191 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_3674 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_3674  carbohydrate-binding family 6 protein  100 
 
 		 479 aa  959    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4050  carbohydrate-binding family 6 protein  92.9 
 
 		 479 aa  796    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.567483  normal  0.0446183 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0843  carbohydrate binding family 6  66.06 
 
 		 470 aa  586  1e-166  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.392015 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1077  Carbohydrate binding family 6  62.45 
 
 		 464 aa  579  1e-164  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0129  carbohydrate-binding family 6 protein  51.34 
 
 		 469 aa  425  1e-117  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.235369  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3954  glycoside hydrolase family 16  67.54 
 
 		 318 aa  414  1e-114  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.913325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2285  glycoside hydrolase family 16  50.84 
 
 		 539 aa  294  3e-78  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0517847  hitchhiker  0.00991437 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  49.34 
 
 		 639 aa  277  3e-73  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4312  coagulation factor 5/8 type domain protein  50 
 
 		 1007 aa  265  2e-69  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.382948  hitchhiker  0.000989115 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3724  hypothetical protein  49.83 
 
 		 999 aa  262  1e-68  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.606148  normal  0.741628 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7244  Ricin B lectin  46.15 
 
 		 446 aa  217  4e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0192943  normal  1 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06620  endo-1,3(4)-beta-glucanase, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G14540)  39.3 
 
 		 388 aa  190  5e-47  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.240126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4113  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.45 
 
 		 815 aa  189  1e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.192458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4545  glycoside hydrolase family 16  32.79 
 
 		 383 aa  174  2.9999999999999996e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2187  Carbohydrate binding family 6  32.1 
 
 		 389 aa  172  2e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00108018  hitchhiker  0.000808611 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5224  Carbohydrate binding family 6  55.22 
 
 		 566 aa  161  2e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.105995  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00031  conserved hypothetical protein  37.04 
 
 		 361 aa  154  5e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.096778 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1590  glycoside hydrolase family 16  39.34 
 
 		 289 aa  146  7.0000000000000006e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0592572 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1538  glycoside hydrolase family 16  36.34 
 
 		 423 aa  145  2e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2626  glycoside hydrolase family 16  36.55 
 
 		 283 aa  129  1.0000000000000001e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.444573  normal  0.839532 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2194  carbohydrate-binding family 6 protein  46.27 
 
 		 501 aa  122  9.999999999999999e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.29628  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1690  glycoside hydrolase family 16  33.75 
 
 		 279 aa  122  9.999999999999999e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04240  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  35.61 
 
 		 1290 aa  122  1.9999999999999998e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1232  Carbohydrate binding family 6  48.46 
 
 		 490 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.122742  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1656  Carbohydrate binding family 6  48.44 
 
 		 951 aa  119  7.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00148801  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1242  Carbohydrate binding family 6  39.05 
 
 		 629 aa  119  9.999999999999999e-26  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.679314  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1237  Carbohydrate binding family 6  40.68 
 
 		 604 aa  118  3e-25  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0649618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2434  glycoside hydrolase family protein  34.52 
 
 		 556 aa  117  5e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.971085  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2195  carbohydrate-binding family 6 protein  43.07 
 
 		 965 aa  116  7.999999999999999e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.862232  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3100  glycoside hydrolase family 16  37.5 
 
 		 291 aa  115  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.194858 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1239  Carbohydrate binding family 6  42.11 
 
 		 1015 aa  114  3e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000298242  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5109  glycoside hydrolase family 16  34.47 
 
 		 409 aa  114  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0369397  normal  0.380992 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1241  Carbohydrate binding family 6  42.42 
 
 		 1164 aa  113  8.000000000000001e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1238  Carbohydrate binding family 6  44.7 
 
 		 1122 aa  112  1.0000000000000001e-23  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000137164  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2197  carbohydrate-binding family 6 protein  43.94 
 
 		 928 aa  112  2.0000000000000002e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.71663  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0899  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 641 aa  111  3e-23  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0921  glycoside hydrolase family protein  31.54 
 
 		 642 aa  111  3e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7304  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  34.56 
 
 		 261 aa  109  1e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0696013 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2607  laminarinase  26.55 
 
 		 883 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5321  glycoside hydrolase family 16  32.13 
 
 		 426 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.349726  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4617  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  33.23 
 
 		 633 aa  107  4e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1233  Carbohydrate binding family 6  41.38 
 
 		 746 aa  107  6e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.555313  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1235  Carbohydrate binding family 6  40.54 
 
 		 509 aa  105  2e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00440741  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3121  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.72 
 
 		 742 aa  103  5e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2809  glycoside hydrolase family protein  31.08 
 
 		 1321 aa  103  6e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.149168  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04210  glycoside hydrolase family 16  29.97 
 
 		 281 aa  103  9e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0109  glycoside hydrolase family 16  31.49 
 
 		 276 aa  103  9e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0321176  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1230  Carbohydrate binding family 6  40.58 
 
 		 541 aa  101  3e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.000323294  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0451  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.96 
 
 		 627 aa  101  3e-20  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000399105  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3388  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.69 
 
 		 1694 aa  100  4e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1398  glycoside hydrolase family 16  30.36 
 
