240 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_2199 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  63.67 
 
 
562 aa  666    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  63.27 
 
 
657 aa  728    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  64.13 
 
 
577 aa  684    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  62.74 
 
 
578 aa  699    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  62.3 
 
 
622 aa  713    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  65.26 
 
 
556 aa  652    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
567 aa  1158    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.11 
 
 
623 aa  654    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  62.76 
 
 
564 aa  678    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.14 
 
 
583 aa  645    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  62.83 
 
 
591 aa  707    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  65.85 
 
 
563 aa  681    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  60.39 
 
 
569 aa  660    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  62.3 
 
 
563 aa  673    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  63.86 
 
 
570 aa  701    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  62.83 
 
 
591 aa  707    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  60.81 
 
 
578 aa  687    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  62.77 
 
 
591 aa  708    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  63.42 
 
 
586 aa  690    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  59.93 
 
 
578 aa  674    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  60.85 
 
 
581 aa  634  1e-180  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  59.51 
 
 
577 aa  630  1e-179  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.66 
 
 
557 aa  625  1e-178  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  59.16 
 
 
587 aa  626  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.02 
 
 
593 aa  623  1e-177  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.81 
 
 
582 aa  617  1e-175  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  57.72 
 
 
565 aa  576  1.0000000000000001e-163  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  60.71 
 
 
567 aa  575  1.0000000000000001e-163  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.29 
 
 
562 aa  564  1.0000000000000001e-159  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 
546 aa  476  1e-133  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.27 
 
 
556 aa  443  1e-123  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 
543 aa  439  9.999999999999999e-123  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.04 
 
 
537 aa  440  9.999999999999999e-123  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  46.93 
 
 
632 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.09 
 
 
543 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  48.04 
 
 
540 aa  438  1e-121  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  46.93 
 
 
632 aa  437  1e-121  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  46.93 
 
 
632 aa  438  1e-121  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  46.74 
 
 
552 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  46.74 
 
 
653 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  46.74 
 
 
632 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  46.74 
 
 
632 aa  434  1e-120  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  46.55 
 
 
696 aa  430  1e-119  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  48.97 
 
 
547 aa  429  1e-119  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.37 
 
 
786 aa  191  2.9999999999999997e-47  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  32.38 
 
 
889 aa  175  1.9999999999999998e-42  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  31.71 
 
 
533 aa  174  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.11 
 
 
1132 aa  139  2e-31  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.21 
 
 
1152 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  29.71 
 
 
1152 aa  134  3e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.2 
 
 
572 aa  132  1.0000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 
552 aa  115  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.82 
 
 
1150 aa  114  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  31.33 
 
 
1150 aa  114  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.61 
 
 
551 aa  111  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  27.59 
 
 
554 aa  106  9e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.2 
 
 
515 aa  97.8  5e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.41 
 
 
526 aa  96.3  1e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.5 
 
 
553 aa  90.5  8e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  29.38 
 
 
513 aa  87  9e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.95 
 
 
550 aa  85.5  0.000000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.04 
 
 
527 aa  83.2  0.00000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.95 
 
 
528 aa  80.1  0.0000000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.87 
 
 
520 aa  76.3  0.000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.59 
 
 
528 aa  75.1  0.000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  30.03 
 
 
547 aa  75.1  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.63 
 
 
527 aa  73.2  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  28.3 
 
 
543 aa  73.2  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  28.17 
 
 
544 aa  72  0.00000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  26.93 
 
 
534 aa  72  0.00000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.45 
 
 
522 aa  72  0.00000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.31 
 
 
535 aa  71.2  0.00000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.45 
 
 
528 aa  70.9  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  25.72 
 
 
547 aa  70.5  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
573 aa  69.7  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  25.67 
 
 
502 aa  69.3  0.0000000002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.77 
 
 
470 aa  68.9  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.95 
 
 
556 aa  68.2  0.0000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  29.06 
 
 
538 aa  68.2  0.0000000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  25.48 
 
 
1146 aa  67.8  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 
522 aa  67.8  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.51 
 
 
548 aa  66.2  0.000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.77 
 
 
522 aa  66.6  0.000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.77 
 
 
547 aa  65.1  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  27.81 
 
 
543 aa  65.1  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.02 
 
 
530 aa  64.3  0.000000006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  26.92 
 
 
546 aa  63.2  0.00000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.18 
 
 
523 aa  62.8  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
533 aa  62.4  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.72 
 
 
539 aa  62.4  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.58 
 
 
573 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.57 
 
 
549 aa  61.6  0.00000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.7 
 
 
522 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.7 
 
 
522 aa  61.6  0.00000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  25.46 
 
 
521 aa  61.2  0.00000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
522 aa  60.5  0.00000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3164  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.89 
 
 
563 aa  59.7  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.115784  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.56 
 
 
505 aa  59.7  0.0000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.15 
 
 
541 aa  59.7  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  25.26 
 
 
539 aa  59.3  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>