More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcur_1996 on replicon NC_013510
Organism: Thermomonospora curvata DSM 43183



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 786 aa  1575    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  58.15 
 
 		 889 aa  639    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  55.26 
 
 		 572 aa  570  1e-161  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  42.45 
 
 		 554 aa  357  5e-97  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  32.42 
 
 		 1150 aa  321  3e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.77 
 
 		 1150 aa  308  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  31.06 
 
 		 1152 aa  274  4.0000000000000004e-72  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  35.14 
 
 		 533 aa  236  2.0000000000000002e-60  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.56 
 
 		 583 aa  212  2e-53  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.7 
 
 		 623 aa  212  2e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  32.92 
 
 		 657 aa  211  4e-53  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.1 
 
 		 543 aa  210  8e-53  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  32.75 
 
 		 547 aa  207  6e-52  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.75 
 
 		 543 aa  207  8e-52  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  31.57 
 
 		 578 aa  204  4e-51  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  31.87 
 
 		 578 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  31.21 
 
 		 578 aa  199  1.0000000000000001e-49  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  32.52 
 
 		 577 aa  200  1.0000000000000001e-49  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  33.63 
 
 		 567 aa  199  2.0000000000000003e-49  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 591 aa  197  4.0000000000000005e-49  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 591 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  29.88 
 
 		 591 aa  197  5.000000000000001e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.32 
 
 		 569 aa  197  8.000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.86 
 
 		 570 aa  196  1e-48  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 		 564 aa  194  5e-48  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  31.67 
 
 		 622 aa  194  6e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.85 
 
 		 582 aa  187  8e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.79 
 
 		 586 aa  186  1.0000000000000001e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 563 aa  185  2.0000000000000003e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.52 
 
 		 1132 aa  183  9.000000000000001e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.71 
 
 		 1152 aa  180  9e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.84 
 
 		 557 aa  179  1e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.86 
 
 		 565 aa  177  5e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.44 
 
 		 593 aa  176  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  30.09 
 
 		 632 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  29.79 
 
 		 632 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  30.09 
 
 		 632 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  29.79 
 
 		 632 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  29.79 
 
 		 653 aa  174  5e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  30.09 
 
 		 632 aa  174  5.999999999999999e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 567 aa  174  6.999999999999999e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  31.48 
 
 		 562 aa  172  2e-41  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  30.8 
 
 		 581 aa  171  3e-41  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  32.16 
 
 		 563 aa  171  6e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  30.03 
 
 		 696 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.73 
 
 		 546 aa  165  3e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  29.33 
 
 		 577 aa  164  8.000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  29.17 
 
 		 552 aa  163  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  31.58 
 
 		 556 aa  162  3e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.06 
 
 		 537 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  27.29 
 
 		 1146 aa  160  9e-38  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 587 aa  160  1e-37  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.1 
 
 		 556 aa  157  7e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.4 
 
 		 562 aa  145  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  34.93 
 
 		 540 aa  144  8e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.94 
 
 		 526 aa  143  9.999999999999999e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  29.13 
 
 		 551 aa  140  7e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.54 
 
 		 552 aa  137  5e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.52 
 
 		 535 aa  134  6.999999999999999e-30  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  27.78 
 
 		 541 aa  127  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.97 
 
 		 550 aa  124  6e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.84 
 
 		 515 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  28.05 
 
 		 543 aa  107  9e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  32.46 
 
 		 513 aa  103  1e-20  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1894  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.64 
 
 		 562 aa  95.9  3e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.474294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.96 
 
 		 511 aa  94.4  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.83 
 
 		 512 aa  93.2  1e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0139738  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  27.61 
 
 		 502 aa  92  4e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  32.27 
 
 		 538 aa  89.7  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3189  hypothetical protein  32.37 
 
 		 210 aa  89  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00130632 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  29.43 
 
 		 544 aa  87  0.000000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  28.35 
 
 		 530 aa  85.9  0.000000000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.78 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1486  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.87 
 
 		 512 aa  84.3  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0109467  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.29 
 
 		 522 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.29 
 
 		 522 aa  84  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1793  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 		 592 aa  82.8  0.00000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.345818  normal  0.124135 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  27.35 
 
 		 546 aa  82.8  0.00000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4120  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.28 
 
 		 592 aa  82.4  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3646  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.28 
 
 		 592 aa  82  0.00000000000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4639  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.28 
 
 		 592 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 		 527 aa  80.1  0.0000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.32 
 
 		 592 aa  80.5  0.0000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4142  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.12 
 
 		 592 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00267636  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  23.04 
 
 		 521 aa  79.3  0.0000000000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4224  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.12 
 
 		 592 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.477307  normal  0.178232 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3293  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.12 
 
 		 592 aa  79.7  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.517523  normal  0.855973 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0176  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.07 
 
 		 516 aa  79  0.0000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.326869  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.7 
 
 		 556 aa  78.6  0.0000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.87 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.44 
 
 		 553 aa  77.8  0.0000000000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  29.17 
 
 		 543 aa  77.4  0.0000000000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  22.03 
 
 		 534 aa  77  0.000000000001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  27.14 
 
 		 547 aa  77.4  0.000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3166  putative dehydrogenase transmembrane protein  23.41 
 
 		 506 aa  77  0.000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.689634  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2044  GMC family oxidoreductase  24.19 
 
 		 494 aa  75.1  0.000000000005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.84528  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.79 
 
 		 522 aa  75.1  0.000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.64 
 
 		 549 aa  74.7  0.000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 		 534 aa  74.7  0.000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>