295 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32359 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  100 
 
 		 697 aa  1447    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  60 
 
 		 699 aa  900    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  32.51 
 
 		 745 aa  369  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  28.1 
 
 		 786 aa  231  4e-59  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5384  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.09 
 
 		 660 aa  198  2.0000000000000003e-49  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.21 
 
 		 666 aa  196  1e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3053  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.6 
 
 		 648 aa  196  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.181626  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.95 
 
 		 657 aa  191  5.999999999999999e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2587  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.3 
 
 		 658 aa  171  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 		 532 aa  158  3e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  26.76 
 
 		 629 aa  156  1e-36  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.91 
 
 		 532 aa  154  5e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.45 
 
 		 537 aa  154  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.42 
 
 		 541 aa  153  8.999999999999999e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  23.72 
 
 		 532 aa  153  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.47 
 
 		 541 aa  153  1e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.06 
 
 		 532 aa  152  3e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.9 
 
 		 531 aa  146  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  24.81 
 
 		 539 aa  146  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  25.1 
 
 		 530 aa  145  4e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.31 
 
 		 531 aa  144  5e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  24.61 
 
 		 531 aa  143  9.999999999999999e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 532 aa  138  3.0000000000000003e-31  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 520 aa  133  9e-30  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.28 
 
 		 529 aa  126  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.94 
 
 		 505 aa  126  1e-27  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.55 
 
 		 506 aa  124  7e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.52 
 
 		 539 aa  120  6e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.67 
 
 		 532 aa  114  5e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.42 
 
 		 530 aa  114  9e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.09 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.4 
 
 		 531 aa  110  7.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.65 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.09 
 
 		 531 aa  109  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.09 
 
 		 531 aa  108  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.81 
 
 		 531 aa  104  5e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  21.46 
 
 		 533 aa  102  3e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.27 
 
 		 529 aa  101  5e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  21.34 
 
 		 563 aa  99.4  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.03 
 
 		 555 aa  98.6  4e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.29 
 
 		 470 aa  98.6  4e-19  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.25 
 
 		 526 aa  96.3  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.35 
 
 		 522 aa  95.1  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.55 
 
 		 528 aa  93.2  1e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.45 
 
 		 533 aa  90.5  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  23.55 
 
 		 528 aa  89.7  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.45 
 
 		 533 aa  90.5  1e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  19.85 
 
 		 533 aa  90.1  1e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.86 
 
 		 522 aa  87.8  7e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.86 
 
 		 522 aa  87.8  7e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.64 
 
 		 527 aa  87.4  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.6 
 
 		 522 aa  87.4  9e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 		 523 aa  87  0.000000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.68 
 
 		 527 aa  85.5  0.000000000000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.72 
 
 		 522 aa  85.1  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.88 
 
 		 522 aa  83.6  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0665  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.87 
 
 		 534 aa  82  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  24.91 
 
 		 522 aa  80.1  0.0000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.14 
 
 		 522 aa  78.6  0.0000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  23.36 
 
 		 528 aa  77.4  0.0000000000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  22.41 
 
 		 523 aa  76.6  0.000000000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  21.07 
 
 		 540 aa  76.3  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3081  FAD dependent oxidoreductase  22.43 
 
 		 547 aa  75.9  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.590232  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  21.63 
 
 		 526 aa  73.2  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3274  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.24 
 
 		 543 aa  70.9  0.00000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0584608  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01675  putative dehydrogenase oxidoreductase protein  46.38 
 
 		 647 aa  69.7  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.871194 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2404  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 433 aa  69.3  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.14 
 
 		 573 aa  69.7  0.0000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.12 
 
 		 526 aa  67.4  0.0000000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1196  choline dehydrogenase  26.6 
 
 		 565 aa  67.4  0.0000000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000414657 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.88 
 
 		 711 aa  66.6  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0278  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase family protein  22.62 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.914416  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0062  GMC oxidoreductase  22.62 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0061  GMC oxidoreductase  22.62 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3180  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.78 
 
 		 543 aa  65.9  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.550088  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2659  GMC oxidoreductase  23.05 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0366  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.38 
 
 		 531 aa  66.2  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.136332  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1833  GMC oxidoreductase  23.05 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2719  GMC oxidoreductase  23.05 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.972032  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3294  GMC oxidoreductase  23.05 
 
 		 549 aa  66.2  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.38455  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1119  choline dehydrogenase  25 
 
 		 564 aa  64.7  0.000000005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0950  oxidoreductase, GMC family  22.54 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1066  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.54 
 
 		 415 aa  64.3  0.000000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  20.89 
 
 		 570 aa  63.5  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  20.66 
 
 		 556 aa  63.9  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  21.99 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007412  Ava_C0102  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.16 
 
 		 518 aa  62.8  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  21.99 
 
 		 563 aa  63.2  0.00000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1351  choline dehydrogenase  22.36 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.875987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1325  choline dehydrogenase  22.36 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2190  choline dehydrogenase, a flavoprotein  20.32 
 
 		 541 aa  62.4  0.00000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1315  choline dehydrogenase  22.36 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3035  choline dehydrogenase  22.36 
 
 		 561 aa  62.4  0.00000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.82163  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4010  choline dehydrogenase  20.95 
 
 		 561 aa  61.6  0.00000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0405578  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  21.99 
 
 		 563 aa  62  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4224  FAD dependent oxidoreductase  24.05 
 
 		 564 aa  60.1  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.174352 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.97 
 
 		 547 aa  60.5  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1007  choline dehydrogenase  25.62 
 
 		 565 aa  60.1  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2604  choline dehydrogenase  22.5 
 
 		 562 aa  59.3  0.0000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.142768 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  21.56 
 
 		 551 aa  59.3  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>