195 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_4248 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  61.9 
 
 		 564 aa  666    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  62.46 
 
 		 622 aa  700    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.45 
 
 		 583 aa  640    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 586 aa  1190    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 591 aa  680    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.34 
 
 		 570 aa  662    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 591 aa  680    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  60.85 
 
 		 578 aa  684    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  60.55 
 
 		 591 aa  680    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  61.05 
 
 		 578 aa  685    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  61.83 
 
 		 563 aa  668    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  71.72 
 
 		 556 aa  748    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  62.82 
 
 		 657 aa  712    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  60.58 
 
 		 577 aa  660    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  71.9 
 
 		 563 aa  780    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  59.9 
 
 		 578 aa  666    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  61.71 
 
 		 567 aa  690    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  66.96 
 
 		 582 aa  725    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  62.76 
 
 		 562 aa  645    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  60.76 
 
 		 569 aa  674    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.07 
 
 		 623 aa  646    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  60.79 
 
 		 581 aa  632  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.65 
 
 		 557 aa  628  1e-179  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.72 
 
 		 593 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  58.81 
 
 		 587 aa  619  1e-176  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  54.56 
 
 		 577 aa  610  1e-173  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.83 
 
 		 565 aa  569  1e-161  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.71 
 
 		 562 aa  550  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  56.28 
 
 		 567 aa  543  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.32 
 
 		 546 aa  449  1e-125  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.79 
 
 		 556 aa  409  1e-113  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  46.01 
 
 		 540 aa  409  1e-113  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.53 
 
 		 537 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.25 
 
 		 543 aa  402  1e-111  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.89 
 
 		 543 aa  399  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  47.07 
 
 		 547 aa  398  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  43.4 
 
 		 632 aa  389  1e-107  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  43.4 
 
 		 552 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  43.4 
 
 		 632 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  43.4 
 
 		 653 aa  389  1e-106  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  43.4 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  43.4 
 
 		 632 aa  389  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  43.4 
 
 		 632 aa  388  1e-106  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  42.86 
 
 		 696 aa  382  1e-105  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.79 
 
 		 786 aa  204  5e-51  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  30.82 
 
 		 889 aa  176  9.999999999999999e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.53 
 
 		 572 aa  168  2.9999999999999998e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  29.9 
 
 		 533 aa  150  5e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  27.74 
 
 		 554 aa  130  6e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  29.2 
 
 		 543 aa  124  4e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  31.19 
 
 		 1150 aa  123  9.999999999999999e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.95 
 
 		 1152 aa  122  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.18 
 
 		 1150 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.98 
 
 		 1132 aa  117  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.99 
 
 		 552 aa  116  8.999999999999998e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  26.52 
 
 		 546 aa  114  5e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  29.75 
 
 		 513 aa  112  1.0000000000000001e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  32.41 
 
 		 547 aa  99.4  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.92 
 
 		 551 aa  95.9  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.15 
 
 		 535 aa  94.7  4e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  25.36 
 
 		 543 aa  93.2  1e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  29.43 
 
 		 502 aa  91.7  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  27.36 
 
 		 530 aa  87  8e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  28.48 
 
 		 544 aa  84.7  0.000000000000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  29.61 
 
 		 1152 aa  80.9  0.00000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  24.68 
 
 		 534 aa  79.3  0.0000000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.83 
 
 		 515 aa  78.2  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 		 550 aa  75.9  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.04 
 
 		 526 aa  75.9  0.000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  29.3 
 
 		 538 aa  74.3  0.000000000005  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  26.56 
 
 		 543 aa  71.6  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  26.02 
 
 		 541 aa  70.5  0.00000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.44 
 
 		 553 aa  64.7  0.000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.93 
 
 		 556 aa  63.5  0.000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.48 
 
 		 548 aa  62  0.00000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.22 
 
 		 533 aa  61.6  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2982  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.49 
 
 		 572 aa  60.8  0.00000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.55 
 
 		 562 aa  60.5  0.00000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.28 
 
 		 582 aa  59.3  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.3 
 
 		 553 aa  58.9  0.0000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.71 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  25.92 
 
 		 547 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  26.9 
 
 		 786 aa  58.5  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  25.38 
 
 		 533 aa  58.5  0.0000004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  34.86 
 
 		 502 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  34.86 
 
 		 510 aa  57.8  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.28 
 
 		 494 aa  57.8  0.0000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  47.54 
 
 		 494 aa  57.4  0.0000006  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.78 
 
 		 527 aa  57.8  0.0000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.24 
 
 		 512 aa  57  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.67 
 
 		 520 aa  55.5  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.33 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.37 
 
 		 518 aa  56.2  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  38.57 
 
 		 521 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  41.43 
 
 		 470 aa  55.5  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.65 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.65 
 
 		 522 aa  54.7  0.000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.8 
 
 		 505 aa  55.1  0.000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1814  oxidoreductase  25.33 
 
 		 547 aa  54.3  0.000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.315902  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06751  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  20.52 
 
 		 546 aa  54.3  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>