165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Achl_3529 on replicon NC_011886
Organism: Arthrobacter chlorophenolicus A6



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011886  Achl_3529  Pyranose oxidase  100 
 
 		 498 aa  1010    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0214681 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05281  conserved hypothetical protein  28.4 
 
 		 601 aa  186  6e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.185294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0134  glucose-methanol-choline (GMC) oxidoreductase  26.35 
 
 		 480 aa  137  4e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1363  glucose-methanol-choline oxidoreductase  21.66 
 
 		 511 aa  71.2  0.00000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  32.65 
 
 		 518 aa  65.9  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.917064 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05760  choline dehydrogenase-like flavoprotein  33.81 
 
 		 571 aa  64.7  0.000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5509  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.21 
 
 		 556 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0807117  normal  0.364058 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00623  long chain fatty alcohol oxidase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G17110)  25.25 
 
 		 745 aa  64.3  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.345433  normal  0.817488 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4205  GMC oxidoreductase  26.45 
 
 		 509 aa  64.3  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2585  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.67 
 
 		 554 aa  63.9  0.000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.129064  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1661  dehydrogenase subunit, putative  26.18 
 
 		 752 aa  63.5  0.000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.796434 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4057  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.18 
 
 		 752 aa  63.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.566614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6279  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.87 
 
 		 556 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00998076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1771  GMC oxidoreductase  25.95 
 
 		 539 aa  61.2  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0767108 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0819  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.68 
 
 		 579 aa  60.8  0.00000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.157641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3988  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 752 aa  60.1  0.00000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2167  GMC oxidoreductase  34.15 
 
 		 545 aa  59.7  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6389  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.14 
 
 		 547 aa  59.3  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1042  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.36 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.535763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0367  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.41 
 
 		 565 aa  58.9  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2343  FAD dependent oxidoreductase  30.43 
 
 		 662 aa  58.5  0.0000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.513301  normal  0.220367 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1884  FAD dependent oxidoreductase  32.37 
 
 		 562 aa  57.8  0.0000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.597244 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4367  GMC oxidoreductase  32.12 
 
 		 554 aa  57.8  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.855621  normal  0.451057 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1154  GMC oxidoreductase  31.45 
 
 		 547 aa  57.4  0.0000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.81 
 
 		 662 aa  57  0.0000007  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2044  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.81 
 
 		 662 aa  56.6  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.854186  normal  0.0386059 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1025  choline dehydrogenase  24.86 
 
 		 573 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7243  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.38 
 
 		 547 aa  56.2  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.146808  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1288  putative dehydrogenase  26.56 
 
 		 547 aa  56.6  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.478643 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6565  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 		 526 aa  56.6  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.417903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1981  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.81 
 
 		 662 aa  56.6  0.000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5806  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.16 
 
 		 570 aa  56.2  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.10388  normal  0.882961 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2378  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.43 
 
 		 533 aa  55.5  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.899046 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3137  dehydrogenase subunit  23.93 
 
 		 607 aa  55.1  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2728  putative oxidoreductase  30.83 
 
 		 567 aa  55.1  0.000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.368672 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0771  putative transmembrane dehydrogenase (large subunit) oxidoreductase protein  25.13 
 
 		 539 aa  54.3  0.000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0952307  normal  0.0474982 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2982  putative dehydrogenase protein  23.62 
 
 		 607 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.244285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5416  glucose-methanol-choline oxidoreductase  22.63 
 
 		 565 aa  54.3  0.000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.133389 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4709  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.49 
 
 		 527 aa  54.3  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0719  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.1 
 
 		 536 aa  53.5  0.000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.407783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2390  GMC oxidoreductase  32.39 
 
 		 546 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0822  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.49 
 
 		 548 aa  52.8  0.00001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0530  choline dehydrogenase  27.02 
 
 		 570 aa  52.4  0.00002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.830173 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0728  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.63 
 
 		 518 aa  52.4  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.568898  normal  0.0737373 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2086  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.08 
 
 		 538 aa  52.8  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.879766  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3857  putative oxidoreductase  31.43 
 
 		 579 aa  51.2  0.00004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2494  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.69 
 
 		 572 aa  51.2  0.00005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.314394 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1858  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.92 
 
