249 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bpro_4222 on replicon NC_007948
Organism: Polaromonas sp. JS666



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007908  Rfer_0548  glucose-methanol-choline oxidoreductase  75.42 
 
 		 539 aa  844    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4222  glucose-methanol-choline oxidoreductase  100 
 
 		 541 aa  1108    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.689308 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0434  glucose-methanol-choline oxidoreductase  84.1 
 
 		 541 aa  954    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0350  GMC family oxidoreductase  68.46 
 
 		 539 aa  765    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5172  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.88 
 
 		 532 aa  578  1e-164  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5122  GMC family oxidoreductase  53.5 
 
 		 532 aa  572  1.0000000000000001e-162  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  53.5 
 
 		 532 aa  571  1e-161  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0343  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.06 
 
 		 532 aa  567  1e-160  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  54.92 
 
 		 531 aa  555  1e-157  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.302864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4189  glucose-methanol-choline oxidoreductase  52.72 
 
 		 537 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0458  putative oxidoreductase  51.59 
 
 		 530 aa  526  1e-148  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3574  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.04 
 
 		 532 aa  527  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.31369  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3120  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.94 
 
 		 555 aa  527  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04780  oxidoreductase  51.5 
 
 		 531 aa  524  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0591  glucose-methanol-choline oxidoreductase  50.84 
 
 		 529 aa  513  1e-144  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.559544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3482  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.34 
 
 		 531 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0892  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.96 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0880  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.15 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0857  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.15 
 
 		 531 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0882  GMC family oxidoreductase  49.72 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.53 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3284  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.34 
 
 		 533 aa  502  1e-141  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3396  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.72 
 
 		 533 aa  504  1e-141  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3596  glucose-methanol-choline oxidoreductase  51.06 
 
 		 531 aa  499  1e-140  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2998  GMC family oxidoreductase  51.13 
 
 		 563 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3863  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.06 
 
 		 531 aa  498  1e-139  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0672  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.57 
 
 		 532 aa  498  1e-139  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.482202  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3286  glucose-methanol-choline oxidoreductase  47.83 
 
 		 529 aa  497  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3503  glucose-methanol-choline oxidoreductase  49.62 
 
 		 531 aa  498  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3184  glucose-methanol-choline oxidoreductase  48.3 
 
 		 530 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.275768  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4522  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.25 
 
 		 520 aa  214  4.9999999999999996e-54  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.464516  normal  0.3464 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4350  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.17 
 
 		 526 aa  206  9e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5384  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.36 
 
 		 660 aa  189  8e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  26.16 
 
 		 745 aa  185  2.0000000000000003e-45  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0994  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.16 
 
 		 505 aa  185  2.0000000000000003e-45  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0279763  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1198  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.65 
 
 		 506 aa  170  6e-41  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.016113  hitchhiker  0.00093802 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2587  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.96 
 
 		 658 aa  166  1.0000000000000001e-39  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90828  long chain fatty acid oxidase  25.43 
 
 		 699 aa  164  4.0000000000000004e-39  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.654464 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10500  oxidoreductase  28.54 
 
 		 629 aa  163  6e-39  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  6.63635e-27  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1347  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.37 
 
 		 666 aa  158  2e-37  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0384946  normal  0.0925593 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32359  long chain fatty acid oxidase  25.47 
 
 		 697 aa  153  8.999999999999999e-36  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.550643  normal  0.383222 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3885  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.04 
 
 		 657 aa  145  2e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0361695  normal  0.12202 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48204  predicted protein  26.1 
 
 		 786 aa  144  3e-33  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.3526  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3053  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.23 
 
 		 648 aa  136  8e-31  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.181626  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2937  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.33 
 
 		 711 aa  119  1.9999999999999998e-25  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0446461  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2097  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 		 470 aa  118  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  hitchhiker  0.00213522  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2085  glucose-methanol-choline oxidoreductase  28.42 
 
 		 573 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.024834 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  25.9 
 
 		 522 aa  108  2e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0664  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.63 
 
 		 515 aa  106  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.414473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.56 
 
 		 522 aa  106  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.6 
 
 		 527 aa  105  2e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5469  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.82 
 
 		 526 aa  104  5e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.17 
 
 		 573 aa  101  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3683  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.54 
 
 		 556 aa  96.3  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.642564  normal  0.0444916 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2722  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.09 
 
 		 528 aa  95.1  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2120  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.72 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2534  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  25.72 
 
 		 522 aa  94  6e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3130  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.76 
 
 		 1182 aa  93.6  8e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.456841  normal  0.396058 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.24 
 
 		 548 aa  92  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.68 
 
 		 522 aa  91.7  3e-17  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1401  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  24.45 
 
 		 528 aa  90.9  5e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0383061  normal  0.592919 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.03 
 
 		 547 aa  90.1  9e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1914  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.53 
 
 		 553 aa  89  2e-16  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.33952  normal  0.193822 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0294  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 666 aa  87  7e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.254174 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.75 
 
 		 547 aa  85.5  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.26 
 
 		 518 aa  84.3  0.000000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2072  putative Gluconate 2-dehydrogenase flavoprotein  24.68 
 
 		 523 aa  83.6  0.000000000000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1641  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.23 
 
 		 522 aa  81.3  0.00000000000004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.235132 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0060  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.95 
 
 		 523 aa  79.7  0.0000000000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.92 
 
 		 556 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  27.31 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  27.31 
 
 		 563 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.38 
 
 		 556 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.56 
 
 		 526 aa  79  0.0000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  27.31 
 
 		 563 aa  79.3  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4710  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.39 
 
 		 526 aa  79.3  0.0000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.467902  normal  0.0104534 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1077  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.33 
 
 		 504 aa  77.8  0.0000000000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.785546  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  25.41 
 
 		 522 aa  77.8  0.0000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  26.76 
 
 		 547 aa  76.3  0.000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5253  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.69 
 
 		 522 aa  73.9  0.000000000006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.789001  decreased coverage  0.00462633 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1520  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.35 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6309  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.35 
 
 		 534 aa  73.9  0.000000000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.448971  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.76 
 
 		 552 aa  73.9  0.000000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.216955 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.34 
 
 		 531 aa  72.8  0.00000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0546  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.9 
 
 		 535 aa  72  0.00000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0457672  hitchhiker  0.00344637 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6967  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.79 
 
 		 534 aa  71.6  0.00000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.99 
 
 		 553 aa  70.9  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6992  Choline dehydrogenase and related flavoprotein- like protein  26.41 
 
 		 551 aa  69.3  0.0000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.175561  normal  0.0479417 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.5 
 
 		 527 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3452  hypothetical protein  24.1 
 
 		 480 aa  68.2  0.0000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0700524  normal  0.443587 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3718  hypothetical protein  24.1 
 
 		 483 aa  67.8  0.0000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.95 
 
 		 545 aa  67.8  0.0000000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3053  putative oxidoreductase  24.49 
 
 		 528 aa  66.6  0.000000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2704  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.2 
 
 		 550 aa  66.6  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.051308  normal  0.893433 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4037  hypothetical protein  24.65 
 
 		 549 aa  65.5  0.000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.677701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.11 
 
 		 548 aa  64.7  0.000000004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5219  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.84 
 
 		 1150 aa  63.9  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000490282  unclonable  0.0000721023 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.78 
 
 		 511 aa  63.9  0.000000008  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2333  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.02 
 
 		 534 aa  63.2  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000000292297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3076  FAD dependent oxidoreductase  23.5 
 
 		 540 aa  62.4  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  decreased coverage  0.00183108  normal  0.66494 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>