 		 328 aa  100  4e-20  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1234  Carbohydrate binding family 6  37.93 
 
 		 536 aa  99.8  9e-20  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.115461  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1270  glycoside hydrolase family protein  32.36 
 
 		 301 aa  99.8  9e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.782608  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4787  coagulation factor 5/8 type domain protein  32.31 
 
 		 819 aa  99.8  1e-19  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02670  glycoside hydrolase family 16  25.74 
 
 		 503 aa  99.4  1e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1240  Carbohydrate binding family 6  38.64 
 
 		 780 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.000268081  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1231  Carbohydrate binding family 6  38.41 
 
 		 524 aa  99  2e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0177163  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2816  glycoside hydrolase family protein  30.79 
 
 		 752 aa  97.1  7e-19  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000106793  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1229  Carbohydrate binding family 6  39.23 
 
 		 535 aa  95.5  2e-18  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.166566  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2795  hypothetical protein  38.06 
 
 		 912 aa  95.9  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00123137  hitchhiker  0.0000146968 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3395  Licheninase  31.91 
 
 		 588 aa  95.1  2e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.585681 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1271  carbohydrate-binding family 6 protein  38.17 
 
 		 679 aa  94.4  4e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0286  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  30.17 
 
 		 282 aa  93.6  8e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1342  glycoside hydrolase family 16  31.5 
 
 		 274 aa  93.2  9e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.345936 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0455  Carbohydrate binding family 6  38.18 
 
 		 618 aa  91.7  3e-17  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1911  carbohydrate-binding family 6 protein  36.73 
 
 		 1290 aa  90.5  7e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.374482  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0652  Beta-glucanase/Beta-glucan synthetase-like  28.67 
 
 		 569 aa  89.7  1e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.307266  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5116  Licheninase  30.5 
 
 		 1059 aa  89.7  1e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0998931 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1600  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.94 
 
 		 288 aa  89.7  1e-16  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.715273  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_54681  endo-1,3-beta-glucosidase  31.71 
 
 		 1028 aa  89.4  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4376  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.69 
 
 		 912 aa  88.6  2e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2387  glycoside hydrolase family protein  31.12 
 
 		 384 aa  87  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.286598  normal  0.735718 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1396  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  29.97 
 
 		 884 aa  86.7  9e-16  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000905888  normal  0.0353451 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3213  glycoside hydrolase family 43  38.93 
 
 		 464 aa  85.9  0.000000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.331095  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1608  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  31.15 
 
 		 306 aa  84.7  0.000000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_54973  endo-1,3-beta-glucosidase  32.58 
 
 		 467 aa  84.7  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4931  glycoside hydrolase family 16  28.89 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.454153  normal  0.64066 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0554  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.8 
 
 		 532 aa  83.6  0.000000000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2927  beta-1,3-glucanase precursor  32.62 
 
 		 1441 aa  83.2  0.000000000000009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2196  carbohydrate-binding family 6 protein  36.84 
 
 		 533 aa  83.2  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1131  Glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.67 
 
 		 547 aa  83.2  0.000000000000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.232091  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2972  glycoside hydrolase family protein  34.18 
 
 		 683 aa  82  0.00000000000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4707  glycoside hydrolase family protein  29.77 
 
 		 291 aa  82  0.00000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.359297 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3716  glycosy hydrolase family protein  29.51 
 
 		 1918 aa  81.6  0.00000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.442328  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3723  beta-glucanase  28.27 
 
 		 330 aa  80.5  0.00000000000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3612  methionine biosynthesis MetW  37.88 
 
 		 1186 aa  79.3  0.0000000000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0161329  hitchhiker  0.00479901 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2604  glycoside hydrolase family protein  30.31 
 
 		 694 aa  79  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0216  hypothetical protein  34.62 
 
 		 630 aa  75.1  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.80342 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3627  glycoside hydrolase family protein  28.04 
 
 		 394 aa  75.5  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.652484  normal  0.593329 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1319  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  28.5 
 
 		 358 aa  75.1  0.000000000003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4177  glycoside hydrolase family protein  29.14 
 
 		 1332 aa  74.7  0.000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1963  glycoside hydrolase family protein  30.64 
 
 		 837 aa  74.3  0.000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.658538  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3843  glycoside hydrolase family protein  26.48 
 
 		 346 aa  73.9  0.000000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.106581 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2679  glycoside hydrolase family protein  31.86 
 
 		 260 aa  73.9  0.000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4512  Carbohydrate binding family 6  34.38 
 
 		 1391 aa  73.9  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.472745 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2322  protein of unknown function DUF1080  35.61 
 
 		 1444 aa  72.8  0.00000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.205839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2993  endoglucanase-like  34.31 
 
 		 863 aa  72  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0380373  hitchhiker  0.000000401461 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4347  glycoside hydrolase family 16  28.33 
 
 		 405 aa  72.4  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0666302  normal  0.854183 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0919  glucan endo-1,3-beta-D-glucosidase  27.95 
 
 		 315 aa  72.4  0.00000000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4150  glycoside hydrolase family 16  29.13 
 
 		 269 aa  72  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>