179 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Xcel_2031 on replicon NC_013530
Organism: Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  59.49 
 
 
622 aa  649    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  62.31 
 
 
569 aa  701    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  59.7 
 
 
657 aa  651    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  61.56 
 
 
557 aa  654    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  60.99 
 
 
591 aa  679    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.57 
 
 
570 aa  651    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  60.99 
 
 
591 aa  679    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  60.87 
 
 
578 aa  678    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  61.16 
 
 
591 aa  681    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  60.88 
 
 
578 aa  669    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  58.05 
 
 
577 aa  655    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  63.03 
 
 
563 aa  680    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 
593 aa  1188    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  59.97 
 
 
578 aa  665    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  62.52 
 
 
562 aa  642    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  62.41 
 
 
564 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.86 
 
 
623 aa  632  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  60.27 
 
 
581 aa  625  1e-178  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  62.1 
 
 
563 aa  622  1e-177  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  59.53 
 
 
567 aa  624  1e-177  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.22 
 
 
583 aa  620  1e-176  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  58.72 
 
 
586 aa  620  1e-176  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  56.62 
 
 
587 aa  614  9.999999999999999e-175  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  61.86 
 
 
556 aa  610  1e-173  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  58.28 
 
 
577 aa  603  1.0000000000000001e-171  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  59.63 
 
 
582 aa  598  1e-170  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  60.92 
 
 
562 aa  559  1e-158  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  58.96 
 
 
567 aa  544  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.26 
 
 
565 aa  516  1.0000000000000001e-145  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.99 
 
 
546 aa  438  1e-121  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  47.5 
 
 
540 aa  425  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  44.44 
 
 
552 aa  410  1e-113  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  44.3 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  44.3 
 
 
653 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  44.3 
 
 
632 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  44.36 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  44.3 
 
 
632 aa  410  1e-113  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  44.3 
 
 
632 aa  411  1e-113  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.97 
 
 
543 aa  410  1e-113  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.72 
 
 
543 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  44.44 
 
 
696 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  46.84 
 
 
547 aa  401  9.999999999999999e-111  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.51 
 
 
537 aa  394  1e-108  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  43.04 
 
 
556 aa  390  1e-107  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 
889 aa  192  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.59 
 
 
572 aa  182  2e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.36 
 
 
786 aa  179  9e-44  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  28.95 
 
 
554 aa  150  7e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  29.64 
 
 
533 aa  147  7.0000000000000006e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  27.7 
 
 
1150 aa  123  8e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.08 
 
 
1152 aa  114  5e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.5 
 
 
1132 aa  112  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.35 
 
 
552 aa  102  2e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 
1150 aa  97.4  6e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  32.26 
 
 
513 aa  96.7  1e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  26.82 
 
 
530 aa  93.6  8e-18  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  27.29 
 
 
543 aa  93.2  1e-17  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  27.68 
 
 
502 aa  87  0.000000000000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.88 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.88 
 
 
522 aa  86.3  0.000000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  30.79 
 
 
546 aa  85.9  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.1 
 
 
1152 aa  80.5  0.00000000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.04 
 
 
522 aa  80.5  0.00000000000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.35 
 
 
526 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  29.56 
 
 
551 aa  79.7  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.41 
 
 
535 aa  77.8  0.0000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.82 
 
 
556 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.62 
 
 
470 aa  76.3  0.000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.13 
 
 
522 aa  74.7  0.000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.06 
 
 
553 aa  74.7  0.000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.73 
 
 
528 aa  73.9  0.000000000009  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  28.74 
 
 
547 aa  73.6  0.000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  24.42 
 
 
534 aa  72.8  0.00000000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  29.23 
 
 
543 aa  70.1  0.0000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.2 
 
 
515 aa  68.6  0.0000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.39 
 
 
527 aa  68.2  0.0000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.81 
 
 
526 aa  67.8  0.0000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 
534 aa  67.8  0.0000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  27.41 
 
 
538 aa  67  0.0000000009  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  29.07 
 
 
544 aa  65.5  0.000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  28.85 
 
 
528 aa  64.3  0.000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 
532 aa  64.7  0.000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 
528 aa  64.3  0.000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.88 
 
 
572 aa  63.5  0.000000009  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  24.37 
 
 
532 aa  63.5  0.00000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  24.87 
 
 
547 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.98 
 
 
522 aa  61.6  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.46 
 
 
563 aa  61.2  0.00000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.87 
 
 
501 aa  61.2  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.73 
 
 
527 aa  61.2  0.00000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  25.67 
 
 
549 aa  59.3  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.59 
 
 
523 aa  58.9  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  27.69 
 
 
541 aa  59.3  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.09 
 
 
505 aa  59.7  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.57 
 
 
566 aa  57.8  0.0000006  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.33 
 
 
561 aa  57.8  0.0000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1534  FAD dependent oxidoreductase  46.15 
 
 
510 aa  57.4  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.419811  normal  0.0375492 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1856  dehydrogenase, homolog  46.15 
 
 
502 aa  57.4  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.584342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.79 
 
 
522 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4678  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.66 
 
 
545 aa  57  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>