251 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mflv_4475 on replicon NC_009338
Organism: Mycobacterium gilvum PYR-GCK



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  100 
 
 		 554 aa  1135    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  41.84 
 
 		 889 aa  391  1e-107  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.45 
 
 		 786 aa  357  2.9999999999999997e-97  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  39.9 
 
 		 572 aa  324  3e-87  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.82 
 
 		 1150 aa  193  7e-48  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  28.98 
 
 		 1150 aa  192  1e-47  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  32.85 
 
 		 533 aa  191  2.9999999999999997e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.82 
 
 		 1152 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1152 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.45 
 
 		 1132 aa  160  5e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  29.38 
 
 		 540 aa  154  4e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  29.12 
 
 		 552 aa  153  8.999999999999999e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  29.12 
 
 		 632 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  29.12 
 
 		 653 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  29.12 
 
 		 632 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  28.52 
 
 		 696 aa  151  3e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  28.94 
 
 		 632 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  28.94 
 
 		 632 aa  149  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  28.94 
 
 		 632 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.7 
 
 		 570 aa  148  3e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.45 
 
 		 543 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  27.95 
 
 		 578 aa  144  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 623 aa  144  4e-33  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.81 
 
 		 543 aa  143  6e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  27.93 
 
 		 578 aa  143  7e-33  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.62 
 
 		 593 aa  142  9.999999999999999e-33  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.33 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  27.86 
 
 		 622 aa  139  8.999999999999999e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  27.64 
 
 		 578 aa  139  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 591 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 591 aa  138  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  27.4 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.49 
 
 		 591 aa  137  5e-31  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  30.07 
 
 		 563 aa  134  3.9999999999999996e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.26 
 
 		 565 aa  130  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 		 537 aa  130  9.000000000000001e-29  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  29.2 
 
 		 567 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  28.34 
 
 		 581 aa  128  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  26.28 
 
 		 564 aa  126  1e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  28.41 
 
 		 556 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  26.33 
 
 		 577 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  31.54 
 
 		 547 aa  117  6e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.13 
 
 		 583 aa  116  8.999999999999998e-25  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.48 
 
 		 556 aa  115  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  31 
 
 		 587 aa  114  6e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  27.5 
 
 		 544 aa  113  9e-24  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.81 
 
 		 552 aa  112  2.0000000000000002e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 		 586 aa  111  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.67 
 
 		 551 aa  108  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.54 
 
 		 535 aa  107  4e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  25.5 
 
 		 530 aa  105  3e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  28.16 
 
 		 657 aa  103  9e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  25.71 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  28.76 
 
 		 569 aa  100  7e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.28 
 
 		 562 aa  98.6  3e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.37 
 
 		 546 aa  97.8  5e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 577 aa  94.7  4e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  22.64 
 
 		 534 aa  90.5  7e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 567 aa  87.4  6e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.96 
 
 		 550 aa  84.7  0.000000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  23.32 
 
 		 1146 aa  84.3  0.000000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  24.35 
 
 		 547 aa  83.6  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.2 
 
 		 470 aa  83.2  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.91 
 
 		 526 aa  82  0.00000000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  27.49 
 
 		 534 aa  80.1  0.00000000000009  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.72 
 
 		 515 aa  79.7  0.0000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 526 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  24.2 
 
 		 533 aa  78.2  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.67 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.87 
 
 		 582 aa  77.4  0.0000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 529 aa  76.3  0.000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 		 562 aa  73.6  0.000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  24.85 
 
 		 513 aa  70.9  0.00000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.11 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.11 
 
 		 534 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.77 
 
 		 512 aa  69.7  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.01 
 
 		 528 aa  69.3  0.0000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  24.25 
 
 		 543 aa  69.3  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.84 
 
 		 512 aa  68.6  0.0000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.86 
 
 		 556 aa  67.8  0.0000000005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.74 
 
 		 534 aa  67  0.0000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.42 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.1 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.07 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.06 
 
 		 521 aa  64.3  0.000000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  23.3 
 
 		 543 aa  63.9  0.000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3931  FAD dependent oxidoreductase  23.18 
 
 		 489 aa  63.2  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0875  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.02 
 
 		 494 aa  63.5  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0584365  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.33 
 
 		 534 aa  62.8  0.00000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.47 
 
 		 522 aa  62.4  0.00000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.86 
 
 		 525 aa  62.8  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.98 
 
 		 556 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.32 
 
 		 545 aa  61.2  0.00000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 573 aa  60.5  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.88 
 
 		 511 aa  60.1  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0230  putative dehydrogenase  22.11 
 
 		 591 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.35 
 
 		 545 aa  58.9  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  47.83 
 
 		 502 aa  58.5  0.0000003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 		 506 aa  58.5  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.48 
 
 		 522 aa  58.5  0.0000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>