More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_5872 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013595  Sros_5872  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 460 aa  919    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.696543 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2551  extracellular solute-binding protein family 1  65.01 
 
 		 473 aa  549  1e-155  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.35345  normal  0.255178 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1410  extracellular solute-binding protein family 1  54.87 
 
 		 482 aa  496  1e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1722  extracellular solute-binding protein family 1  54.65 
 
 		 476 aa  492  9.999999999999999e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.902381 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2378  extracellular solute-binding protein  36.34 
 
 		 451 aa  191  2e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.612639  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1380  extracellular solute-binding protein family 1  36.41 
 
 		 453 aa  187  2e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.031146 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2014  extracellular solute-binding protein family 1  32.22 
 
 		 455 aa  173  3.9999999999999995e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.383085  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_15380  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.64 
 
 		 465 aa  162  1e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.479356  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_23010  extracellular solute-binding protein family 1  25.06 
 
 		 436 aa  94.7  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000978171  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11620  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  30.28 
 
 		 426 aa  93.2  8e-18  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4557  extracellular solute-binding protein  26.63 
 
 		 412 aa  89.7  1e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.302395  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2310  extracellular solute-binding protein family 1  24.03 
 
 		 425 aa  85.1  0.000000000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000523246  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2959  extracellular solute-binding protein family 1  25.61 
 
 		 437 aa  84.3  0.000000000000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1492  extracellular solute-binding protein  26.16 
 
 		 421 aa  82.4  0.00000000000001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0753  extracellular solute-binding protein  24.52 
 
 		 429 aa  80.1  0.00000000000007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00037903  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3055  extracellular solute-binding protein family 1  24.23 
 
 		 449 aa  79.3  0.0000000000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3393  extracellular solute-binding protein family 1  25.34 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.205631 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3121  extracellular solute-binding protein family 1  25.62 
 
 		 412 aa  79  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4993  extracellular solute-binding protein family 1  25.5 
 
 		 432 aa  75.9  0.000000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0450999  normal  0.012477 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4015  extracellular solute-binding protein family 1  25.41 
 
 		 434 aa  75.9  0.000000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0770441 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1099  extracellular solute-binding protein  25.99 
 
 		 457 aa  75.9  0.000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0690  extracellular solute-binding protein  24.58 
 
 		 402 aa  75.9  0.000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.678935  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1655  extracellular solute-binding protein family 1  27.22 
 
 		 425 aa  73.6  0.000000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.186521  normal  0.186231 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1088  extracellular solute-binding protein family 1  25.55 
 
 		 414 aa  72.8  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00683834  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3779  extracellular solute-binding protein family 1  25.09 
 
 		 430 aa  73.2  0.00000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.292836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3895  extracellular solute-binding protein  26.41 
 
 		 411 aa  70.5  0.00000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1886  extracellular solute-binding protein family 1  26.51 
 
 		 435 aa  69.3  0.0000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.23125 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0413  extracellular solute-binding protein  25.5 
 
 		 428 aa  69.3  0.0000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0514  extracellular solute-binding protein family 1  25.28 
 
 		 426 aa  69.7  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0748  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein, putative  25.7 
 
 		 411 aa  68.9  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2683  extracellular solute-binding protein family 1  25.81 
 
 		 446 aa  68.6  0.0000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.50155  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2832  extracellular solute-binding protein family 1  25.22 
 
 		 417 aa  68.6  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.617934  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0698  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.7 
 
 		 366 aa  68.9  0.0000000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.436581  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3149  extracellular solute-binding protein  23.84 
 
 		 427 aa  68.9  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2108  extracellular solute-binding protein family 1  25 
 
 		 430 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.553068 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0397  extracellular solute-binding protein  24.88 
 
 		 428 aa  67.4  0.0000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2297  extracellular solute-binding protein  25.15 
 
 		 416 aa  67  0.0000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.33558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7906  extracellular solute-binding protein family 1  24.36 
 
 		 420 aa  66.2  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.819994  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3712  extracellular solute-binding protein family 1  27.01 
 
 		 421 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.411366 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2466  extracellular solute-binding protein family 1  25.14 
 
 		 415 aa  65.1  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0930087 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3982  extracellular solute-binding protein family 1  25.83 
 
 		 435 aa  65.9  0.000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.71759  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2622  extracellular solute-binding protein family 1  24.67 
 
 		 437 aa  65.5  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0574924  normal  0.833644 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0762  extracellular solute-binding protein  25.38 
 
 		 424 aa  64.7  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000277245  normal  0.855778 
 
 
 
NC_009953  Sare_0747  extracellular solute-binding protein  29.86 
 
 		 433 aa  64.3  0.000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190936 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0623  extracellular solute-binding protein family 1  23.5 
 
 		 428 aa  64.3  0.000000004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.58509 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2201  extracellular solute-binding protein  24.22 
 
 		 420 aa  63.9  0.000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.455559  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1150  extracellular solute-binding protein  25.51 
 
 		 441 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.344094  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0062  extracellular solute-binding protein  25.87 
 
 		 436 aa  63.5  0.000000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2237  extracellular solute-binding protein family 1  23.55 
 
 		 466 aa  63.5  0.000000007  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3146  extracellular solute-binding protein  23.28 
 
