205 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A3075 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  99.64 
 
 
552 aa  1129    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  100 
 
 
632 aa  1286    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  89.24 
 
 
696 aa  1105    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.44 
 
 
556 aa  689    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  99.37 
 
 
653 aa  1278    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  99.37 
 
 
632 aa  1278    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  99.37 
 
 
632 aa  1276    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  100 
 
 
632 aa  1286    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  99.37 
 
 
632 aa  1278    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  48.71 
 
 
540 aa  474  1e-132  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.59 
 
 
543 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.41 
 
 
543 aa  457  1e-127  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  48.04 
 
 
547 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.64 
 
 
537 aa  450  1e-125  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.22 
 
 
546 aa  441  9.999999999999999e-123  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.84 
 
 
583 aa  432  1e-120  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.92 
 
 
623 aa  432  1e-120  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  46.74 
 
 
577 aa  431  1e-119  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  44.83 
 
 
622 aa  429  1e-118  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  44.16 
 
 
578 aa  427  1e-118  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 
591 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  44.55 
 
 
591 aa  422  1e-117  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  44.36 
 
 
591 aa  421  1e-116  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  43.97 
 
 
578 aa  421  1e-116  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  45.17 
 
 
657 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  46.03 
 
 
564 aa  413  1e-114  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  46.93 
 
 
567 aa  415  1e-114  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  44.46 
 
 
578 aa  415  1e-114  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  45.19 
 
 
563 aa  406  1.0000000000000001e-112  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  42.47 
 
 
569 aa  405  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.24 
 
 
570 aa  405  1e-111  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.36 
 
 
593 aa  401  9.999999999999999e-111  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  44.19 
 
 
581 aa  396  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.71 
 
 
557 aa  394  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  46.82 
 
 
567 aa  390  1e-107  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  44.96 
 
 
563 aa  391  1e-107  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  45.83 
 
 
562 aa  385  1e-106  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  42.52 
 
 
577 aa  373  1e-102  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  41.1 
 
 
587 aa  375  1e-102  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.4 
 
 
586 aa  367  1e-100  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.8 
 
 
582 aa  365  2e-99  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  44.61 
 
 
556 aa  354  2.9999999999999997e-96  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.74 
 
 
562 aa  347  5e-94  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.49 
 
 
565 aa  332  9e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  31.98 
 
 
533 aa  201  3.9999999999999996e-50  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.76 
 
 
572 aa  178  2e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30 
 
 
786 aa  174  3.9999999999999995e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 
889 aa  174  3.9999999999999995e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  28.94 
 
 
554 aa  148  3e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  27.92 
 
 
1150 aa  144  6e-33  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.22 
 
 
1150 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.02 
 
 
1152 aa  129  2.0000000000000002e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  26.36 
 
 
502 aa  124  5e-27  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  28.72 
 
 
1152 aa  121  3e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 
1132 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  25.89 
 
 
530 aa  110  5e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  26.4 
 
 
544 aa  104  6e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  27.82 
 
 
538 aa  103  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  24.82 
 
 
543 aa  97.8  5e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  25.36 
 
 
541 aa  90.9  7e-17  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  26 
 
 
543 aa  90.1  1e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  24.78 
 
 
534 aa  89  3e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  24.86 
 
 
551 aa  87.8  5e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.2 
 
 
552 aa  85.5  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.22 
 
 
535 aa  84  0.000000000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.41 
 
 
527 aa  82.4  0.00000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  28.66 
 
 
513 aa  82.8  0.00000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.59 
 
 
528 aa  79.7  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.51 
 
 
532 aa  75.9  0.000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.62 
 
 
526 aa  75.1  0.000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  24.43 
 
 
543 aa  73.6  0.00000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.31 
 
 
528 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  22.72 
 
 
532 aa  69.7  0.0000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.64 
 
 
532 aa  68.2  0.0000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  28.14 
 
 
547 aa  68.2  0.0000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.62 
 
 
520 aa  66.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  25.37 
 
 
546 aa  67  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.22 
 
 
522 aa  65.9  0.000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.29 
 
 
527 aa  65.1  0.000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.52 
 
 
562 aa  64.7  0.000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 
528 aa  64.3  0.000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.55 
 
 
545 aa  63.5  0.00000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.64 
 
 
522 aa  63.5  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.38 
 
 
550 aa  60.8  0.00000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  30.77 
 
 
629 aa  58.9  0.0000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.93 
 
 
522 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  22.93 
 
 
522 aa  58.5  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 
526 aa  57.8  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.72 
 
 
515 aa  57.4  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.89 
 
 
505 aa  57  0.0000009  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.24 
 
 
547 aa  56.2  0.000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.72 
 
 
570 aa  55.5  0.000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.2 
 
 
522 aa  55.5  0.000003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.61 
 
 
556 aa  55.1  0.000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0330  oxidoreductase  21.94 
 
 
570 aa  55.5  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0122567 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  23.99 
 
 
547 aa  55.5  0.000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.9 
 
 
531 aa  55.1  0.000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  23.89 
 
 
697 aa  55.8  0.000003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  25.07 
 
 
521 aa  55.5  0.000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.73 
 
 
547 aa  55.1  0.000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>