More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Taci_1199 on replicon NC_013522
Organism: Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013522  Taci_1199  SMC domain protein  100 
 
 
1134 aa  2202    Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1084  chromosome segregation protein SMC  28.85 
 
 
1187 aa  398  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0800  chromosome segregation SMC protein, putative  25.98 
 
 
1189 aa  382  1e-104  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0563291  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1296  chromosome segregation SMC protein  28.66 
 
 
1189 aa  374  1e-102  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00500491  hitchhiker  3.1853300000000003e-18 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1293  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 
1188 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1318  chromosome segregation protein SMC  25.35 
 
 
1188 aa  375  1e-102  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3671  chromosome segregation protein SMC  28.47 
 
 
1189 aa  370  1e-101  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0691898  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2068  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 
1186 aa  370  1e-101  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00912861  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07250  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 
1185 aa  373  1e-101  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000283351  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3947  chromosome segregation SMC protein  28.2 
 
 
1189 aa  369  1e-100  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0309005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3589  chromosome segregation SMC protein  28.32 
 
 
1189 aa  366  1e-99  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3862  chromosome segregation SMC protein  28.32 
 
 
1189 aa  366  1e-99  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.01045e-55 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1169  chromosome segregation protein SMC  25.63 
 
 
1177 aa  365  2e-99  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3607  chromosome segregation SMC protein  28.28 
 
 
1189 aa  365  3e-99  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3896  chromosome segregation SMC protein  28.18 
 
 
1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000029019  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3890  chromosome segregation SMC protein  28.18 
 
 
1189 aa  364  5.0000000000000005e-99  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2500  chromosome segregation protein SMC  28 
 
 
1189 aa  364  6e-99  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.17932  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3699  chromosome segregation SMC protein  28.12 
 
 
1189 aa  362  2e-98  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3986  chromosome segregation SMC protein  28.12 
 
 
1189 aa  362  2e-98  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3812  chromosome segregation protein SMC  29.45 
 
 
1198 aa  361  4e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1158  condensin subunit Smc  26.61 
 
 
1187 aa  360  7e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00321236  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1975  chromosome segregation protein SMC  28.67 
 
 
1187 aa  349  1e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0708  chromosome segregation protein SMC  29.58 
 
 
1199 aa  349  2e-94  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.175471  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0709  chromosome segregation protein SMC  29.5 
 
 
1199 aa  348  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0453495  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0674  condensin subunit Smc  29.61 
 
 
1199 aa  348  4e-94  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1418  chromosome segregation protein SMC  28.44 
 
 
1181 aa  346  1e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0927  condensin subunit Smc  25.9 
 
 
1190 aa  346  1e-93  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.177469  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1365  chromosome segregation protein SMC  26 
 
 
1191 aa  346  2e-93  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0155599  normal  0.552358 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0719  chromosome segregation protein SMC  28.82 
 
 
1198 aa  337  7e-91  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0474833 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0724  chromosome segregation SMC protein  26.67 
 
 
1179 aa  329  2.0000000000000001e-88  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1637  chromosome segregation protein SMC  26.43 
 
 
1170 aa  322  3e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1220  chromosome segregation protein SMC  24.79 
 
 
1164 aa  321  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1571  chromosome segregation protein SMC  26.2 
 
 
1170 aa  317  9.999999999999999e-85  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1564  condensin subunit Smc  25 
 
 
1185 aa  317  9.999999999999999e-85  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0696  chromosome segregation protein SMC  24.55 
 
 
1190 aa  316  1.9999999999999998e-84  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.21449  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0863  condensin subunit Smc  25.93 
 
 
1174 aa  310  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1271  chromosome segregation SMC protein  26.38 
 
 
1177 aa  309  2.0000000000000002e-82  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1174  condensin subunit Smc  28.26 
 
 
1176 aa  308  4.0000000000000004e-82  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.719475  normal  0.690584 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0661  SMC domain protein  24.61 
 
 
1172 aa  303  1e-80  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0454  condensin subunit Smc  25.6 
 
 
1184 aa  303  1e-80  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1350  SMC domain-containing protein  21.95 
 
 
1174 aa  298  4e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1130  chromosome segregation SMC protein, putative  28.87 
 
 
1175 aa  296  2e-78  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1426  condensin subunit Smc  28.69 
 
 
1171 aa  294  5e-78  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.222885  hitchhiker  0.00360124 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1677  chromosome segregation protein SMC  27.93 
 
 
1177 aa  281  6e-74  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1381  chromosome segregation protein SMC  23.81 
 
 
1184 aa  279  3e-73  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.530369  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1719  chromosome segregation protein SMC  25.54 
 
 
1204 aa  278  4e-73  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.388513  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1592  chromosome segregation protein, Smc family protein  22.4 
 
 
1178 aa  278  6e-73  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.00176998  normal  0.493606 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00743  chromosome segregation protein SMC  28.11 
 
 
1167 aa  276  2.0000000000000002e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1888  chromosome segregation protein SMC  28.03 
 
 
1171 aa  274  8.000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.531391  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4719  chromosome segregation protein SMC  24.23 
 
 
1176 aa  272  2e-71  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.430615  normal  0.0169056 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0504  chromosome segregation protein SMC  25.29 
 
