More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4457 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4457  PKD domain containing protein  100 
 
 		 1565 aa  3071    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0890  PKD domain containing protein  41 
 
 		 2066 aa  858    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0241772  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0997  PKD domain containing protein  44.6 
 
 		 1150 aa  595  1e-168  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.014339 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_02880  PDK repeat-containing protein  42.62 
 
 		 1916 aa  554  1e-156  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1825  Fibronectin type III domain protein  37.89 
 
 		 1009 aa  409  1.0000000000000001e-112  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0101556 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0622  PKD domain containing protein  37.64 
 
 		 1057 aa  167  1.0000000000000001e-39  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.40107 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2824  PKD domain containing protein  40.33 
 
 		 734 aa  163  2e-38  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1505  Glycoside hydrolase, family 20, catalytic core  46.46 
 
 		 816 aa  160  1e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.869244  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2921  PKD domain containing protein  53.18 
 
 		 623 aa  149  3e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1014  metallophosphoesterase  42.11 
 
 		 890 aa  146  3e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.0724249 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  34.08 
 
 		 752 aa  144  1.9999999999999998e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1802  hypothetical protein  34.53 
 
 		 2036 aa  139  4e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.993129 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1990  cell surface protein  34.13 
 
 		 1842 aa  138  7.000000000000001e-31  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0402817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0724  cell surface protein  32.45 
 
 		 713 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1473  cell surface protein  34.14 
 
 		 679 aa  137  1.9999999999999998e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00112835  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1798  cell surface protein  34.4 
 
 		 1300 aa  136  3e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3605  glycosyl hydrolase family chitinase  35.53 
 
 		 792 aa  136  3.9999999999999996e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  decreased coverage  0.0000852085  hitchhiker  0.0070526 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3494  hypothetical protein  31.35 
 
 		 861 aa  135  5e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00785016  normal  0.357624 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0909  PKD domain-containing protein  37.16 
 
 		 517 aa  135  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0741281  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1478  cell surface protein  31.54 
 
 		 675 aa  135  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1800  hypothetical protein  33.6 
 
 		 2272 aa  135  7.999999999999999e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.999068 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2136  cell surface protein  35.06 
 
 		 1120 aa  134  9e-30  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.641314  normal  0.113779 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1015  PKD domain containing protein  30.77 
 
 		 943 aa  134  9e-30  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0753  PKD domain-containing protein  37.5 
 
 		 528 aa  134  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.095216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3738  putative surface layer protein  33.62 
 
 		 575 aa  134  1.0000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.576213  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1993  cell surface protein  34.2 
 
 		 1969 aa  133  3e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.147717  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2692  hypothetical protein  31.36 
 
 		 859 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.71129  normal  0.0975365 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3737  hypothetical protein  33.42 
 
 		 1682 aa  132  4.0000000000000003e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1989  cell surface protein  35.63 
 
 		 1241 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.565549  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3714  PKD domain containing protein  37.54 
 
 		 1771 aa  132  7.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.333758  normal  0.0659323 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0809  surface layer protein B  32.79 
 
 		 735 aa  132  8.000000000000001e-29  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2431  FG-GAP repeat protein  36.76 
 
 		 3197 aa  131  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1479  cell surface protein  33.43 
 
 		 669 aa  130  1.0000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2426  PKD  31.23 
 
 		 1814 aa  131  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.217586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1819  PKD domain containing protein  36.79 
 
 		 3197 aa  130  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0597  PKD  30.75 
 
 		 1862 aa  129  3e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.579359  normal  0.139276 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3575  putative surface layer protein  32.12 
 
 		 561 aa  128  7e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.840675  normal  0.236267 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0810  putative surface layer protein  33.53 
 
 		 1094 aa  128  8.000000000000001e-28  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1471  cell surface protein  32.23 
 
 		 685 aa  128  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.133477  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2427  PKD  31.38 
 
 		 2176 aa  127  1e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1423  PKD domain-containing protein  34.48 
 
 		 1361 aa  127  1e-27  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.446395  hitchhiker  0.00318568 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1472  cell surface protein  33.93 
 
 		 658 aa  127  2e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.055223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1507  hypothetical protein  39.04 
 
 		 873 aa  127  2e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.48117  hitchhiker  0.0000051412 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1995  cell surface protein  33.61 
 
 		 1882 aa  125  4e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00993075  normal  0.508368 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2117  glycosyl hydrolase family 88  40.2 
 
 		 623 aa  126  4e-27  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  31.37 
 
 		 930 aa  126  4e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  34.92 
 
 		 2122 aa  125  7e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2840  PKD  32.91 
 
 		 963 aa  125  9e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0720897 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3429  MAM protein  42.86 
 
 		 1027 aa  124  9.999999999999999e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3736  hypothetical protein  33.24 
 
 		 978 aa  124  9.999999999999999e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2783  cell surface protein  33.81 
 
