More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_0213 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_0213  TonB family protein  100 
 
 		 668 aa  1367    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.110035 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6188  TonB family protein  30.56 
 
 		 804 aa  184  5.0000000000000004e-45  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3381  TonB family protein  31.97 
 
 		 506 aa  184  5.0000000000000004e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4086  TonB family protein  67.94 
 
 		 156 aa  183  7e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3382  TonB family protein  28.57 
 
 		 604 aa  179  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2591  TonB family protein  57.64 
 
 		 275 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0507337  normal  0.083991 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07981  TonB  35.19 
 
 		 467 aa  157  5.0000000000000005e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.347175  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0781  TonB family protein  34.2 
 
 		 583 aa  151  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0709932  normal  0.241171 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6187  TonB family protein  29 
 
 		 472 aa  146  1e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5090  TonB family protein  44.6 
 
 		 274 aa  125  4e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00113498  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5967  peptidase M56 BlaR1  28.07 
 
 		 621 aa  124  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.627257 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4058  TonB family protein  53.47 
 
 		 274 aa  123  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000345217  hitchhiker  0.000000306076 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3521  TonB family protein  43.51 
 
 		 276 aa  116  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.753479  normal  0.753854 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1363  peptidase M56, BlaR1  49.53 
 
 		 379 aa  115  2.0000000000000002e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6521  TonB family protein  24.83 
 
 		 413 aa  115  4.0000000000000004e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.829855  normal  0.244151 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4940  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 583 aa  112  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.958869 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4418  TonB family protein  48.54 
 
 		 484 aa  110  9.000000000000001e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3522  TonB family protein  47.22 
 
 		 150 aa  110  1e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.728346  normal  0.937405 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0490  TonB family protein  47.66 
 
 		 267 aa  109  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2771  peptidase M56, BlaR1  30 
 
 		 515 aa  108  3e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0768816  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2769  peptidase M56, BlaR1  29.84 
 
 		 601 aa  107  7e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.158209  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1836  peptidase M56 BlaR1  27.42 
 
 		 524 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2185  transporter, putative  37.16 
 
 		 438 aa  105  2e-21  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5135  peptidase M56 BlaR1  27 
 
 		 529 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0670655  normal  0.0929527 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3658  TonB family protein  49.47 
 
 		 489 aa  103  8e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0517319 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1288  peptidase M56 BlaR1  28.57 
 
 		 647 aa  102  2e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.778723  normal  0.21473 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07465  hypothetical protein  27.82 
 
 		 563 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4417  TonB family protein  40.34 
 
 		 485 aa  99.8  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338173  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3523  TonB family protein  44.79 
 
 		 143 aa  99.4  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.661805  normal  0.93961 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07781  hypothetical protein  31.06 
 
 		 624 aa  98.2  4e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0008  hypothetical protein  45.19 
 
 		 172 aa  96.7  1e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0223  hypothetical protein  38.03 
 
 		 276 aa  95.5  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.136098  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5378  TonB family protein  40.18 
 
 		 156 aa  94.7  4e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3430  peptidase M56 BlaR1  27.56 
 
 		 447 aa  92.4  2e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1470  TonB family protein  41.44 
 
 		 279 aa  93.2  2e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1429  TonB family protein  45.1 
 
 		 279 aa  92  3e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.369951  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0785  tonB protein, putative  39.09 
 
 		 230 aa  91.7  4e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5150  TonB family protein  34.81 
 
 		 288 aa  90.5  8e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10123  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3210  peptidase M56, BlaR1  27.52 
 
 		 672 aa  89  2e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2416  TonB family protein  41.84 
 
 		 222 aa  87  0.000000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.738112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0606  TonB family protein  34.86 
 
 		 325 aa  84.7  0.000000000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0419  tonB-related protein  39 
 
 		 143 aa  82.4  0.00000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0930  TonB family protein  27.75 
 
 		 446 aa  81.3  0.00000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3966  TonB-dependent receptor plug  62.71 
 
 		 1150 aa  77.4  0.0000000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0876858  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1500  TonB-dependent receptor plug  50.57 
 
 		 1163 aa  76.6  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00486924  normal  0.0635458 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1008  TonB family protein  36.54 
 
 		 258 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.649476  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3538  TonB-dependent receptor plug  53.52 
 
 		 1006 aa  74.7  0.000000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.740617  normal  0.292963 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3025  TonB-dependent receptor plug  40.74 
 
 		 1128 aa  74.3  0.000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.982637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2602  TonB-dependent receptor plug  54.05 
 
 		 1008 aa  73.9  0.000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0774  TonB-dependent receptor plug  52.78 
 
 		 1181 aa  73.9  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.252982 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1281  TonB-dependent receptor plug  59.02 
 
 		 1152 aa  73.6  0.00000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0225652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0784  TonB-dependent receptor plug  48.75 
 
 		 1013 aa  72.8  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3596  TonB-dependent receptor plug  62.07 
 
