213 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_90828 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  60 
 
 		 697 aa  900    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  100 
 
 		 699 aa  1464    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  33.88 
 
 		 745 aa  360  4e-98  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  29.51 
 
 		 786 aa  277  6e-73  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5384  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.47 
 
 		 660 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3053  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.9 
 
 		 648 aa  198  3e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.181626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.22 
 
 		 657 aa  190  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.73 
 
 		 666 aa  183  9.000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2587  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.7 
 
 		 658 aa  178  3e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.43 
 
 		 541 aa  164  6e-39  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  24.24 
 
 		 532 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.86 
 
 		 532 aa  161  5e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.48 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.81 
 
 		 532 aa  157  8e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  25.69 
 
 		 531 aa  148  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.82 
 
 		 537 aa  148  3e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.19 
 
 		 531 aa  148  4.0000000000000006e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  23.76 
 
 		 539 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  25.59 
 
 		 530 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.49 
 
 		 520 aa  143  9.999999999999999e-33  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.03 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.62 
 
 		 529 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.09 
 
 		 531 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.09 
 
 		 531 aa  134  7.999999999999999e-30  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.09 
 
 		 531 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.09 
 
 		 531 aa  133  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.2 
 
 		 531 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  25.25 
 
 		 629 aa  132  3e-29  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.11 
 
 		 529 aa  127  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.11 
 
 		 530 aa  127  8.000000000000001e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.24 
 
 		 555 aa  127  9e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.2 
 
 		 531 aa  126  1e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.43 
 
 		 532 aa  125  3e-27  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  22.57 
 
 		 533 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.83 
 
 		 531 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.02 
 
 		 532 aa  120  6e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.27 
 
 		 533 aa  115  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.27 
 
 		 533 aa  114  5e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.27 
 
 		 533 aa  114  6e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  22.65 
 
 		 563 aa  112  3e-23  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.79 
 
 		 505 aa  109  1e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.58 
 
 		 506 aa  108  4e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.2 
 
 		 526 aa  94.7  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.29 
 
 		 470 aa  87.8  6e-16  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.64 
 
 		 522 aa  87.4  8e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.86 
 
 		 528 aa  85.1  0.000000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.24 
 
 		 528 aa  82  0.00000000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.78 
 
 		 527 aa  77.4  0.0000000000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.59 
 
 		 522 aa  75.9  0.000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.1 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.1 
 
 		 522 aa  75.5  0.000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  22.57 
 
 		 547 aa  73.9  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.16 
 
 		 552 aa  73.2  0.00000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.74 
 
 		 522 aa  70.9  0.00000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.45 
 
 		 556 aa  69.3  0.0000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  21.52 
 
 		 540 aa  68.2  0.0000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.08 
 
 		 543 aa  67.4  0.0000000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.66 
 
 		 534 aa  67.4  0.0000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  22.5 
 
 		 562 aa  66.6  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  22.9 
 
 		 522 aa  66.6  0.000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  22.76 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  22.2 
 
 		 523 aa  65.5  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  22.76 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  22.76 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  22.76 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.4 
 
 		 523 aa  65.1  0.000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.96 
 
 		 711 aa  64.7  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.19 
 
 		 527 aa  64.7  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  22.48 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  22.48 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  22.48 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.71 
 
 		 522 aa  63.9  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21 
 
 		 433 aa  63.2  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0294  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.89 
 
 		 666 aa  62  0.00000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1514  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 578 aa  60.8  0.00000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.384114  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.04 
 
 		 526 aa  60.1  0.0000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4906  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 578 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.238026  normal  0.475167 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3130  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.53 
 
 		 1182 aa  59.7  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.456841  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  22.85 
 
 		 531 aa  59.3  0.0000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  23.13 
 
 		 522 aa  59.7  0.0000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  22.69 
 
 		 528 aa  59.3  0.0000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.95 
 
 		 518 aa  59.3  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  36.19 
 
 		 578 aa  58.5  0.0000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  24.46 
 
 		 565 aa  58.5  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_37100  putative dehydrogenase  22.46 
 
 		 545 aa  58.5  0.0000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.57 
 
 		 539 aa  58.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  22.22 
 
 		 564 aa  58.2  0.0000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0361  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.9 
 
 		 556 aa  57.8  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.252753 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1728  FAD dependent oxidoreductase  24.56 
 
 		 587 aa  57.8  0.0000007  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.916893  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  43.94 
 
 		 647 aa  57.4  0.0000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.28 
 
 		 579 aa  57.4  0.0000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1170  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 591 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1187  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 591 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1197  FAD dependent oxidoreductase  35.24 
 
 		 591 aa  57  0.000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.030101 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.2 
 
 		 527 aa  56.2  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3542  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.64 
 
 		 563 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  23.3 
 
 		 565 aa  55.8  0.000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0054  GMC oxidoreductase  22.44 
 
 		 556 aa  56.6  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.810146  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3099  choline dehydrogenase  22.61 
 
 		 562 aa  55.5  0.000004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>