 		 2000 aa  123  3e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.992151  normal  0.0101574 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1783  Carbohydrate binding family 6  34.51 
 
 		 2554 aa  123  3e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2068  Carbohydrate binding family 6  33.61 
 
 		 1356 aa  122  6e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.684202  normal  1 
 
 
-
 
NC_009939  Dgeo_3026  PKD domain-containing protein  38.49 
 
 		 552 aa  121  9.999999999999999e-26  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4394  PKD domain containing protein  31.16 
 
 		 1620 aa  119  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.133188  normal  0.147462 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0970  PKD  31.37 
 
 		 1528 aa  119  5e-25  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.290385  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1440  PKD domain-containing protein  35.42 
 
 		 460 aa  118  6.9999999999999995e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.094364  hitchhiker  0.00229761 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1810  Carbohydrate binding family 6  37.84 
 
 		 3295 aa  118  6.9999999999999995e-25  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6899  conserved repeat domain protein  31.76 
 
 		 1606 aa  118  7.999999999999999e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.776469  normal  0.805728 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4412  PKD domain containing protein  29.5 
 
 		 1602 aa  116  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0339694  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0818  PKD domain-containing protein  35.62 
 
 		 530 aa  115  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2953  peptidase M14 carboxypeptidase A  38.54 
 
 		 773 aa  114  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0628  LamG domain protein jellyroll fold domain protein  28.14 
 
 		 574 aa  114  2.0000000000000002e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3461  hypothetical protein  31.69 
 
 		 1667 aa  113  3e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0200466 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0422  PKD  29.91 
 
 		 929 aa  113  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2442  PKD  33.61 
 
 		 941 aa  113  3e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  hitchhiker  0.0000335997  normal  0.167692 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  30.7 
 
 		 958 aa  111  1e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3624  protease, putative  51.27 
 
 		 938 aa  110  2e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.00224012  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1784  Carbohydrate binding family 6  38.55 
 
 		 1732 aa  109  4e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.847863  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1907  PKD domain-containing protein  35.25 
 
 		 910 aa  109  5e-22  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1474  cell surface protein  35.83 
 
 		 581 aa  109  5e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.12576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2204  periplasmic copper-binding  32.74 
 
 		 838 aa  108  1e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.434712 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3144  hypothetical protein  34.96 
 
 		 971 aa  107  3e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0403657  normal  0.275799 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0100  PKD domain containing protein  35.74 
 
 		 1667 aa  105  6e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.107112 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1164  PKD  32.2 
 
 		 1011 aa  104  1e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2853  surface layer protein B  33.58 
 
 		 547 aa  103  3e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.0013219  hitchhiker  0.00194524 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1955  hypothetical protein  29.89 
 
 		 1282 aa  102  5e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2794  hypothetical protein  34.35 
 
 		 551 aa  101  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000111545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2918  hypothetical protein  32.27 
 
 		 791 aa  100  2e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000682782 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1627  hypothetical protein  32.47 
 
 		 615 aa  99.4  5e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1004  protease  36.75 
 
 		 918 aa  97.4  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000922392  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  31.38 
 
 		 869 aa  97.1  2e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0663  peptidase S26B, signal peptidase  33.96 
 
 		 618 aa  97.4  2e-18  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.10738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2497  PKD  33.43 
 
 		 1531 aa  96.3  4e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0721492  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5022  hypothetical protein  29.3 
 
 		 425 aa  96.7  4e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0115  lysyl endopeptidase  31.44 
 
 		 823 aa  95.1  9e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.585546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3744  peptidase M6, immune inhibitor A  36.02 
 
 		 951 aa  95.1  1e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000497616  decreased coverage  0.0000986058 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1858  PKD domain-containing protein  39.63 
 
 		 944 aa  94.7  1e-17  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1844  extracellular nuclease, putative  41.06 
 
 		 948 aa  94  2e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1622  endonuclease/exonuclease/phosphatase  37.2 
 
 		 944 aa  94.4  2e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40 
 
 		 940 aa  93.6  2e-17  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1976  hypothetical protein  26.3 
 
 		 1367 aa  94  2e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  unclonable  0.000800417  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1530  PKD domain containing protein  31.82 
 
 		 1162 aa  93.2  3e-17  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.975674 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0424  PKD  30.38 
 
 		 1292 aa  93.2  4e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.854916 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1819  PKD domain-containing protein  37.8 
 
 		 944 aa  92.4  5e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2066  Carbohydrate binding family 6  30.22 
 
 		 870 aa  92.4  6e-17  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2467  PKD domain containing protein  39.74 
 
 		 944 aa  92  7e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.183397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0119  peptidase M6, immune inhibitor A  46.67 
 
 		 936 aa  91.7  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00164276  unclonable  0.0000343135 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0125  peptidase M6, immune inhibitor A  46.67 
 
 		 936 aa  92  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000337002  decreased coverage  0.00000000228409 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1811  PKD domain-containing protein  39.1 
 
 		 944 aa  91.3  1e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>