More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_1059 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_1059  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  100 
 
 
570 aa  1182    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0457  diguanylate cyclase  39.08 
 
 
349 aa  139  2e-31  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.163256  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1036  diguanylate cyclase  42.51 
 
 
427 aa  137  4e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.132028  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1277  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  42.61 
 
 
454 aa  136  9.999999999999999e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.410696  normal  0.0388481 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1851  diguanylate cyclase  41.67 
 
 
620 aa  135  1.9999999999999998e-30  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72420  GGDEF domain-containing protein  44.1 
 
 
671 aa  134  6e-30  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0411466  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02241  hypothetical protein  36.77 
 
 
320 aa  133  9e-30  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3227  diguanylate cyclase  38.19 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.709302  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0926  response regulator PleD  43.71 
 
 
455 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.773886 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2531  diguanylate cyclase  40.22 
 
 
347 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.204125  normal  0.837026 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1109  diguanylate cyclase  43.02 
 
 
532 aa  131  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1346  sensory box/GGDEF domain protein  27.39 
 
 
425 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2408  diguanylate cyclase  36.17 
 
 
341 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.62942  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  37 
 
 
722 aa  130  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1497  response regulator PleD  40.74 
 
 
454 aa  130  7.000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.122959 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2490  diguanylate cyclase  37.68 
 
 
341 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.316308  normal  0.521612 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0162  diguanylate cyclase  37.76 
 
 
614 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.155295  normal 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6160  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  25 
 
 
1007 aa  128  2.0000000000000002e-28  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6286  GGDEF domain-containing protein  42.24 
 
 
668 aa  128  3e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0078  GGDEF domain-containing protein  38.83 
 
 
565 aa  128  3e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1405  diguanylate cyclase  35.93 
 
 
464 aa  128  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003519  diguanylate cyclase (GGDEF domain) with PAS/PAC sensor  35.84 
 
 
280 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000133532  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2458  diguanylate cyclase  34.17 
 
 
343 aa  127  6e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.709604 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3218  diguanylate cyclase  41.95 
 
 
532 aa  127  6e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2333  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  38.81 
 
 
578 aa  127  6e-28  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1063  diguanylate cyclase  36.04 
 
 
458 aa  126  9e-28  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.868006  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2404  diguanylate cyclase  40.41 
 
 
479 aa  126  9e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00227226  normal  0.966476 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1382  response regulator PleD  39.68 
 
 
457 aa  126  1e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2275  diguanylate cyclase  34.04 
 
 
341 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.131648  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7417  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.32 
 
 
457 aa  125  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.196799  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2165  diguanylate cyclase  39.51 
 
 
460 aa  125  3e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2198  diguanylate cyclase  34.04 
 
 
341 aa  125  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.83837  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2508  diguanylate cyclase  38.58 
 
 
387 aa  124  4e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.844584 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1646  diguanylate cyclase  38.76 
 
 
580 aa  124  4e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000165959  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3541  response regulator PleD  40.12 
 
 
457 aa  124  4e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0528  diguanylate cyclase  39.01 
 
 
354 aa  124  4e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0243341  normal  0.0197143 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1290  response regulator PleD  38.62 
 
 
457 aa  124  4e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0138689  hitchhiker  0.00259394 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1485  diguanylate cyclase  39.29 
 
 
490 aa  124  5e-27  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1348  response regulator PleD  42.68 
 
 
457 aa  124  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1213  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  34.62 
 
 
457 aa  124  5e-27  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3922  GGDEF domain-containing protein  38.51 
 
 
364 aa  124  6e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2197  GGDEF family protein  33.19 
 
 
341 aa  123  8e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1846  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  37.2 
 
 
314 aa  123  8e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1980  diguanylate cyclase  33.45 
 
 
417 aa  123  9e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0208161  normal  0.907372 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6679  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  39.52 
 
 
457 aa  122  9.999999999999999e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1750  response regulator PleD  35.29 
 
 
457 aa  123  9.999999999999999e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.263569  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0787  GGDEF  40.23 
 
 
585 aa  122  9.999999999999999e-27  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.109099  hitchhiker  0.00379197 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6727  diguanylate cyclase  36.93 
 
 
467 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3052  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  28.1 
 
 
778 aa  123  9.999999999999999e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.479414  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1501  diguanylate cyclase  36.96 
 
 
360 aa  123  9.999999999999999e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.15986  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2703  diguanylate cyclase  38.33 
 
 
339 aa  123  9.999999999999999e-27  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.863974  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1369  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  34.63 
 
