase-like protein  34.13 
 
 		 701 aa  171  3e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.776799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_35430  predicted ATPase  35.68 
 
 		 1060 aa  170  5e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1685  transcriptional regulator, winged helix family  35.65 
 
 		 943 aa  170  6e-41  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2066  transcriptional regulator, winged helix family  34.96 
 
 		 1058 aa  169  7e-41  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4166  transcriptional regulator, winged helix family  34.41 
 
 		 1049 aa  169  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.497343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6374  transcriptional regulator, winged helix family  35.45 
 
 		 1042 aa  169  1e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10909  LuxR family transcriptional regulator  38.1 
 
 		 882 aa  168  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8855  ATPase-like protein  33.82 
 
 		 1050 aa  167  4e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0635929  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6027  ATPase-like protein  35.43 
 
 		 960 aa  164  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.833811  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1825  transcriptional regulator, LuxR family  34.4 
 
 		 886 aa  162  1e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.125686  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1634  transcriptional regulator, winged helix family  30.97 
 
 		 1058 aa  161  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.453274  normal  0.125292 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0191  LuxR family transcriptional regulator  33.24 
 
 		 775 aa  162  2e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.563436 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5141  ATPase-like protein  34.66 
 
 		 1072 aa  161  2e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.101031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10913  LuxR family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 393 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1124  transcriptional regulator, XRE family  30.36 
 
 		 816 aa  161  3e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3667  ATPase-like protein  34.3 
 
 		 916 aa  160  4e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0201834  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1516  Tetratricopeptide TPR_4  34.29 
 
 		 840 aa  160  5e-38  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00950559  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2284  transcriptional regulator  34.53 
 
 		 952 aa  160  6e-38  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6790  ATPase-like protein  33.1 
 
 		 1087 aa  160  6e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22368  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1996  transcriptional regulator, winged helix family  35.79 
 
 		 1141 aa  155  2e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.942344  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5782  ATPase-like protein  33.95 
 
 		 1103 aa  155  2e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.493959  normal  0.0341342 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1059  ATPase-like protein  35.24 
 
 		 760 aa  154  5e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.183433 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2207  XRE family transcriptional regulator  31.27 
 
 		 901 aa  153  5.9999999999999996e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2819  ATPase-like protein  32.21 
 
 		 776 aa  152  1e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.537271 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3609  transcriptional regulator, LuxR family  30.6 
 
 		 818 aa  152  1e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2036  ATPase-like protein  36.78 
 
 		 1110 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.856154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3003  protein kinase  30.71 
 
 		 792 aa  150  4e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2572  transcriptional regulator, winged helix family  31.86 
 
 		 957 aa  150  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.526288  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0757  TPR repeat-containing regulatory protein LuxR  32.55 
 
 		 799 aa  149  8e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7258  protein kinase  32.41 
 
 		 1056 aa  149  9e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.235738  normal  0.516211 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0394  transcriptional regulator, winged helix family  33.73 
 
 		 1049 aa  149  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0992  LuxR family transcriptional regulator  33.79 
 
 		 814 aa  148  2.0000000000000003e-34  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1442  transcriptional regulator  27.75 
 
 		 888 aa  148  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.31533  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3711  transcriptional regulator, LuxR family  32.55 
 
 		 765 aa  147  5e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.132318  normal  0.304738 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1585  transcriptional regulator  30.96 
 
 		 980 aa  147  5e-34  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.79609  normal  0.0274178 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0758  regulatory protein, LuxR  32.05 
 
 		 827 aa  147  6e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3216  transcriptional regulator, LuxR family  33.26 
 
 		 931 aa  146  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0908309  hitchhiker  0.000000189217 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1145  TPR repeat-containing protein  30.05 
 
 		 736 aa  146  1e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4464  LuxR family transcriptional regulator  30.55 
 
 		 1082 aa  145  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0122059 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1468  transcriptional regulator, winged helix family  31.8 
 
 		 969 aa  145  2e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.119057  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5616  transcriptional regulator, winged helix family  33.89 
 
 		 1097 aa  144  5e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.00878101  normal  0.0410106 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1245  transcriptional regulator, winged helix family  35.47 
 
 		 1158 aa  141  3e-32  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.275106  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2154  two component transcriptional regulator  27.89 
 
 		 975 aa  140  3.9999999999999997e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000789084  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8841  ATPase-like protein  33.59 
 
 		 951 aa  140  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.179034 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>