177 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0464 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  76.44 
 
 		 622 aa  898    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  58.49 
 
 		 577 aa  657    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  66.2 
 
 		 577 aa  693    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  63.54 
 
 		 583 aa  685    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  60.45 
 
 		 581 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  65.16 
 
 		 591 aa  745    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  62.82 
 
 		 586 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.54 
 
 		 570 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  65.16 
 
 		 591 aa  745    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  63.4 
 
 		 578 aa  714    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 657 aa  1322    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.07 
 
 		 582 aa  638    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  64.98 
 
 		 591 aa  744    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  62.83 
 
 		 578 aa  713    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  61.46 
 
 		 563 aa  649    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  62.52 
 
 		 569 aa  684    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  62.87 
 
 		 578 aa  709    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  63.97 
 
 		 562 aa  683    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  64.86 
 
 		 556 aa  643    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.46 
 
 		 623 aa  664    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  62.22 
 
 		 564 aa  659    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  65.53 
 
 		 563 aa  676    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  63.62 
 
 		 567 aa  704    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  60.98 
 
 		 587 aa  657    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.7 
 
 		 593 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  61.17 
 
 		 567 aa  590  1e-167  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.85 
 
 		 557 aa  590  1e-167  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.51 
 
 		 562 aa  583  1.0000000000000001e-165  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  56.55 
 
 		 565 aa  556  1e-157  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.96 
 
 		 546 aa  494  9.999999999999999e-139  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.18 
 
 		 543 aa  444  1e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 543 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  47.42 
 
 		 540 aa  445  1e-123  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  48.99 
 
 		 547 aa  441  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  44.29 
 
 		 632 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  44.11 
 
 		 653 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  44.11 
 
 		 632 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  43.12 
 
 		 632 aa  428  1e-118  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  44.29 
 
 		 632 aa  426  1e-118  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  44.11 
 
 		 632 aa  426  1e-118  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  44.67 
 
 		 552 aa  425  1e-117  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  44.09 
 
 		 696 aa  417  9.999999999999999e-116  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.31 
 
 		 537 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.99 
 
 		 556 aa  400  9.999999999999999e-111  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.92 
 
 		 786 aa  211  4e-53  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  31.41 
 
 		 889 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.64 
 
 		 572 aa  164  4.0000000000000004e-39  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  35.23 
 
 		 533 aa  133  1.0000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 		 552 aa  125  3e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.43 
 
 		 1150 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  30.53 
 
 		 1150 aa  114  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  29.04 
 
 		 551 aa  112  2.0000000000000002e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.51 
 
 		 1152 aa  112  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  29.13 
 
 		 554 aa  107  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  26.78 
 
 		 1152 aa  103  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.47 
 
 		 550 aa  99  3e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  24.82 
 
 		 502 aa  95.5  2e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  30.4 
 
 		 513 aa  92.8  2e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.05 
 
 		 526 aa  89.7  1e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 		 1132 aa  89  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.37 
 
 		 470 aa  87  0.000000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  26.42 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  26.02 
 
 		 543 aa  85.9  0.000000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.64 
 
 		 527 aa  85.1  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  24.16 
 
 		 546 aa  84.3  0.000000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.32 
 
 		 515 aa  80.1  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.32 
 
 		 535 aa  79  0.0000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  26.9 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.51 
 
 		 553 aa  73.9  0.000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  22.53 
 
 		 745 aa  72.8  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.64 
 
 		 505 aa  71.6  0.00000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  27.02 
 
 		 538 aa  69.7  0.0000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.2 
 
 		 530 aa  69.3  0.0000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.78 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  27.68 
 
 		 544 aa  67.8  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  28.18 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.9 
 
 		 528 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  27.27 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 525 aa  65.9  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.94 
 
 		 528 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 533 aa  65.1  0.000000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  25.42 
 
 		 547 aa  65.1  0.000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.18 
 
 		 522 aa  64.3  0.000000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.09 
 
 		 511 aa  63.2  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 		 563 aa  61.6  0.00000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.31 
 
 		 539 aa  62  0.00000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.11 
 
 		 549 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.63 
 
 		 527 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3577  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.38 
 
 		 506 aa  60.8  0.00000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0954252  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  36.84 
 
 		 494 aa  60.5  0.00000009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.81 
 
 		 541 aa  60.1  0.0000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.37 
 
 		 562 aa  60.1  0.0000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.55 
 
 		 523 aa  60.1  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.73 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.79 
 
 		 494 aa  59.7  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.14 
 
 		 520 aa  58.2  0.0000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  28.34 
 
 		 786 aa  58.2  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.04 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.04 
 
 		 522 aa  57.8  0.0000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.42 
 
 		 504 aa  57.4  0.0000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>