 
302 aa  122  9.999999999999999e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.975059  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2446  diguanylate cyclase  36.36 
 
 
341 aa  123  9.999999999999999e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0209282  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1157  PAS:GGDEF  34.45 
 
 
418 aa  122  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.958814  normal  0.862731 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1139  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.11 
 
 
308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2096  diguanylate cyclase with GAF sensor  29.81 
 
 
664 aa  122  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.76184 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2413  response regulator PleD  40.12 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.592932  normal  0.173821 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1820  diguanylate cyclase  33.64 
 
 
443 aa  122  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.81672  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1169  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  41.11 
 
 
308 aa  122  1.9999999999999998e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0907  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.29 
 
 
457 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.401363  normal  0.40647 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0498  diguanylate cyclase  37.44 
 
 
461 aa  122  1.9999999999999998e-26  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.916227  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2977  diguanylate cyclase  35.23 
 
 
650 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1741  diguanylate cyclase  35.41 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1831  diguanylate cyclase  36.36 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0533362  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2126  diguanylate cyclase  37.2 
 
 
341 aa  122  1.9999999999999998e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.128443  normal  0.0489303 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2702  diguanylate cyclase  40.12 
 
 
794 aa  122  1.9999999999999998e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0564678  normal  0.658888 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1328  diguanylate cyclase  38.01 
 
 
564 aa  121  3e-26  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0263917  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3038  response regulator PleD  40.12 
 
 
457 aa  121  3e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.372566  normal  0.319547 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1879  diguanylate cyclase  35.89 
 
 
341 aa  121  3e-26  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.182724  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1202  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.5 
 
 
692 aa  121  3e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2979  diguanylate cyclase  37.95 
 
 
490 aa  121  3.9999999999999996e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1432  response regulator PleD  40.46 
 
 
457 aa  121  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1143  diguanylate cyclase  36.61 
 
 
532 aa  121  3.9999999999999996e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4535  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40 
 
 
345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0387275  normal  0.636684 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1477  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  40.72 
 
 
317 aa  120  4.9999999999999996e-26  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4720  diguanylate cyclase  39.11 
 
 
428 aa  120  4.9999999999999996e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1301  diguanylate cyclase  35.75 
 
 
331 aa  120  6e-26  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.298458  normal  0.144882 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0697  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
482 aa  120  6e-26  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000140018  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0241  diguanylate cyclase  33.05 
 
 
640 aa  120  6e-26  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2420  diguanylate cyclase  39.05 
 
 
532 aa  120  7e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.499921  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3677  response regulator PleD  36.46 
 
 
461 aa  120  7e-26  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  decreased coverage  0.00345303  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1521  diguanylate cyclase  33.8 
 
 
237 aa  120  7e-26  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.281404  normal  0.309888 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2748  diguanylate cyclase  38.25 
 
 
352 aa  120  7.999999999999999e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.246546  normal  0.0545261 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2077  diguanylate cyclase  36.41 
 
 
343 aa  120  7.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.984314  normal  0.163131 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0031  diguanylate cyclase  37.87 
 
 
501 aa  120  7.999999999999999e-26  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0530472  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5099  diguanylate cyclase  37.76 
 
 
653 aa  119  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.873917  normal  0.160564 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0069  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.96 
 
 
314 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.840661 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0967  diguanylate cyclase  43.29 
 
 
457 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.555277  normal  0.0207283 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3627  diguanylate cyclase  41.81 
 
 
526 aa  119  9.999999999999999e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3477  diguanylate cyclase  34.05 
 
 
342 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.377939  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0931  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  43.29 
 
 
457 aa  120  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.436852  normal  0.104843 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3325  diguanylate cyclase  35.59 
 
 
482 aa  119  9.999999999999999e-26  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.662914  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1200  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  24.17 
 
 
619 aa  119  9.999999999999999e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.645678 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1845  diguanylate cyclase  35.89 
 
 
341 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.103325  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2049  GGDEF family protein  38.98 
 
 
319 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4204  diguanylate cyclase with PAS/PAC and GAF sensors  32.93 
 
 
771 aa  119  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2896  cellulose binding, type IV  36 
 
 
443 aa  119  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00808862 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1332  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  36.4 
 
 
306 aa  119  1.9999999999999998e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4119  diguanylate cyclase  34.05 
 
 
382 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.898336 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3437  diguanylate cyclase  36 
 
 
483 aa  119  1.9999999999999998e-25  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0184931  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>