More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1322 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014248  Aazo_5174  exoribonuclease II  87.67 
 
 		 683 aa  1178    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1322  ribonuclease II  100 
 
 		 686 aa  1410    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.0000561831  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0901  Exoribonuclease II  60.27 
 
 		 671 aa  848    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.76792 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1124  exoribonuclease II  56.49 
 
 		 670 aa  750    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1686  Exoribonuclease II  59.33 
 
 		 671 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3730  exoribonuclease II  60.17 
 
 		 674 aa  813    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0886266 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1229  Exoribonuclease II  58.98 
 
 		 676 aa  778    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1668  Exoribonuclease II  59.33 
 
 		 671 aa  788    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34816  predicted protein  34.84 
 
 		 645 aa  353  5.9999999999999994e-96  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0611822  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1336  ribonuclease II  38.26 
 
 		 676 aa  303  6.000000000000001e-81  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.203025 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_14771  ribonuclease II  39.95 
 
 		 683 aa  286  9e-76  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0883756 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1138  exoribonuclease II  37.62 
 
 		 674 aa  283  1e-74  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.0570115  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08961  ribonuclease II  35.06 
 
 		 427 aa  237  4e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000000321128 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_10141  ribonuclease II  31.29 
 
 		 424 aa  231  3e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.192096  hitchhiker  0.0013759 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0341  exoribonuclease R/ribonuclease II  31.7 
 
 		 424 aa  230  6e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0618885  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0448  exoribonuclease II  29.11 
 
 		 666 aa  229  1e-58  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0154818  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2513  Exoribonuclease II  31.23 
 
 		 659 aa  228  3e-58  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43677  predicted protein  32.8 
 
 		 813 aa  218  2.9999999999999998e-55  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1371  RNB-like family protein  28.74 
 
 		 623 aa  210  6e-53  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0728  exoribonuclease II  28.36 
 
 		 680 aa  210  7e-53  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0032  ribonuclease II  33.25 
 
 		 469 aa  198  3e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.011152  normal  1 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3367  hypothetical protein  29.4 
 
 		 602 aa  196  9e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.140616  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0933  putative ribonuclease II  28.1 
 
 		 394 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0603579  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09491  ribonuclease II  26.58 
 
 		 394 aa  196  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.595683  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09941  ribonuclease II  27.59 
 
 		 394 aa  192  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09921  ribonuclease II  27.92 
 
 		 394 aa  191  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1292  ribonuclease R  27.66 
 
 		 751 aa  158  3e-37  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000149292  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1502  ribonuclease R  27.66 
 
 		 751 aa  156  1e-36  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.211368  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf396  VacB-like exoribonuclease II  30.11 
 
 		 718 aa  155  2e-36  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0424  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  29.33 
 
 		 665 aa  154  5.9999999999999996e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.18374  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15730  ribonuclease R  29.28 
 
 		 706 aa  152  2e-35  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000333488  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0429  exoribonuclease II  33.04 
 
 		 678 aa  148  4.0000000000000006e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000107443  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1386  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II:ribonuclease R  26.67 
 
 		 759 aa  147  6e-34  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000570433  normal  0.26711 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1009  Exoribonuclease II  27.62 
 
 		 581 aa  146  1e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0967775  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0438  exoribonuclease II  31.38 
 
 		 671 aa  146  1e-33  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2237  ribonuclease R  27.16 
 
 		 770 aa  146  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0181  ribonuclease R  28.04 
 
 		 766 aa  145  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.129563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2955  ribonuclease R  29.27 
 
 		 762 aa  144  8e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000417995  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001524  exoribonuclease II  31.86 
 
 		 667 aa  143  9.999999999999999e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000001616  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0482  ribonuclease R  29.38 
 
 		 791 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3671  ribonuclease R  25.37 
 
 		 705 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0988555  normal  0.127593 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2010  ribonuclease R  27.03 
 
 		 709 aa  142  1.9999999999999998e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000115062  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0210  ribonuclease R  32.96 
 
 		 715 aa  140  6e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0123436  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0329  ribonuclease R  29.33 
 
 		 706 aa  140  7e-32  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00226264  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0207  ribonuclease R  30.22 
 
 		 710 aa  139  2e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2247  ribonuclease R  27.34 
 
 		 788 aa  139  2e-31  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.165281  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0146  ribonuclease R  27.59 
 
 		 757 aa  139  2e-31  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.234188  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0205  ribonuclease R  30.24 
 
 		 710 aa  138  3.0000000000000003e-31  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2432  ribonuclease R  26.8 
 
 		 858 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1581  ribonuclease R  24.67 
 
 		 813 aa  137  5e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.917433  normal  0.242875 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5278  ribonuclease R  27.74 
 