 		 424 aa  63.5  0.000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0629231  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0116  extracellular solute-binding protein  25.34 
 
 		 420 aa  63.2  0.00000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4148  extracellular solute-binding protein  28.64 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0472509  normal  0.106363 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4159  extracellular solute-binding protein  25.07 
 
 		 421 aa  63.2  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.119299  normal  0.873951 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9091  ABC-type sugar transport system periplasmic component-like protein  27.16 
 
 		 422 aa  62  0.00000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.306335  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0118  extracellular solute-binding protein  29.63 
 
 		 420 aa  62  0.00000002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4147  extracellular solute-binding protein family 1  28.99 
 
 		 441 aa  61.2  0.00000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.892231  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0399  extracellular solute-binding protein family 1  24.65 
 
 		 408 aa  60.5  0.00000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000195685  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0045  extracellular solute-binding protein family 1  25.31 
 
 		 414 aa  60.5  0.00000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.713374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1262  extracellular solute-binding protein  26.98 
 
 		 424 aa  60.5  0.00000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.00529057  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0348  extracellular solute-binding protein family 1  26.85 
 
 		 419 aa  60.1  0.00000009  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0803  extracellular solute-binding protein  25.62 
 
 		 433 aa  60.1  0.00000009  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.437157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1963  extracellular solute-binding protein family 1  23.88 
 
 		 449 aa  59.7  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.734467  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2797  extracellular solute-binding protein family 1  23.86 
 
 		 426 aa  59.7  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0807  extracellular solute-binding protein family 1  23.17 
 
 		 420 aa  59.3  0.0000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1420  extracellular solute-binding protein  23.39 
 
 		 424 aa  59.7  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.979516  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02930  carbohydrate-binding protein  23 
 
 		 426 aa  59.3  0.0000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2524  extracellular solute-binding protein family 1  28.26 
 
 		 483 aa  58.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00000000331289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2265  extracellular solute-binding protein family 1  24.42 
 
 		 418 aa  59.3  0.0000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20520  extracellular solute-binding protein family 1  27.88 
 
 		 417 aa  58.5  0.0000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.561553  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3910  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.198843 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3339  Maltose-binding periplasmic protein/domains- like protein  25.47 
 
 		 431 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.202326 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3944  extracellular solute-binding protein  28 
 
 		 464 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.920276  normal  0.0416082 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0870  extracellular solute-binding protein family 1  23.45 
 
 		 419 aa  58.2  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.649209  normal  0.121264 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1680  extracellular solute-binding protein family 1  24.89 
 
 		 430 aa  58.2  0.0000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.173253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06270  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  26.22 
 
 		 426 aa  58.2  0.0000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0385  extracellular solute-binding protein family 1  25.78 
 
 		 410 aa  58.2  0.0000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0390662 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00380  extracellular solute-binding protein family 1  27.73 
 
 		 422 aa  57.8  0.0000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20490  ABC-type sugar transport system, periplasmic component  24.04 
 
 		 436 aa  57.8  0.0000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0446112  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2267  extracellular solute-binding protein family 1  24.35 
 
 		 445 aa  57.4  0.0000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00064551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2758  extracellular solute-binding protein family 1  23.75 
 
 		 423 aa  57.4  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.736779  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0795  extracellular solute-binding protein family 1  22.88 
 
 		 460 aa  57.4  0.0000005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.215252  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0434  extracellular solute-binding protein  21.71 
 
 		 452 aa  57.4  0.0000005  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.396307 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15040  extracellular solute-binding protein family 1  21.2 
 
 		 458 aa  57.4  0.0000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.751229  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3409  extracellular solute-binding protein  23.45 
 
 		 451 aa  57.4  0.0000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000553575  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1485  MalE-type ABC sugar transport system periplasmic component  25.08 
 
 		 429 aa  57.4  0.0000006  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2146  extracellular solute-binding protein  24.05 
 
 		 414 aa  57  0.0000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0954  extracellular solute-binding protein  22.34 
 
 		 399 aa  57.4  0.0000006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0450213  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19900  extracellular solute-binding protein family 1  21.01 
 
 		 415 aa  57  0.0000007  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15560  extracellular solute-binding protein family 1  21.13 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4425  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 446 aa  56.6  0.0000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.446855  normal  0.265456 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1626  putative sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  24.87 
 
 		 418 aa  56.6  0.0000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.188232 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0889  sugar ABC transporter, periplasmic sugar-binding protein  25.57 
 
 		 424 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.613044  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3329  extracellular solute-binding protein  24.94 
 
 		 423 aa  56.2  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20630  extracellular solute-binding protein family 1  21.23 
 
 		 414 aa  56.2  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3622  extracellular solute-binding protein family 1  23.27 
 
 		 412 aa  55.8  0.000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0501  extracellular solute-binding protein family 1  24.93 
 
 		 433 aa  56.6  0.000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  decreased coverage  0.0000488029  hitchhiker  0.0000184856 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2365  extracellular solute-binding protein family 1  28.28 
 
 		 416 aa  56.6  0.000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.618021 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0516  extracellular solute-binding protein  24.81 
 
 		 488 aa  56.2  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1484  extracellular solute-binding protein  25.75 
 
 		 444 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000980441  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3355  extracellular solute-binding protein family 1  30.54 
 
 		 436 aa  55.5  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>