217 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_0840 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  100 
 
 		 390 aa  769    Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  56.82 
 
 		 668 aa  392  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  53.4 
 
 		 387 aa  391  1e-108  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  54.27 
 
 		 343 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  51.74 
 
 		 676 aa  354  1e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  47.74 
 
 		 391 aa  338  8e-92  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  55.59 
 
 		 831 aa  335  1e-90  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  55.63 
 
 		 930 aa  332  1e-89  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  50.47 
 
 		 579 aa  318  1e-85  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  49.68 
 
 		 627 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  51.38 
 
 		 522 aa  293  2e-78  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  51.54 
 
 		 709 aa  288  8e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  50.83 
 
 		 346 aa  287  2e-76  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  50.31 
 
 		 930 aa  272  7e-72  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  45.36 
 
 		 392 aa  260  2e-68  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  44.13 
 
 		 1293 aa  247  3e-64  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  43.79 
 
 		 752 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  44.86 
 
 		 491 aa  233  4.0000000000000004e-60  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  35.12 
 
 		 588 aa  221  9.999999999999999e-57  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  42.01 
 
 		 1079 aa  206  5e-52  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  37.38 
 
 		 525 aa  187  2e-46  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  40.4 
 
 		 786 aa  184  3e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1379  NHL repeat-containing protein  34.21 
 
 		 319 aa  169  5e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0368543 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  35.33 
 
 		 646 aa  159  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2779  hypothetical protein  35.08 
 
 		 1051 aa  157  3e-37  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.380242 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2981  NHL repeat containing protein  38.22 
 
 		 2296 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1359  NHL repeat containing protein  35.28 
 
 		 439 aa  157  3e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.666477 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  36.93 
 
 		 1163 aa  157  3e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  35.03 
 
 		 1146 aa  156  7e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  32.53 
 
 		 307 aa  154  2.9999999999999998e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  32.08 
 
 		 1068 aa  154  2.9999999999999998e-36  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  33.96 
 
 		 353 aa  144  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2265  NHL repeat-containing protein  36.76 
 
 		 963 aa  144  3e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.397951  normal  0.439164 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  29.79 
 
 		 850 aa  142  9.999999999999999e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  37.79 
 
 		 355 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  32.75 
 
 		 1140 aa  137  4e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2500  leucine-rich repeat-containing protein  31 
 
 		 1351 aa  136  6.0000000000000005e-31  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  33.11 
 
 		 1030 aa  135  9e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1047  fibronectin type III domain-containing protein  30.95 
 
 		 903 aa  134  1.9999999999999998e-30  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4124  NHL repeat-containing protein  33.99 
 
 		 359 aa  133  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.640446 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0258  NHL repeat-containing protein  33.48 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1920  NHL repeat-containing protein  29.51 
 
 		 343 aa  133  6e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00542747  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1378  hypothetical protein  28.72 
 
 		 1030 aa  132  1.0000000000000001e-29  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.872311  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  33.68 
 
 		 1177 aa  129  9.000000000000001e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  32.86 
 
 		 354 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  35.78 
 
 		 365 aa  128  1.0000000000000001e-28  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3159  NHL repeat containing protein  32.11 
 
 		 372 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  30.84 
 
 		 1750 aa  126  7e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3838  NHL repeat-containing protein  31.23 
 
 		 360 aa  125  1e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000127539  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  36.18 
 
 		 368 aa  124  2e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0742  NHL repeat-containing protein  30.53 
 
 		 355 aa  124  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.150031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  29.45 
 
 		 1026 aa  122  9.999999999999999e-27  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2897  NHL repeat-containing protein  29.89 
 
 		 363 aa  119  7.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.645365  normal  0.499228 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  33.68 
 
 		 1292 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2755  NHL repeat-containing protein  32.43 
 
 		 347 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  28.7 
 
 		 1130 aa  119  9.999999999999999e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2282  NHL repeat containing protein  28.98 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.11837 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  30.53 
 
 		 321 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  33.99 
 
 		 664 aa  117  3e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4063  NHL repeat-containing protein  29.72 
 
 		 1763 aa  116  5e-25  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.512891  normal  0.666526 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0617  NHL repeat-containing protein  31.25 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0567002  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0357  NHL repeat containing protein  31.56 
 
 		 700 aa  115  2.0000000000000002e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  3.18335e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  35.34 
 
 		 447 aa  114  3e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0430  hypothetical protein  50.46 
 
 		 403 aa  113  5e-24  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.122087  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  34.65 
 
 		 396 aa  113  7.000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  31.9 
 
 		 395 aa  112  9e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2885  NHL repeat-containing protein  33.2 
 
 		 888 aa  111  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  29.93 
 
 		 322 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2368  PKD domain containing protein  58.14 
 
 		 869 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.232171 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3058  NHL repeat protein  36.84 
 
 		 404 aa  111  3e-23  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  28.8 
 
 		 318 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1812  PKD domain containing protein  51.43 
 
 		 787 aa  110  6e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.466524  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  27.68 
 
 		 772 aa  109  7.000000000000001e-23  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2063  NHL repeat containing protein  34.13 
 
 		 652 aa  108  1e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  31.02 
 
 		 384 aa  107  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1796  PKD domain containing protein  67.14 
 
 		 848 aa  107  5e-22  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2272  glycoside hydrolase family 26  32.75 
 
 		 711 aa  106  8e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.738347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  25.48 
 
 		 303 aa  106  8e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  33.03 
 
 		 412 aa  105  9e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  27.51 
 
 		 892 aa  105  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  31.64 
 
 		 418 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0405  Carbohydrate binding family 6  64.29 
 
 		 749 aa  103  3e-21  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.85643 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1192  NHL repeat containing protein  35.09 
 
 		 405 aa  104  3e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3024  TPR repeat-containing protein  30 
 
 		 1230 aa  104  3e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.446617  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3843  NHL repeat containing protein  28.35 
 
 		 1046 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0246016 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1764  PKD domain containing protein  59.49 
 
 		 958 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1342  periplasmic copper-binding  58.44 
 
 		 919 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.766214 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2671  Carbohydrate binding family 6  60.27 
 
 		 581 aa  102  1e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.684309 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4004  ABC transporter related protein  28.41 
 
 		 639 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.774502  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2618  Carbohydrate binding family 6  66.67 
 
 		 522 aa  99.8  8e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.0533616 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  34.73 
 
 		 898 aa  99.4  1e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0859  PKD domain containing protein  48.89 
 
 		 488 aa  99  1e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.13 
 
 		 379 aa  99  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0359  NHL repeat-containing protein  26.51 
 
 		 448 aa  97.4  3e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  0.570534 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0737  hypothetical protein  56.98 
 
 		 294 aa  97.8  3e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  35.68 
 
 		 841 aa  97.8  3e-19  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0736  hypothetical protein  56.98 
 
 		 298 aa  97.1  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  28.78 
 
 		 326 aa  96.7  6e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  29.19 
 
 		 323 aa  96.7  6e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0493  Carbohydrate binding family 6  55.56 
 
 		 627 aa  96.7  7e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>