81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5961 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  73.9 
 
 		 547 aa  837    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  62.96 
 
 		 543 aa  704    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  100 
 
 		 546 aa  1113    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  50.1 
 
 		 533 aa  503  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  48.65 
 
 		 534 aa  501  1e-140  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  39.11 
 
 		 534 aa  395  1e-109  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  35.56 
 
 		 544 aa  240  5e-62  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  35.34 
 
 		 543 aa  238  2e-61  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  33.7 
 
 		 530 aa  237  4e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  32.37 
 
 		 513 aa  227  5.0000000000000005e-58  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  29.38 
 
 		 502 aa  220  5e-56  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  32.82 
 
 		 541 aa  216  7e-55  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  31.83 
 
 		 538 aa  211  4e-53  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  33.33 
 
 		 543 aa  205  2e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.56 
 
 		 623 aa  98.2  3e-19  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  25.31 
 
 		 540 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.63 
 
 		 586 aa  92  2e-17  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 591 aa  89.7  1e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 		 535 aa  86.7  9e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.79 
 
 		 593 aa  85.5  0.000000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.57 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.65 
 
 		 543 aa  85.1  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  31.16 
 
 		 564 aa  82.8  0.00000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.35 
 
 		 786 aa  82.8  0.00000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  27.03 
 
 		 563 aa  80.9  0.00000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  23.8 
 
 		 657 aa  80.1  0.00000000000009  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  30.22 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.73 
 
 		 1132 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  25 
 
 		 622 aa  76.6  0.000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  27.27 
 
 		 533 aa  76.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.84 
 
 		 569 aa  75.9  0.000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  27.58 
 
 		 889 aa  74.3  0.000000000006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.69 
 
 		 557 aa  73.6  0.000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  27.46 
 
 		 567 aa  73.6  0.000000000009  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.86 
 
 		 562 aa  73.2  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 578 aa  71.2  0.00000000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.62 
 
 		 582 aa  70.1  0.00000000009  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  28.82 
 
 		 578 aa  70.1  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.57 
 
 		 583 aa  68.6  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.69 
 
 		 552 aa  68.2  0.0000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 		 1150 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.2 
 
 		 572 aa  67.4  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  25.37 
 
 		 632 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  25.37 
 
 		 632 aa  67  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  25.37 
 
 		 632 aa  67  0.0000000009  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  25.37 
 
 		 632 aa  67  0.0000000009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  25.37 
 
 		 552 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  25.37 
 
 		 653 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  25.37 
 
 		 632 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.85 
 
 		 570 aa  64.3  0.000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  25.58 
 
 		 696 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  27.07 
 
 		 578 aa  62.4  0.00000002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  25.15 
 
 		 551 aa  60.1  0.0000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  38.04 
 
 		 581 aa  59.7  0.0000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.9 
 
 		 1152 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  37.5 
 
 		 577 aa  59.3  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.03 
 
 		 1152 aa  58.9  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  25.07 
 
 		 587 aa  58.2  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  23.68 
 
 		 1150 aa  57.4  0.0000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  35.71 
 
 		 562 aa  57  0.0000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.77 
 
 		 556 aa  56.6  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  36.21 
 
 		 577 aa  56.6  0.000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3364  hypothetical protein  47.06 
 
 		 738 aa  55.8  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.451115  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  44.83 
 
 		 567 aa  52.4  0.00002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.27 
 
 		 546 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  38.1 
 
 		 554 aa  51.6  0.00004  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.2 
 
 		 565 aa  51.2  0.00005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07121  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  21.51 
 
 		 547 aa  51.2  0.00005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.569172  normal  0.139328 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  22.39 
 
 		 489 aa  50.4  0.00009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1814  oxidoreductase  24.85 
 
 		 547 aa  49.3  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.315902  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0088  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  21.51 
 
 		 547 aa  48.5  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.774612  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 		 537 aa  47.4  0.0008  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  40.58 
 
 		 556 aa  47  0.0008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.85 
 
 		 534 aa  46.6  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3076  2,3-dihydroxybenzoate-2,3-dehydrogenase  34.75 
 
 		 253 aa  45.4  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.57 
 
 		 515 aa  43.9  0.008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  33.33 
 
 		 521 aa  43.5  0.009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>