247 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3274 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  76.82 
 
 		 540 aa  816    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  93.97 
 
 		 547 aa  1002    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  97.61 
 
 		 543 aa  1038    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 543 aa  1087    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50 
 
 		 556 aa  488  1e-136  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4226  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.86 
 
 		 546 aa  484  1e-135  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.130746  normal  0.16895 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2022  putative cholesterol oxidase  48.22 
 
 		 552 aa  462  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1417  GMC oxidoreductase family protein  48.41 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3202  GMC oxidoreductase  48.41 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3075  GMC oxidoreductase  48.41 
 
 		 632 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2309  iron-sulfur cluster-binding domain-containing protein  47.87 
 
 		 696 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1045  GMC oxidoreductase  48.22 
 
 		 653 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1332  putative cholesterol oxidase  48.22 
 
 		 632 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2312  GMC oxidoreductase  48.22 
 
 		 632 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.943263  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  49.35 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  49.35 
 
 		 591 aa  456  1e-127  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  49.35 
 
 		 591 aa  457  1e-127  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.91 
 
 		 583 aa  449  1e-125  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0464  FAD dependent oxidoreductase  49.45 
 
 		 657 aa  449  1e-125  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.558205  normal  0.214983 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.83 
 
 		 623 aa  449  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  48.55 
 
 		 564 aa  446  1.0000000000000001e-124  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  47.7 
 
 		 578 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  48.82 
 
 		 622 aa  439  9.999999999999999e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  47.58 
 
 		 578 aa  436  1e-121  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3834  FAD dependent oxidoreductase  49.72 
 
 		 563 aa  437  1e-121  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.551048  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  47.33 
 
 		 578 aa  437  1e-121  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.47 
 
 		 557 aa  432  1e-120  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0318  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.4 
 
 		 537 aa  431  1e-119  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2922  FAD dependent oxidoreductase  48.99 
 
 		 577 aa  424  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0000517221  hitchhiker  0.0000805295 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2199  FAD dependent oxidoreductase  50.09 
 
 		 567 aa  420  1e-116  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  46.67 
 
 		 587 aa  420  1e-116  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_13500  choline dehydrogenase-like flavoprotein  47.88 
 
 		 569 aa  420  1e-116  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3632  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.79 
 
 		 570 aa  417  9.999999999999999e-116  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0908  FAD dependent oxidoreductase  46.41 
 
 		 577 aa  413  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.294321  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1204  FAD dependent oxidoreductase  48.01 
 
 		 581 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0651029  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  49.16 
 
 		 562 aa  403  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.633158  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3546  fumarate reductase/succinate dehydrogenase flavoprotein domain protein  50.09 
 
 		 567 aa  400  9.999999999999999e-111  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0166931 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1176  hypothetical protein  49.26 
 
 		 563 aa  399  1e-109  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.5 
 
 		 593 aa  395  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.394863  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4248  glucose-methanol-choline oxidoreductase  46.89 
 
 		 586 aa  382  1e-105  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1382  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.18 
 
 		 582 aa  381  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.38855  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0628  FAD dependent oxidoreductase  48.07 
 
 		 556 aa  371  1e-101  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  45.79 
 
 		 565 aa  359  6e-98  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6532  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.77 
 
 		 562 aa  357  2.9999999999999997e-97  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243842  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.1 
 
 		 786 aa  216  9.999999999999999e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1255  FAD dependent oxidoreductase  33.45 
 
 		 889 aa  206  6e-52  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5037  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.06 
 
 		 572 aa  190  7e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.565725 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4475  GMC oxidoreductase  30.07 
 
 		 554 aa  156  1e-36  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00299763 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3191  cholesterol oxidase  37.54 
 
 		 533 aa  148  3e-34  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000455037 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0826  cholesterol oxidase  27.09 
 
 		 502 aa  136  9.999999999999999e-31  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.492238  unclonable  0.0000140216 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  34.29 
 
 		 1150 aa  131  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4774  Cholesterol oxidase  28.01 
 
 		 530 aa  127  5e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.57937  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.48 
 
 		 1150 aa  125  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2398  Cholesterol oxidase  31.23 
 
 		 538 aa  120  6e-26  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0159697  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4847  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.19 
 
 		 1152 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000971365  normal  0.0494922 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.11 
 
 		 1132 aa  114  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.92 
 
 		 526 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.65 
 
 		 552 aa  111  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2611  cholesterol oxidase  28.81 
 
 		 543 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2399  Cholesterol oxidase  33.53 
 
 		 513 aa  108  2e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.220854  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1816  hypothetical protein  33.44 
 
 		 1152 aa  108  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.649165 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3901  cholesterol oxidase  26.39 
 
 		 541 aa  106  9e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0511249 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0069  cholesterol oxidase  25.48 
 
 		 534 aa  104  5e-21  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2810  cholesterol oxidase  27.92 
 
 		 543 aa  101  3e-20  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00131697 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3356  cholesterol oxidase  26.85 
 
 		 544 aa  100  8e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  27.29 
 
 		 551 aa  97.4  6e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30650  choline dehydrogenase-like flavoprotein  29.49 
 
 		 534 aa  97.4  6e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.104777  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4246  Cholesterol oxidase  31.53 
 
 		 547 aa  93.2  1e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.191663 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.58 
 
 		 556 aa  90.5  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5961  Cholesterol oxidase  30.28 
 
 		 546 aa  89  2e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  27.2 
 
 		 515 aa  88.6  3e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.7 
 
 		 535 aa  82.4  0.00000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  27.27 
 
 		 563 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.61 
 
 		 573 aa  81.6  0.00000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2425  Cholesterol oxidase  31.07 
 
 		 543 aa  80.9  0.00000000000005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.939121  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.09 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.09 
 
 		 563 aa  79.7  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.68 
 
 		 520 aa  79  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  22.71 
 
 		 697 aa  79  0.0000000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1840  GMC oxidoreductase  24.87 
 
 		 534 aa  78.6  0.0000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000489986  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 		 550 aa  77  0.0000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.92 
 
 		 573 aa  76.3  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.67 
 
 		 470 aa  76.6  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  22.65 
 
 		 699 aa  74.7  0.000000000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.4 
 
 		 518 aa  73.9  0.000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 547 aa  72  0.00000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  24.17 
 
 		 547 aa  71.2  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.03 
 
 		 548 aa  71.2  0.00000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  26.87 
 
 		 549 aa  69.7  0.0000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.87 
 
 		 533 aa  70.1  0.0000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.35 
 
 		 522 aa  67.4  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05037  conserved hypothetical protein  24.96 
 
 		 1146 aa  66.6  0.000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3535  Cholesterol oxidase  30.43 
 
 		 533 aa  65.9  0.000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.98 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  27.89 
 
 		 570 aa  65.1  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.98 
 
 		 522 aa  65.1  0.000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6104  dehydrogenase  24.58 
 
 		 521 aa  64.7  0.000000005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.41 
 
 		 547 aa  63.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.67 
 
 		 527 aa  63.5  0.00000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.78 
 
 		 548 aa  62  0.00000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>