More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48204 on replicon NC_011684
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  100 
 
 		 786 aa  1630    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  29.51 
 
 		 699 aa  290  1e-76  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  36.12 
 
 		 666 aa  279  1e-73  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  31.05 
 
 		 745 aa  266  8.999999999999999e-70  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  28.1 
 
 		 697 aa  244  5e-63  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5384  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.44 
 
 		 660 aa  243  1e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.97 
 
 		 657 aa  213  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3053  glucose-methanol-choline oxidoreductase  33.94 
 
 		 648 aa  211  3e-53  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.181626  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2587  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.11 
 
 		 658 aa  198  2.0000000000000003e-49  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.8 
 
 		 532 aa  194  5e-48  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  30.61 
 
 		 532 aa  192  2e-47  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.43 
 
 		 532 aa  191  4e-47  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.51 
 
 		 532 aa  181  7e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.63 
 
 		 532 aa  173  1e-41  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  27.81 
 
 		 539 aa  167  5e-40  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.29 
 
 		 541 aa  164  8.000000000000001e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 		 539 aa  161  4e-38  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.8 
 
 		 531 aa  157  6e-37  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.67 
 
 		 541 aa  156  2e-36  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.31 
 
 		 531 aa  152  2e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.33 
 
 		 537 aa  150  6e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.41 
 
 		 531 aa  145  2e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  28.46 
 
 		 531 aa  146  2e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.41 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.6 
 
 		 531 aa  145  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.73 
 
 		 555 aa  145  3e-33  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  28.22 
 
 		 530 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.41 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.93 
 
 		 532 aa  143  9.999999999999999e-33  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.57 
 
 		 520 aa  140  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  27.68 
 
 		 533 aa  140  1e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.87 
 
 		 529 aa  140  1e-31  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28 
 
 		 533 aa  138  5e-31  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.51 
 
 		 533 aa  137  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 		 531 aa  136  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.81 
 
 		 533 aa  135  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  26.53 
 
 		 563 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.69 
 
 		 529 aa  128  4.0000000000000003e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.29 
 
 		 530 aa  128  5e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.34 
 
 		 506 aa  120  9e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  28.13 
 
 		 629 aa  119  1.9999999999999998e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.14 
 
 		 526 aa  119  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.55 
 
 		 505 aa  113  2.0000000000000002e-23  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3130  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.86 
 
 		 1182 aa  100  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.456841  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.75 
 
 		 526 aa  91.3  6e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  24.81 
 
 		 551 aa  91.3  7e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.45 
 
 		 552 aa  79.7  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4426  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.3 
 
 		 579 aa  80.1  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.47 
 
 		 515 aa  78.6  0.0000000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.97 
 
 		 573 aa  77.8  0.0000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0294  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.31 
 
 		 666 aa  77  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  23.99 
 
 		 563 aa  76.6  0.000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.05 
 
 		 534 aa  76.6  0.000000000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.62 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  23.81 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.84 
 
 		 548 aa  74.3  0.000000000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.16 
 
 		 547 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  23.81 
 
 		 563 aa  74.3  0.000000000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.39 
 
 		 546 aa  73.6  0.00000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.381853  normal  0.587833 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.94 
 
 		 470 aa  73.9  0.00000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.2 
 
 		 573 aa  73.2  0.00000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.94 
 
 		 556 aa  73.2  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.03 
 
 		 548 aa  72.8  0.00000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3136  choline dehydrogenase  24.86 
 
 		 531 aa  72  0.00000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  22.76 
 
 		 547 aa  70.1  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.75 
 
 		 556 aa  69.7  0.0000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.89 
 
 		 545 aa  68.9  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.89 
 
 		 550 aa  68.9  0.0000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.13 
 
 		 433 aa  68.2  0.0000000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.47 
 
 		 522 aa  67.8  0.0000000007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  23.12 
 
 		 509 aa  66.2  0.000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.76 
 
 		 556 aa  65.1  0.000000006  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2332  putative cholesterol oxidase  28.74 
 
 		 622 aa  64.7  0.000000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.15 
 
 		 526 aa  64.7  0.000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.75 
 
 		 535 aa  64.3  0.000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.53 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.11 
 
 		 528 aa  64.3  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3808  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.85 
 
 		 547 aa  63.5  0.00000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.605068  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  42.25 
 
 		 518 aa  63.2  0.00000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.5 
 
 		 550 aa  63.2  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.28 
 
 		 526 aa  62.8  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  43.75 
 
 		 547 aa  62  0.00000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4708  Choline dehydrogenase  21.35 
 
 		 513 aa  61.6  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.62 
 
 		 553 aa  61.6  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4810  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 534 aa  61.6  0.00000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  22.14 
 
 		 522 aa  61.2  0.00000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1031  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.6 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0121  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.67 
 
 		 623 aa  60.5  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.412208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.02 
 
 		 523 aa  60.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3371  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.68 
 
 		 698 aa  60.5  0.0000001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.261547  normal  0.556381 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2179  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.38 
 
 		 549 aa  60.1  0.0000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.96 
 
 		 527 aa  59.7  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1613  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.14 
 
 		 533 aa  59.3  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.604937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2394  glucose-methanol-choline oxidoreductase  40.91 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.330783  normal  0.0251072 
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  34.72 
 
 		 647 aa  58.9  0.0000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.34 
 
 		 522 aa  58.9  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.3 
 
 		 527 aa  58.9  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13443  cholesterol oxidase precursor choD  27.74 
 
 		 578 aa  58.2  0.0000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0394432  normal  0.107199 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5244  choline dehydrogenase  23.32 
 
 		 567 aa  57.8  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.80037  normal  0.0658003 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>