233 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_4226 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 546 aa  1107    Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.87 
 
 		 537 aa  606  9.999999999999999e-173  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  53.82 
 
 		 564 aa  531  1e-149  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  52.12 
 
 		 578 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  53.69 
 
 		 563 aa  517  1.0000000000000001e-145  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  51.09 
 
 		 657 aa  513  1e-144  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.6 
 
 		 543 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  50.75 
 
 		 578 aa  503  1e-141  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.79 
 
 		 543 aa  502  1e-141  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 591 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 591 aa  498  1e-140  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  50.94 
 
 		 591 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  49.82 
 
 		 578 aa  498  1e-139  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  49.46 
 
 		 622 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  51.67 
 
 		 547 aa  494  9.999999999999999e-139  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  50.37 
 
 		 563 aa  483  1e-135  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.37 
 
 		 583 aa  482  1e-135  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  51.39 
 
 		 540 aa  483  1e-135  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  49.9 
 
 		 577 aa  481  1e-134  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  49.54 
 
 		 569 aa  479  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  52.34 
 
 		 562 aa  481  1e-134  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.46 
 
 		 623 aa  481  1e-134  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.46 
 
 		 556 aa  478  1e-133  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 		 567 aa  474  1e-132  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  51.23 
 
 		 581 aa  471  1.0000000000000001e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  48.88 
 
 		 587 aa  466  9.999999999999999e-131  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  48.13 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  48.32 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  49.54 
 
 		 577 aa  464  1e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  48.13 
 
 		 653 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  48.32 
 
 		 632 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  48.32 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  47.55 
 
 		 696 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  48.13 
 
 		 632 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  48.13 
 
 		 632 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  48.24 
 
 		 556 aa  456  1e-127  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.89 
 
 		 570 aa  453  1.0000000000000001e-126  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.47 
 
 		 567 aa  450  1e-125  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.64 
 
 		 562 aa  448  1e-125  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.38 
 
 		 586 aa  450  1e-125  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.73 
 
 		 582 aa  446  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.14 
 
 		 593 aa  439  9.999999999999999e-123  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.83 
 
 		 557 aa  438  1e-121  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.47 
 
 		 565 aa  405  1.0000000000000001e-112  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.88 
 
 		 786 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  30.97 
 
 		 533 aa  181  4e-44  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.91 
 
 		 572 aa  177  5e-43  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.51 
 
 		 889 aa  177  5e-43  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  31.25 
 
 		 554 aa  115  2.0000000000000002e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.41 
 
 		 1150 aa  110  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  30.76 
 
 		 538 aa  103  6e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  29.49 
 
 		 1150 aa  99.8  1e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.83 
 
 		 530 aa  95.5  2e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.35 
 
 		 527 aa  94.4  5e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.61 
 
 		 552 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 556 aa  88.6  3e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  26.79 
 
 		 547 aa  87  8e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  31.02 
 
 		 513 aa  84.7  0.000000000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 1152 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  25 
 
 		 541 aa  84  0.000000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.16 
 
 		 528 aa  83.6  0.000000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.41 
 
 		 526 aa  82.8  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  33.56 
 
 		 1152 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  27.4 
 
 		 543 aa  80.5  0.00000000000007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  25.87 
 
 		 539 aa  79.7  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1871  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.26 
 
 		 545 aa  79  0.0000000000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.176173  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.67 
 
 		 1132 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  23.72 
 
 		 502 aa  74.3  0.000000000005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.08 
 
 		 541 aa  73.2  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 		 539 aa  71.6  0.00000000003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.3 
 
 		 549 aa  70.1  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 518 aa  70.1  0.0000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.65 
 
 		 562 aa  69.3  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.55 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.54 
 
 		 563 aa  67.4  0.0000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.73 
 
 		 529 aa  67.4  0.0000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  27.21 
 
 		 543 aa  67  0.0000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.07 
 
 		 532 aa  65.5  0.000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.86 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07141  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase:NAD binding site  22.24 
 
 		 546 aa  65.5  0.000000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.915082  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  28.7 
 
 		 544 aa  65.1  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 535 aa  65.1  0.000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.77 
 
 		 527 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.52 
 
 		 529 aa  65.1  0.000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.74 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.24 
 
 		 520 aa  63.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.09 
 
 		 511 aa  63.5  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  24.13 
 
 		 547 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.2 
 
 		 551 aa  61.2  0.00000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.44 
 
 		 506 aa  61.6  0.00000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  23.94 
 
 		 546 aa  61.2  0.00000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  25.24 
 
 		 745 aa  61.2  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.43 
 
 		 555 aa  59.7  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2686  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.4 
 
 		 561 aa  60.1  0.0000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.50945  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0454  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.24 
 
 		 570 aa  59.3  0.0000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.219134  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.4 
 
 		 470 aa  58.9  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  23.56 
 
 		 534 aa  58.9  0.0000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  25.09 
 
 		 563 aa  58.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24 
 
 		 531 aa  58.2  0.0000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.3 
 
 		 515 aa  58.9  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>