250 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_2937 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
711 aa  1458    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0294  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.63 
 
 
666 aa  176  9.999999999999999e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.04 
 
 
532 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.74 
 
 
505 aa  151  4e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  28.29 
 
 
531 aa  150  6e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  28.3 
 
 
532 aa  147  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.74 
 
 
532 aa  145  2e-33  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 
531 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  27.33 
 
 
530 aa  140  7.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 
531 aa  140  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 
532 aa  139  1e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.4 
 
 
531 aa  138  4e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.98 
 
 
470 aa  138  4e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.13 
 
 
555 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.54 
 
 
520 aa  135  1.9999999999999998e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 
532 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3130  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.34 
 
 
1182 aa  135  3e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.456841  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.52 
 
 
537 aa  134  6.999999999999999e-30  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.25 
 
 
531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.44 
 
 
530 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.1 
 
 
529 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.12 
 
 
541 aa  130  8.000000000000001e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  27.72 
 
 
539 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.96 
 
 
531 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.96 
 
 
531 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 
531 aa  126  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
526 aa  125  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 
531 aa  125  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  25.25 
 
 
533 aa  125  3e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.2 
 
 
533 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 
533 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.09 
 
 
541 aa  123  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.2 
 
 
533 aa  121  3.9999999999999996e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  26.38 
 
 
629 aa  120  9.999999999999999e-26  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  24.1 
 
 
563 aa  118  3.9999999999999997e-25  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.92 
 
 
539 aa  117  5e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.24 
 
 
529 aa  115  2.0000000000000002e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.09 
 
 
532 aa  113  1.0000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  25 
 
 
745 aa  106  2e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.75 
 
 
657 aa  104  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.43 
 
 
506 aa  95.1  4e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
547 aa  94.7  5e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.69 
 
 
535 aa  92.4  3e-17  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 
573 aa  88.2  5e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  25.05 
 
 
547 aa  86.7  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.56 
 
 
573 aa  85.1  0.000000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.15 
 
 
547 aa  83.6  0.00000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.42 
 
 
548 aa  83.6  0.00000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  30.5 
 
 
551 aa  83.2  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.76 
 
 
511 aa  82  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 
552 aa  82  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.16 
 
 
556 aa  81.6  0.00000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  25.74 
 
 
563 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  25.74 
 
 
563 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.9 
 
 
1150 aa  79.7  0.0000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  25.74 
 
 
563 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  22.66 
 
 
697 aa  78.2  0.0000000000005  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  21.78 
 
 
699 aa  77.4  0.0000000000008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.29 
 
 
515 aa  77.4  0.0000000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.8 
 
 
1132 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.37 
 
 
556 aa  76.6  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  24.04 
 
 
554 aa  77  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  24.24 
 
 
1150 aa  75.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.85 
 
 
545 aa  75.5  0.000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2587  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.65 
 
 
658 aa  74.3  0.000000000007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.16 
 
 
526 aa  72  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.22 
 
 
537 aa  70.1  0.0000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.78 
 
 
1152 aa  70.1  0.0000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.69 
 
 
572 aa  70.1  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 
548 aa  69.7  0.0000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  24.58 
 
 
569 aa  68.2  0.0000000005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.66 
 
 
666 aa  67.8  0.0000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  25.35 
 
 
533 aa  65.9  0.000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1005  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.57 
 
 
503 aa  65.5  0.000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.374818  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.23 
 
 
545 aa  64.7  0.000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  25.78 
 
 
556 aa  64.7  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1022  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 
476 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.980314  normal  0.873475 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1032  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 
476 aa  64.3  0.000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0392411  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5384  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 
660 aa  63.9  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.99 
 
 
518 aa  63.5  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.72 
 
 
531 aa  63.5  0.00000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.11 
 
 
553 aa  63.5  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.84 
 
 
550 aa  63.5  0.00000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4435  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.06 
 
 
524 aa  62.8  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.67 
 
 
786 aa  63.2  0.00000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  23.87 
 
 
1152 aa  62.4  0.00000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.73 
 
 
433 aa  62  0.00000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4961  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 
529 aa  62  0.00000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  24.91 
 
 
564 aa  61.2  0.00000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5694  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
533 aa  60.1  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00839978 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3758  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
533 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4610  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
533 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0233056 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.04 
 
 
526 aa  60.5  0.0000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
553 aa  60.5  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.3 
 
 
550 aa  59.7  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  26.49 
 
 
567 aa  58.9  0.0000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1064  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.06 
 
 
525 aa  58.5  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.113781 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  24.66 
 
 
563 aa  58.2  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.46 
 
 
583 aa  57.8  0.0000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
546 aa  56.6  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381853  normal  0.587833 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>