92 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_5595 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011368  Rleg2_5595  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 502 aa  992    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6538  hypothetical protein  84.91 
 
 		 167 aa  278  1e-73  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.139702 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.42 
 
 		 548 aa  80.1  0.00000000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3845  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  24.84 
 
 		 531 aa  73.2  0.000000000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.130355 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4690  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.48 
 
 		 570 aa  65.5  0.000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.02417 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.57 
 
 		 561 aa  65.1  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.18 
 
 		 572 aa  64.7  0.000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00434  oxidoreductase  24.6 
 
 		 561 aa  63.9  0.000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  28.39 
 
 		 573 aa  62  0.00000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  28.26 
 
 		 539 aa  62  0.00000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.79 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.21 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12661  hypothetical protein  27.18 
 
 		 522 aa  59.3  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.29 
 
 		 536 aa  58.2  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 526 aa  57  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.56 
 
 		 540 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.91 
 
 		 566 aa  55.8  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.257564  normal  0.232243 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 		 570 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.94 
 
 		 531 aa  55.5  0.000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  26.5 
 
 		 539 aa  55.8  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.1 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1891  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.46 
 
 		 570 aa  55.1  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.969458 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.59 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  23.35 
 
 		 534 aa  54.7  0.000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6563  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.3 
 
 		 569 aa  54.3  0.000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0955213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.95 
 
 		 560 aa  54.3  0.000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1208  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.8 
 
 		 559 aa  53.5  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.397312  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.31 
 
 		 570 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5620  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.2 
 
 		 579 aa  53.1  0.00001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1033  putative oxidoreductase chain  24.62 
 
 		 574 aa  52.8  0.00001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0731446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.02 
 
 		 511 aa  52.8  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 533 aa  52.4  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 		 545 aa  52  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.33 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.43 
 
 		 534 aa  52  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  25.09 
 
 		 569 aa  52  0.00003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.98 
 
 		 573 aa  52  0.00003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.33 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.33 
 
 		 539 aa  51.6  0.00003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.02 
 
 		 533 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 563 aa  50.8  0.00005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 		 545 aa  51.2  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5079  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 		 569 aa  50.8  0.00006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.623805 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1967  hypothetical protein  23.71 
 
 		 558 aa  50.4  0.00008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.929106  hitchhiker  0.0000146847 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  24.81 
 
 		 489 aa  50.4  0.00008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.73 
 
 		 533 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.73 
 
 		 533 aa  50.1  0.00009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.58 
 
 		 539 aa  50.1  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 623 aa  50.1  0.0001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  25.17 
 
 		 578 aa  49.3  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  26.62 
 
 		 578 aa  50.1  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  24.75 
 
 		 587 aa  48.9  0.0002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  22.63 
 
 		 570 aa  49.3  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.06 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.69 
 
 		 572 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  27.44 
 
 		 549 aa  48.5  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 573 aa  48.5  0.0003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.73 
 
 		 526 aa  48.5  0.0003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  24.45 
 
 		 565 aa  48.1  0.0003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27 
 
 		 572 aa  48.5  0.0003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  25.86 
 
 		 578 aa  47.8  0.0004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.03 
 
 		 563 aa  48.1  0.0004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0109  hypothetical protein  25.2 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.98 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 		 582 aa  47.4  0.0006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009467  Acry_3135  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.19 
 
 		 520 aa  47  0.0008  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1737  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.11 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.170374  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.25 
 
 		 522 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.27 
 
 		 547 aa  46.6  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2999  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.24 
 
 		 561 aa  46.6  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.634456  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.97 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.7 
 
 		 528 aa  45.4  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.45 
 
 		 522 aa  45.8  0.002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  28.97 
 
 		 570 aa  45.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  28.16 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4949  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.6 
 
 		 574 aa  45.8  0.002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.32 
 
 		 538 aa  45.8  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 		 565 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  24.16 
 
 		 577 aa  45.4  0.002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.97 
 
 		 522 aa  45.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  21.76 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  23.01 
 
 		 622 aa  44.7  0.004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.45 
 
 		 512 aa  44.3  0.005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.69 
 
 		 566 aa  44.3  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.45 
 
 		 527 aa  44.3  0.006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.35 
 
 		 522 aa  43.9  0.006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.3 
 
 		 547 aa  43.9  0.006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1808  putative dehydrogenase subunit  26.07 
 
 		 551 aa  43.9  0.006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000111783  hitchhiker  0.0000501686 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.15 
 
 		 573 aa  43.5  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.65 
 
 		 547 aa  43.5  0.008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>