More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TBFG_10500 on replicon NC_009565
Organism: Mycobacterium tuberculosis F11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  100 
 
 
629 aa  1236    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  44.2 
 
 
506 aa  285  2.0000000000000002e-75  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.45 
 
 
505 aa  243  1e-62  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.64 
 
 
526 aa  189  1e-46  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.93 
 
 
541 aa  186  1.0000000000000001e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.88 
 
 
520 aa  182  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.47 
 
 
532 aa  182  2e-44  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  31.52 
 
 
539 aa  177  5e-43  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.14 
 
 
532 aa  177  7e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.25 
 
 
657 aa  177  8e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  28.38 
 
 
745 aa  176  9.999999999999999e-43  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  29.33 
 
 
532 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.33 
 
 
531 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.22 
 
 
532 aa  174  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.33 
 
 
531 aa  173  6.999999999999999e-42  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  29.85 
 
 
533 aa  173  9e-42  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.12 
 
 
531 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.54 
 
 
541 aa  172  2e-41  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.12 
 
 
531 aa  172  2e-41  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.64 
 
 
533 aa  172  2e-41  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.08 
 
 
530 aa  171  3e-41  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.71 
 
 
532 aa  171  6e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.42 
 
 
533 aa  169  1e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.96 
 
 
532 aa  167  4e-40  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.21 
 
 
533 aa  167  5.9999999999999996e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.47 
 
 
555 aa  165  2.0000000000000002e-39  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.8 
 
 
539 aa  164  4.0000000000000004e-39  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.61 
 
 
531 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29 
 
 
529 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 
531 aa  164  6e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  26.86 
 
 
697 aa  163  7e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.21 
 
 
537 aa  163  1e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  28.76 
 
 
530 aa  159  1e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.7 
 
 
531 aa  159  1e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.06 
 
 
529 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  28.76 
 
 
531 aa  157  8e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5384  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.79 
 
 
660 aa  155  2e-36  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.33 
 
 
531 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2587  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.01 
 
 
658 aa  149  1.0000000000000001e-34  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  29.28 
 
 
563 aa  148  3e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.11 
 
 
470 aa  140  7e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  25.15 
 
 
699 aa  138  3.0000000000000003e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3053  glucose-methanol-choline oxidoreductase  35.47 
 
 
648 aa  137  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.181626  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.43 
 
 
666 aa  130  9.000000000000001e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.21 
 
 
711 aa  118  3e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  26.63 
 
 
786 aa  115  2.0000000000000002e-24  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.56 
 
 
433 aa  114  6e-24  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0294  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.69 
 
 
666 aa  114  7.000000000000001e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.6 
 
 
556 aa  99.8  1e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.73 
 
 
545 aa  97.1  1e-18  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  29.08 
 
 
515 aa  95.9  2e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27 
 
 
535 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.38 
 
 
526 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.12 
 
 
552 aa  88.6  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3130  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.05 
 
 
1182 aa  88.2  4e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.456841  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  25.77 
 
 
551 aa  86.7  0.000000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.41 
 
 
547 aa  86.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.94 
 
 
573 aa  85.1  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.28 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.77 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.49 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.77 
 
 
522 aa  85.5  0.000000000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.92 
 
 
573 aa  84.7  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 
556 aa  84.3  0.000000000000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 
556 aa  84  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.58 
 
 
526 aa  84  0.000000000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.73 
 
 
550 aa  84  0.000000000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 
536 aa  83.6  0.00000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.93 
 
 
1150 aa  82.4  0.00000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 
538 aa  82.4  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2232  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.2 
 
 
510 aa  82.8  0.00000000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.209802  normal  0.202883 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
518 aa  80.9  0.00000000000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.07 
 
 
526 aa  80.9  0.00000000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.97 
 
 
527 aa  80.1  0.0000000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.14 
 
 
522 aa  79  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_003296  RS05823  hypothetical protein  25.4 
 
 
1150 aa  78.2  0.0000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.483181 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.95 
 
 
547 aa  77.4  0.0000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.45 
 
 
531 aa  76.3  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.23 
 
 
534 aa  76.3  0.000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  28.9 
 
 
539 aa  75.9  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4446  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.89 
 
 
583 aa  75.5  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  28.27 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  28.27 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  28.27 
 
 
563 aa  74.7  0.000000000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3801  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 
545 aa  74.7  0.000000000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.382943 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.9 
 
 
522 aa  74.3  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.29 
 
 
548 aa  73.2  0.00000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1854  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.14 
 
 
534 aa  73.6  0.00000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.138166  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3746  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.94 
 
 
557 aa  72.4  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.01 
 
 
553 aa  72.8  0.00000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.81 
 
 
527 aa  72  0.00000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  28.69 
 
 
549 aa  71.6  0.00000000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3525  putative glucose-methanol-choline (GMC)oxidoreductase  24.07 
 
 
534 aa  71.2  0.00000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.100064 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.26 
 
 
533 aa  71.2  0.00000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.34 
 
 
540 aa  70.9  0.00000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.19 
 
 
528 aa  70.5  0.00000000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 
623 aa  70.5  0.00000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.2 
 
 
522 aa  69.7  0.0000000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5113  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.27 
 
 
1132 aa  69.7  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.302627  hitchhiker  0.00736765 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.55 
 
 
548 aa  70.1  0.0000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>