 		 1059 aa  72  0.00000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2062  TonB-dependent receptor plug  41.75 
 
 		 1110 aa  72  0.00000000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.000641911  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1766  TonB-dependent receptor plug  59.38 
 
 		 1116 aa  71.2  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0232965  normal  0.0564534 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2219  TonB-dependent receptor plug  42.86 
 
 		 1106 aa  71.6  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.136302 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1589  TonB-dependent receptor plug  51.85 
 
 		 1164 aa  71.2  0.00000000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.318649 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2226  TonB-dependent receptor plug  50 
 
 		 1117 aa  71.2  0.00000000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.377553  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0710  TonB-dependent receptor plug  41.23 
 
 		 1176 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.611235  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0770  TonB-dependent receptor  58.06 
 
 		 1080 aa  70.9  0.00000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3282  TonB-dependent receptor plug  47 
 
 		 1085 aa  70.9  0.00000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.260131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3945  TonB-dependent receptor  53.62 
 
 		 1189 aa  70.9  0.00000000008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3643  TonB-dependent receptor  47.12 
 
 		 1086 aa  70.9  0.00000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.15651  normal  0.747331 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4496  TonB-dependent receptor plug  50.63 
 
 		 1031 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.567286 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0501  TonB-dependent receptor plug  51.43 
 
 		 1086 aa  70.5  0.00000000009  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00157557  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5705  TonB-dependent receptor  40.83 
 
 		 1011 aa  70.5  0.00000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.091818  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4319  TonB-dependent receptor plug  52.38 
 
 		 1071 aa  70.1  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0290506  normal  0.156669 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2600  TonB-dependent receptor plug  60.34 
 
 		 1051 aa  70.1  0.0000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.267837 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1640  TonB-dependent receptor plug  53.12 
 
 		 1105 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00000317861  normal  0.245128 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1778  TonB-dependent receptor plug  54.69 
 
 		 1039 aa  70.1  0.0000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0787  TonB-dependent receptor plug  63.16 
 
 		 1028 aa  69.3  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6286  TonB-dependent receptor plug  45.98 
 
 		 1168 aa  69.7  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0106  TonB-dependent receptor plug  53.66 
 
 		 1161 aa  69.3  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.813272 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0021  TonB-dependent receptor  51.32 
 
 		 976 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2560  TonB-dependent receptor plug  41.12 
 
 		 1062 aa  68.9  0.0000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2283  TonB-dependent receptor plug  61.4 
 
 		 1132 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00214981 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4006  TonB-dependent receptor  51.47 
 
 		 1020 aa  68.9  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.629585  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1623  TonB-dependent receptor plug  53.42 
 
 		 1120 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.21051 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5092  TonB-dependent receptor plug  52.24 
 
 		 988 aa  68.9  0.0000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.303703  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1845  TonB-dependent receptor plug  53.97 
 
 		 1128 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.430799  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6451  TonB-dependent receptor plug  58.62 
 
 		 1062 aa  68.6  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.402176  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4222  TonB-dependent receptor plug  48.75 
 
 		 1010 aa  68.9  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2273  TonB-dependent receptor plug  61.9 
 
 		 994 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4267  TonB-dependent receptor plug  47.3 
 
 		 1076 aa  68.9  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0559903  normal  0.145887 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3371  TonB-dependent receptor plug  52.11 
 
 		 1036 aa  68.6  0.0000000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3258  TonB-dependent receptor plug  51.39 
 
 		 1099 aa  68.6  0.0000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.363911  normal  0.0250929 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2292  TonB-dependent receptor plug  58.33 
 
 		 1023 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4717  TonB-dependent receptor plug  54.55 
 
 		 1155 aa  68.6  0.0000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.80065  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2015  tonB protein  35.04 
 
 		 276 aa  68.2  0.0000000005  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.138259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2710  TonB-dependent receptor plug  54.84 
 
 		 1127 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.302213  normal  0.762273 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6566  TonB-dependent receptor plug  56.67 
 
 		 1160 aa  68.2  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00225282  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6567  TonB-dependent receptor plug  42.42 
 
 		 1155 aa  68.2  0.0000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4184  TonB-dependent receptor plug  46.67 
 
 		 1042 aa  68.2  0.0000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.174164  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0343  TonB-dependent receptor plug  50.79 
 
 		 1096 aa  68.2  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.603691  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0714  TonB-dependent receptor plug  53.12 
 
 		 1124 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.232472  normal  0.99116 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4269  TonB-dependent receptor  57.81 
 
 		 1038 aa  67.8  0.0000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.927077  normal  0.139586 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1362  TonB-dependent receptor  48 
 
 		 1140 aa  67.8  0.0000000007  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5396  TonB-dependent receptor plug  54.1 
 
 		 1023 aa  67.8  0.0000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.25584 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0459  TonB family protein  35.56 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000008  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4532  TonB-dependent receptor plug  54.41 
 
 		 1053 aa  67.4  0.0000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.171577  normal  0.0460383 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>