 		 806 aa  136  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000124073  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1726  exoribonuclease R  29.3 
 
 		 774 aa  136  9.999999999999999e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.388166  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1431  ribonuclease R  26.09 
 
 		 857 aa  136  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.746592  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0711  VacB and RNase II family 3'-5' exoribonuclease  26.8 
 
 		 619 aa  135  3e-30  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1526  ribonuclease R  25.94 
 
 		 857 aa  135  3e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.420237  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1439  exoribonuclease R  27.29 
 
 		 726 aa  135  3e-30  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4921  ribonuclease R  27.25 
 
 		 814 aa  135  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.411267  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4956  ribonuclease R  27.74 
 
 		 808 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.744879  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4818  ribonuclease R (RNase R)  27.74 
 
 		 810 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.174115  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5334  ribonuclease R  27.74 
 
 		 808 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000223572  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5214  ribonuclease R  27.74 
 
 		 806 aa  135  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.69895 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5243  ribonuclease R  27.74 
 
 		 808 aa  134  3.9999999999999996e-30  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4808  ribonuclease R (RNase R)  27.74 
 
 		 804 aa  134  5e-30  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000493308  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1911  ribonuclease R  28.43 
 
 		 770 aa  134  5e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5709  ribonuclease R  27.74 
 
 		 812 aa  134  5e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0120471  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5232  ribonuclease R  27.49 
 
 		 806 aa  134  6.999999999999999e-30  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2152  exoribonuclease RNase R  27.46 
 
 		 720 aa  133  9e-30  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1120  RNAse R  29.38 
 
 		 646 aa  133  9e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000276354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0973  ribonuclease R  27.76 
 
 		 737 aa  133  1.0000000000000001e-29  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0037  ribonuclease R  30.3 
 
 		 745 aa  133  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3125  ribonuclease R  27.56 
 
 		 758 aa  133  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1485  ribonuclease R, putative  27.27 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.36573  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0752  ribonuclease R  27.19 
 
 		 794 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2108  ribonuclease R  26.2 
 
 		 716 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0218671  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2699  ribonuclease R  26.69 
 
 		 763 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0320356  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0770  ribonuclease R  26.07 
 
 		 708 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.246847  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1015  exoribonuclease R  25.65 
 
 		 810 aa  132  2.0000000000000002e-29  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1172  ribonuclease R  28.83 
 
 		 777 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000369652  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0676  VacB/Rnb family exoribonuclease  28.53 
 
 		 692 aa  132  3e-29  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006681  CNL04620  exoribonuclease II, putative  27.1 
 
 		 999 aa  132  3e-29  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2219  ribonuclease R  27.62 
 
 		 863 aa  132  3e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.892711  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2866  ribonuclease R  28.81 
 
 		 716 aa  132  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0172601  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1353  ribonuclease R  27.88 
 
 		 722 aa  131  5.0000000000000004e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00219332  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2897  ribonuclease R  28.78 
 
 		 722 aa  131  5.0000000000000004e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1604  RNAse R  30.81 
 
 		 535 aa  131  5.0000000000000004e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0268007  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1962  ribonuclease R  29.29 
 
 		 791 aa  131  5.0000000000000004e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.197804  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0752  exoribonuclease II  25.9 
 
 		 833 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000040627  hitchhiker  0.00244525 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0674  exoribonuclease R  27.68 
 
 		 817 aa  130  1.0000000000000001e-28  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2101  RNAse R  26.2 
 
 		 771 aa  129  2.0000000000000002e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000122542  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1520  exoribonuclease II  31.63 
 
 		 644 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3289  ribonuclease R  26.52 
 
 		 824 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.457006  hitchhiker  0.0018456 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4217  ribonuclease R  25.84 
 
 		 826 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.997198  hitchhiker  0.000734426 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3673  ribonuclease R  26.28 
 
 		 792 aa  129  3e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0298135  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1629  ribonuclease R  25.84 
 
 		 709 aa  128  4.0000000000000003e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.290975 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0460  ribonuclease R  26.14 
 
 		 1182 aa  128  4.0000000000000003e-28  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.893993  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0521  3'-5' exoribonuclease, VacB and RNase II  25.42 
 
 		 762 aa  127  5e-28  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00138071  normal  0.147067 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1923  exoribonuclease II  31.33 
 
 		 644 aa  127  5e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0111084  hitchhiker  0.000000000153264 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2420  ribonuclease R  25.71 
 
 		 770 aa  127  5e-28  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.173356  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1243  ribonuclease R  27.97 
 
 		 752 aa  127  5e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0149067  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1721  ribonuclease R  24.45 
 
 		 702 aa  127  6e-28  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>