164 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4906 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  61.28 
 
 		 622 aa  687    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.75 
 
 		 583 aa  635    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  65.68 
 
 		 587 aa  717    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  62.39 
 
 		 577 aa  650    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  82.16 
 
 		 591 aa  978    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  62.48 
 
 		 657 aa  708    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60 
 
 		 570 aa  655    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  82.16 
 
 		 591 aa  978    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  92.91 
 
 		 578 aa  1115    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  64.12 
 
 		 577 aa  715    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  82.33 
 
 		 591 aa  979    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 578 aa  1188    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  60.38 
 
 		 563 aa  662    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.71 
 
 		 593 aa  641    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.05 
 
 		 586 aa  657    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  61.11 
 
 		 569 aa  693    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  81.66 
 
 		 578 aa  982    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  59.93 
 
 		 567 aa  645    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  67.19 
 
 		 562 aa  729    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.47 
 
 		 623 aa  642    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  61.32 
 
 		 564 aa  671    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.81 
 
 		 557 aa  636    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  62.88 
 
 		 563 aa  634  1e-180  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.23 
 
 		 582 aa  610  1e-173  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  57.14 
 
 		 581 aa  606  9.999999999999999e-173  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.86 
 
 		 562 aa  595  1e-169  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  60.31 
 
 		 556 aa  581  1e-164  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  55.19 
 
 		 567 aa  525  1e-147  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.09 
 
 		 565 aa  507  9.999999999999999e-143  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.94 
 
 		 546 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 		 540 aa  432  1e-120  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  43.97 
 
 		 653 aa  422  1e-117  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.33 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.63 
 
 		 543 aa  424  1e-117  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  43.97 
 
 		 552 aa  422  1e-116  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  43.97 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  43.97 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  43.97 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  43.97 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  43.97 
 
 		 632 aa  421  1e-116  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  46.61 
 
 		 547 aa  416  9.999999999999999e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  43.33 
 
 		 696 aa  413  1e-114  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.53 
 
 		 556 aa  415  1e-114  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.04 
 
 		 537 aa  404  1e-111  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.21 
 
 		 786 aa  199  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.67 
 
 		 572 aa  170  7e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  29.73 
 
 		 889 aa  168  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  31.31 
 
 		 533 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  27.64 
 
 		 554 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.49 
 
 		 1150 aa  130  9.000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  26.26 
 
 		 1150 aa  129  1.0000000000000001e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.87 
 
 		 1132 aa  109  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  27.3 
 
 		 1152 aa  107  6e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 		 1152 aa  102  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  31.64 
 
 		 544 aa  100  7e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  28.48 
 
 		 530 aa  93.2  1e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.47 
 
 		 552 aa  92.4  2e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  29.94 
 
 		 513 aa  90.9  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.11 
 
 		 551 aa  91.3  5e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  26.46 
 
 		 502 aa  90.9  6e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.29 
 
 		 573 aa  90.9  6e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.09 
 
 		 526 aa  89.4  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 547 aa  89.4  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 573 aa  87.8  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.1 
 
 		 527 aa  87  7e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 526 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.91 
 
 		 515 aa  84.3  0.000000000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 		 556 aa  83.6  0.000000000000009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.06 
 
 		 556 aa  81.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  24.83 
 
 		 547 aa  81.6  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  23.78 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.32 
 
 		 547 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  28.27 
 
 		 541 aa  78.6  0.0000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.65 
 
 		 548 aa  76.6  0.000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  24.52 
 
 		 543 aa  76.6  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  23.6 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  23.6 
 
 		 563 aa  75.9  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  26.35 
 
 		 543 aa  75.5  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.72 
 
 		 528 aa  73.9  0.000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.33 
 
 		 556 aa  73.6  0.000000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.43 
 
 		 535 aa  72.4  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  27.73 
 
 		 538 aa  72  0.00000000003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  28.82 
 
 		 546 aa  70.1  0.0000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  27.3 
 
 		 547 aa  67.4  0.0000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.6 
 
 		 553 aa  67  0.0000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  23.84 
 
 		 1146 aa  66.2  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.54 
 
 		 511 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  26.36 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  29.54 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.36 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.36 
 
 		 548 aa  62.8  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  25.08 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.75 
 
 		 563 aa  60.8  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  26.79 
 
 		 699 aa  60.1  0.0000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 533 aa  60.1  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.99 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  25.55 
 
 		 534 aa  57.8  0.0000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.66 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.26 
 
 		 522 aa  56.2  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>