134 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_4710 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_4710  integrin-like protein  100 
 
 		 604 aa  1191    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1387  integrin-like protein  46.04 
 
 		 1490 aa  437  1e-121  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.051369 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0385  integrin like protein  35.95 
 
 		 974 aa  226  1e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.459486 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2980  integrin-like protein  41.35 
 
 		 1126 aa  190  5.999999999999999e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.16679  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4018  integrin-like protein  32.45 
 
 		 1275 aa  189  2e-46  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0601  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.35 
 
 		 1118 aa  170  7e-41  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4498  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.6 
 
 		 1225 aa  167  5e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1772  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.11 
 
 		 1340 aa  161  4e-38  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1906  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.03 
 
 		 2194 aa  157  4e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1773  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  37.39 
 
 		 889 aa  156  9e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.403539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0657  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  40.06 
 
 		 1113 aa  156  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0893942  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4497  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  39.08 
 
 		 1222 aa  152  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2319  FG-GAP repeat-containing protein  37.57 
 
 		 2807 aa  152  2e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1560  VCBS  34.55 
 
 		 1838 aa  150  8e-35  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.431864  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0582  Integrins alpha chain  36.42 
 
 		 1019 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6310  FG-GAP repeat protein  33.13 
 
 		 828 aa  142  1.9999999999999998e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0666  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  35.71 
 
 		 891 aa  125  3e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0591  FG-GAP  33.94 
 
 		 813 aa  122  1.9999999999999998e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.41506  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3936  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  32.76 
 
 		 1009 aa  118  3e-25  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  unclonable  0.00889284  hitchhiker  0.000639264 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0460  integrin-like protein  30.52 
 
 		 1124 aa  113  8.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.849275 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1928  FG-GAP repeat-containing protein  29.24 
 
 		 872 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1897  Nidogen, extracellular region  30.66 
 
 		 1557 aa  109  1e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4093  integrin-like protein  31.23 
 
 		 494 aa  108  3e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.588322 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1355  hypothetical protein  33.25 
 
 		 1638 aa  104  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2386  FG-GAP repeat protein  31.71 
 
 		 657 aa  97.4  7e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0794745  decreased coverage  0.00143024 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0599  Na-Ca exchanger/integrin-beta4  31.86 
 
 		 1012 aa  96.7  1e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0387425  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0620  FG-GAP repeat-containing protein  33.33 
 
 		 412 aa  95.5  2e-18  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.146794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3793  FG-GAP repeat protein  32.84 
 
 		 616 aa  94  7e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.361837  normal  0.627526 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1597  hypothetical protein  32.11 
 
 		 1289 aa  92.4  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2273  integrin-like protein  34.9 
 
 		 472 aa  90.9  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.328252  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0616  FG-GAP repeat-containing protein  32.42 
 
 		 386 aa  89.7  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.0513696  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2274  integrin-like protein  29.93 
 
 		 469 aa  85.9  0.000000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.474236  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  30.74 
 
 		 3197 aa  85.9  0.000000000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1450  hemolysin-type calcium-binding region  28.1 
 
 		 917 aa  84  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0841616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1026  C-type lectin  29.97 
 
 		 4379 aa  82.8  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4500  Collagen triple helix repeat protein  30.32 
 
 		 685 aa  81.6  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.491219  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1814  FG-GAP repeat-containing protein  27.19 
 
 		 554 aa  80.5  0.00000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000122942  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3964  hypothetical protein  29.51 
 
 		 940 aa  79.7  0.0000000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.820547  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3594  integrin-like protein  28.61 
 
 		 485 aa  79.3  0.0000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  29.69 
 
 		 3197 aa  79.3  0.0000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3359  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.62 
 
 		 1154 aa  77.4  0.0000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.324183  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3459  YD repeat-containing protein  28.52 
 
 		 3193 aa  75.9  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2038  FG-GAP  28.08 
 
 		 690 aa  74.7  0.000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0466844 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0727  Integrins alpha chain  29.97 
 
 		 447 aa  72.8  0.00000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000587794  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1405  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  27.89 
 
 		 959 aa  72  0.00000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2037  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  26.9 
 
 		 1372 aa  70.5  0.0000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.884942  normal  0.0586303 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2872  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.27 
 
 		 621 aa  69.7  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0893  Collagen triple helix repeat protein  27.61 
 
 		 644 aa  65.9  0.000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.216124  normal  0.507094 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1094  putative outer membrane adhesin like proteiin  32.52 
 
 		 11716 aa  65.5  0.000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.511917 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3628  FG-GAP repeat protein  25.98 
 
 		 829 aa  65.1  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1540  putative lipoprotein  26.96 
 
 		 404 aa  63.2  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.402667  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1682  TPR repeat-containing protein  33.2 
 
 		 1127 aa  63.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.592663 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3449  Collagen triple helix repeat protein  31.96 
 