 
1179 aa  272  2e-71  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0889  chromosome segregation protein SMC  22.27 
 
 
1153 aa  270  1e-70  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0518869  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0985  chromosome segregation protein SMC  22.87 
 
 
1191 aa  269  2e-70  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.112036  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0173  chromosome segregation protein SMC  23.08 
 
 
1172 aa  266  1e-69  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5952  chromosome segregation protein SMC  27.41 
 
 
1194 aa  265  3e-69  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1161  chromosome segregation protein SMC  27.59 
 
 
1171 aa  265  4e-69  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2130  chromosome segregation protein SMC  22.15 
 
 
1175 aa  265  4.999999999999999e-69  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0708  chromosome segregation protein SMC  23.52 
 
 
1189 aa  261  4e-68  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.208267  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0461  chromosome segregation protein SMC  24.02 
 
 
1186 aa  259  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1167  chromosome segregation protein SMC  26.28 
 
 
1255 aa  258  6e-67  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469719  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3702  chromosome segregation protein SMC  27.75 
 
 
1403 aa  257  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.141623  normal  0.135068 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2586  chromosome segregation protein SMC  27.8 
 
 
1167 aa  257  1.0000000000000001e-66  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.67731 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0851  chromosome segregation protein SMC  26.08 
 
 
1179 aa  256  2.0000000000000002e-66  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal  0.687128 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0527  chromosome segregation protein SMC  25.88 
 
 
1193 aa  254  4.0000000000000004e-66  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.534964 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0744  chromosome segregation protein SMC  25.1 
 
 
1217 aa  254  4.0000000000000004e-66  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0498  chromosome segregation protein SMC  24.07 
 
 
1185 aa  254  5.000000000000001e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0917  SMC domain protein  22.6 
 
 
1180 aa  252  2e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0642  chromosome segregation protein SMC  22.54 
 
 
1189 aa  248  3e-64  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00029691 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0181  condensin subunit Smc  22.4 
 
 
1189 aa  248  4e-64  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.797796  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1348  chromosome segregation protein SMC  32.81 
 
 
1190 aa  247  9.999999999999999e-64  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.363656  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1276  chromosome segregation protein SMC  22.59 
 
 
1189 aa  243  1e-62  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.526592  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2736  chromosome segregation protein SMC  25.28 
 
 
1188 aa  237  9e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0592  condensin subunit Smc  25.02 
 
 
1175 aa  236  2.0000000000000002e-60  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0781  chromosome segregation ATPase  28.55 
 
 
1186 aa  234  5e-60  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  2.4951e-20 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1499  condensin subunit Smc  24.62 
 
 
1174 aa  233  2e-59  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01211  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  24.86 
 
 
1201 aa  231  7e-59  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2638  chromosome segregation protein SMC  24.82 
 
 
1308 aa  231  8e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1970  chromosome segregation protein SMC  25.67 
 
 
1185 aa  231  9e-59  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.846909  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1831  chromosome segregation protein SMC  26.32 
 
 
1147 aa  230  1e-58  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00681  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.25 
 
 
1196 aa  230  1e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1688  chromosome segregation protein SMC  26.01 
 
 
1185 aa  229  3e-58  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0515857  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00661  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.27 
 
 
1194 aa  228  5.0000000000000005e-58  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00691  SMC ATPase superfamily chromosome segregation protein  23.25 
 
 
1196 aa  227  8e-58  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0059  condensin subunit Smc  23.82 
 
 
1196 aa  226  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0495  structural maintenance of chromosomes (SMC) superfamily protein  23.21 
 
 
988 aa  222  3.9999999999999997e-56  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.210313  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1012  condensin subunit Smc  24.12 
 
 
1149 aa  216  1.9999999999999998e-54  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal  0.750966 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1551  condensin subunit Smc  23.54 
 
 
1219 aa  209  3e-52  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.177198  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0776  chromosome segregation SMC protein  28.2 
 
 
1191 aa  207  1e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00198002  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1420  condensin subunit Smc  24.07 
 
 
1183 aa  205  5e-51  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf735  chromosome segregation ATPase Smc  25.51 
 
 
978 aa  202  1.9999999999999998e-50  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2185  chromosome segregation protein SMC  23.69 
 
 
1146 aa  200  1.0000000000000001e-49  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl232  structural maintenance of chromosomes smc superfamily protein  25.03 
 
 
995 aa  196  2e-48  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04597  nuclear condensin complex subunit Smc4, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02170)  23.54 
 
 
1476 aa  189  4e-46  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0156  p115 protein  25.04 
 
 
981 aa  187  1.0000000000000001e-45  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.552147  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3273  condensin subunit Smc  31.84 
 
 
1188 aa  184  8.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.739482  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1346  chromosome segregation protein SMC  41.36 
 
 
1172 aa  182  2e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.333304  normal  0.300514 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2463  chromosome segregation protein SMC  41.36 
 
 
1198 aa  182  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00257713  hitchhiker  0.000112531 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1496  chromosome partition protein SmC, putative  30.91 
 
 
980 aa  182  4e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2059  chromosome segregation protein SMC  41.36 
 
 
1142 aa  182  4e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.365444  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1250  chromosome segregation protein SMC  41.36 
 
 
1206 aa  181  4.999999999999999e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>