 		 755 aa  51.2  0.00005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.184483  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0827  GMC oxidoreductase  30.5 
 
 		 579 aa  50.8  0.00005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.705708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2794  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.06 
 
 		 525 aa  50.8  0.00006  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0789  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.29 
 
 		 540 aa  50.8  0.00006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.211025  normal  0.372024 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5415  choline dehydrogenase  24.58 
 
 		 565 aa  50.4  0.00007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.188636 
 
 
-
 
NC_007801  Jann_4268  FAD dependent oxidoreductase  31.47 
 
 		 528 aa  50.4  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.3626 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4714  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.71 
 
 		 570 aa  50.4  0.00008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.688275  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0418  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.99 
 
 		 573 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0950  putative glucose dehydrogenase  25 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.263554  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4194  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.34 
 
 		 548 aa  50.1  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6262  NAD-dependent epimerase/dehydratase  43.66 
 
 		 923 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651694  normal  0.376335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2705  glucose-methanol-choline oxidoreductase  27.59 
 
 		 522 aa  50.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.815552  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2790  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  24.45 
 
 		 578 aa  49.7  0.0001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0776  GMC oxidoreductase  25 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1996  glucose-methanol-choline oxidoreductase  34.48 
 
 		 786 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521503  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2017  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.46 
 
 		 581 aa  49.7  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.422222  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1062  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.37 
 
 		 526 aa  49.7  0.0001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.178313  normal  0.0692225 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0419  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.91 
 
 		 563 aa  49.3  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1738  glucose-methanol-choline oxidoreductase  31.01 
 
 		 572 aa  49.3  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0256675  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0165  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.44 
 
 		 531 aa  48.9  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1507  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 548 aa  48.5  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.23617  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2781  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.49 
 
 		 538 aa  48.9  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0926901  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1164  Gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  23.62 
 
 		 594 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3743  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.8 
 
 		 527 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6818  glucose-methanol-choline oxidoreductase  24.59 
 
 		 533 aa  48.9  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.242551 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0945  putative 2-keto-gluconate dehydrogenase  30.53 
 
 		 522 aa  48.9  0.0002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2474  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.61 
 
 		 566 aa  49.3  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.826754 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3593  hypothetical protein  32.52 
 
 		 570 aa  48.9  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.185956  normal  0.226258 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5986  putative dehydrogenase large subunit protein  24.01 
 
 		 623 aa  48.9  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.420299 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4546  NAD-dependent epimerase/dehydratase  31.58 
 
 		 876 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3645  glucose-methanol-choline oxidoreductase  29.25 
 
 		 567 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.948951  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6549  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 		 539 aa  48.1  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.374556 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3815  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.583014  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3978  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.52 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.500166  normal  0.0737697 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4553  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.940882 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6322  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 556 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.942942 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4094  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.61 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5751  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 		 539 aa  48.5  0.0003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1293  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.17 
 
 		 539 aa  48.1  0.0004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.898836  normal  0.776794 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2658  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.95 
 
 		 553 aa  48.1  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1923  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25 
 
 		 550 aa  48.1  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5724  glucose-methanol-choline oxidoreductase  26.53 
 
 		 573 aa  48.1  0.0004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.526246 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0788  GMC oxidoreductase  25 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.310504  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2378  GMC oxidoreductase  30.22 
 
 		 581 aa  48.1  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2930  glucose-methanol-choline oxidoreductase  30.5 
 
 		 527 aa  47.8  0.0004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0259797  normal  0.914708 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3360  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.73 
 
 		 545 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0587927 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1705  oxidoreductase  26.14 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.318945 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4606  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.36 
 
 		 582 aa  47.8  0.0005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.159853 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4480  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.68 
 
 		 527 aa  47.4  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.36342 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6980  glucose-methanol-choline oxidoreductase  23.6 
 
 		 556 aa  47.8  0.0005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0315325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3202  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  31.06 
 
 		 522 aa  47.8  0.0005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0960335 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0467  glucose-methanol-choline oxidoreductase  25.59 
 
 		 548 aa  47.4  0.0006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4381  gluconate 2-dehydrogenase (acceptor)  26.23 
 
 		 592 aa  47.4  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>