 		 663 aa  62.4  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.344079  normal  0.0780597 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2327  FG-GAP repeat-containing protein  28.74 
 
 		 803 aa  62.8  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.50278  decreased coverage  0.00347389 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2778  Integrins alpha chain  27.08 
 
 		 409 aa  61.6  0.00000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3980  FG-GAP repeat protein  31.18 
 
 		 1126 aa  60.8  0.00000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0419563  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1438  ASPIC/UnbV domain protein  26.52 
 
 		 593 aa  60.8  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0487  hypothetical protein  28.46 
 
 		 438 aa  60.5  0.00000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.153415 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4246  hemolysin-type calcium-binding region  30.53 
 
 		 539 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3776  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.69 
 
 		 635 aa  58.9  0.0000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1751  PpiC-type peptidyl-prolyl cis-trans isomerase  28.61 
 
 		 737 aa  58.5  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.830192  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4420  hypothetical protein  24.45 
 
 		 912 aa  58.2  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0816667  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0493  FG-GAP repeat-containing protein  29.49 
 
 		 437 aa  57  0.0000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.27359 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3038  hypothetical protein  28.64 
 
 		 524 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.110831 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2324  ASPIC/UnbV domain-containing protein  29.63 
 
 		 1114 aa  55.8  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00426991 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2398  FG-GAP repeat-containing protein  26.27 
 
 		 417 aa  55.1  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.276606  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1458  FG-GAP repeat protein  26.62 
 
 		 510 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.664188  normal  0.305041 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3318  Integrins alpha chain  24.69 
 
 		 456 aa  55.1  0.000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.893609  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4971  peptidase-like  27.4 
 
 		 3041 aa  55.1  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0518  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.44 
 
 		 1193 aa  54.7  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.966806  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0216  FG-GAP repeat protein  32.17 
 
 		 837 aa  54.7  0.000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.560181  normal  0.665127 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1753  ASPIC/UnbV domain protein  27.43 
 
 		 577 aa  54.3  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7267  Ribosomal protein L7/L12  25.74 
 
 		 523 aa  54.3  0.000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0341647  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0490  ASPIC/UnbV domain-containing protein  30.3 
 
 		 1225 aa  54.3  0.000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.319917  normal  0.247742 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4177  hypothetical protein  26.94 
 
 		 517 aa  54.3  0.000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.229175  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6727  ASPIC/UnbV domain protein  23.81 
 
 		 1109 aa  53.5  0.000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000293093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0319  ASPIC/UnbV  25.7 
 
 		 649 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0713421  normal  0.920136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0425  hypothetical protein  24.93 
 
 		 569 aa  53.5  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.324197  normal  0.0116192 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1256  FG-GAP repeat protein  29.07 
 
 		 590 aa  53.1  0.00002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0391687  normal  0.0156226 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2320  FG-GAP repeat-containing protein  24.14 
 
 		 437 aa  52.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0600513  normal  0.0195588 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3201  ASPIC/UnbV domain-containing protein  26.71 
 
 		 1226 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.949082  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3233  ASPIC/UnbV domain-containing protein  31.91 
 
 		 1189 aa  52.4  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.017854 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0824  ASPIC/UnbV  28.87 
 
 		 556 aa  52  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.853245 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1747  ASPIC/UnbV domain protein  30.74 
 
 		 574 aa  52.4  0.00003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00200  hypothetical protein  26.64 
 
 		 655 aa  51.6  0.00004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.846168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4738  ASPIC/UnbV domain protein  30.57 
 
 		 1127 aa  51.6  0.00004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.411918 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3029  ASPIC/UnbV domain protein  26.02 
 
 		 1088 aa  51.2  0.00005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0208708  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5056  ASPIC/UnbV domain protein  25.8 
 
 		 1113 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.841506 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2415  FG-GAP repeat protein  28.07 
 
 		 720 aa  50.4  0.00009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.326973  decreased coverage  0.00154212 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0137  Integrins alpha chain  26.56 
 
 		 2497 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1842  hypothetical protein  41 
 
 		 161 aa  49.7  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0920  ASPIC/UnbV  31.34 
 
 		 604 aa  49.3  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.185124  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0982  peptidase M10A and M12B matrixin and adamalysin  26.86 
 
 		 470 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.768142  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0491  ASPIC/UnbV domain-containing protein  28.67 
 
 		 1236 aa  49.3  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.115917 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0919  ASPIC/UnbV  26.83 
 
 		 583 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.480457  normal  0.0168128 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1690  integrin-like protein  25.1 
 
 		 562 aa  48.9  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0343612 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4186  hypothetical protein  27.61 
 
 		 760 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394785 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4948  ASPIC/UnbV domain protein  25 
 
 		 1183 aa  48.9  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.571754  normal  0.80828 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1373  integrins alpha chain  29.83 
 
 		 1976 aa  48.5  0.0004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1759  ASPIC/UnbV domain protein  35.29 
 
 		 1098 aa  48.5  0.0004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.208023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>