184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_5061 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_5061  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 529 aa  1083    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.982788  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0565  RagB/SusD domain protein  42.42 
 
 		 513 aa  357  1.9999999999999998e-97  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.110702  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4222  RagB/SusD domain protein  38.76 
 
 		 515 aa  318  1e-85  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.710701  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1761  RagB/SusD domain protein  34.62 
 
 		 539 aa  236  1.0000000000000001e-60  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.559477  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4168  hypothetical protein  30.31 
 
 		 588 aa  191  2e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.13249  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5202  RagB/SusD domain protein  30.15 
 
 		 587 aa  191  2e-47  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.000000106689  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4328  RagB/SusD domain-containing protein  30.09 
 
 		 504 aa  184  4.0000000000000006e-45  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5058  RagB/SusD domain protein  30.46 
 
 		 493 aa  178  2e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.135976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0022  RagB/SusD domain protein  31.36 
 
 		 562 aa  170  6e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.201745  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1221  RagB/SusD domain protein  29.28 
 
 		 539 aa  163  7e-39  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.711813 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0639  RagB/SusD domain protein  26.82 
 
 		 537 aa  162  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.219996 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1439  RagB/SusD domain protein  30.69 
 
 		 527 aa  159  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.271044 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5704  RagB/SusD domain protein  29.4 
 
 		 564 aa  154  2.9999999999999998e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0518838  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7233  RagB/SusD domain protein  26.52 
 
 		 538 aa  151  3e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  unclonable  0.0000000822173  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3126  RagB/SusD domain-containing protein  29.88 
 
 		 537 aa  150  5e-35  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.000466942  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2765  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 542 aa  147  4.0000000000000006e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2446  RagB/SusD domain protein  27.21 
 
 		 538 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1212  RagB/SusD domain-containing protein  30.58 
 
 		 502 aa  125  2e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.571968  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7176  RagB/SusD domain protein  25.94 
 
 		 543 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1406  RagB/SusD domain-containing protein  26.64 
 
 		 534 aa  117  6e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0224524  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0629  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 540 aa  110  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.953445  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6167  RagB/SusD domain protein  26.83 
 
 		 530 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00835127 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5091  RagB/SusD domain protein  25.54 
 
 		 530 aa  102  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0871093  normal  0.523706 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2208  RagB/SusD domain protein  26.17 
 
 		 531 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.721066  normal  0.400828 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4233  RagB/SusD domain-containing protein  27.88 
 
 		 511 aa  93.6  7e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05060  hypothetical protein  28.13 
 
 		 519 aa  93.2  1e-17  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.301626  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0561  RagB/SusD domain protein  25.66 
 
 		 577 aa  92  2e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0183863  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0810  RagB/SusD domain protein  26.02 
 
 		 499 aa  91.7  3e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00428067  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1344  RagB/SusD domain protein  28.31 
 
 		 557 aa  88.6  2e-16  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.11655  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.37 
 
 		 476 aa  86.7  9e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.01 
 
 		 494 aa  86.3  0.000000000000001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  26.27 
 
 		 490 aa  84.7  0.000000000000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5647  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 520 aa  84.7  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.688927  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  27.68 
 
 		 477 aa  84  0.000000000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1481  RagB/SusD domain protein  25.06 
 
 		 499 aa  81.3  0.00000000000004  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.476602  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  26.32 
 
 		 494 aa  81.3  0.00000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  26.06 
 
 		 499 aa  79.7  0.0000000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  28.34 
 
 		 483 aa  79.3  0.0000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5420  RagB/SusD domain protein  26.46 
 
 		 575 aa  79.3  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.458179  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  24.7 
 
 		 476 aa  77.8  0.0000000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.64 
 
 		 541 aa  77.4  0.0000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4266  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 527 aa  77  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.34152  normal  0.145699 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4718  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 499 aa  77  0.0000000000009  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  25.97 
 
 		 506 aa  77  0.0000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  25.14 
 
 		 477 aa  76.3  0.000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  26.51 
 
 		 481 aa  76.3  0.000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2709  RagB/SusD domain protein  24.53 
 
 		 489 aa  76.3  0.000000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.000284151  normal  0.714697 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0998  RagB/SusD domain protein  24.89 
 
 		 544 aa  74.7  0.000000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  27 
 
 		 502 aa  74.7  0.000000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  35.21 
 
 		 487 aa  73.9  0.000000000007  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7252  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 537 aa  73.6  0.000000000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.298373  normal  0.555692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  24.15 
 
 		 488 aa  72  0.00000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4195  RagB/SusD domain-containing protein  24.96 
 
 		 506 aa  71.2  0.00000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3595  RagB/SusD domain protein  23.59 
 
 		 527 aa  71.2  0.00000000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.237544  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1765  RagB/SusD domain protein  26.38 
 
 		 481 aa  70.9  0.00000000005  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000000990073  normal  0.167051 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2828  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 549 aa  70.9  0.00000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.251846  normal  0.0738006 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  26.89 
 
 		 480 aa  69.7  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3421  RagB/SusD domain protein  26.45 
 
 		 521 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2301  RagB/SusD domain protein  23.79 
 
 		 565 aa  68.9  0.0000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3419  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 521 aa  68.2  0.0000000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.311726  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5673  RagB/SusD domain protein  26.56 
 
 		 555 aa  68.6  0.0000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0033424  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  25.98 
 
 		 456 aa  68.2  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  38.46 
 
 		 460 aa  67.8  0.0000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3870  RagB/SusD domain-containing protein  25.3 
 
 		 498 aa  67.8  0.0000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.248974  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  26.96 
 
 		 486 aa  67.8  0.0000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  27.45 
 
 		 508 aa  67.8  0.0000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0199  RagB/SusD domain protein  27.16 
 
 		 511 aa  67  0.0000000008  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.820829  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3171  RagB/SusD domain protein  27.14 
 
 		 579 aa  67  0.0000000008  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.670451  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  25.76 
 
 		 491 aa  66.2  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1572  RagB/SusD domain protein  24.27 
 
 		 541 aa  66.6  0.000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00617416  normal  0.812354 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3980  RagB/SusD domain protein  24.44 
 
 		 556 aa  66.6  0.000000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.607109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6367  RagB/SusD domain protein  25.42 
 
 		 547 aa  65.9  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.0017837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3250  RagB/SusD domain-containing protein  25.52 
 
 		 511 aa  65.5  0.000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2843  RagB/SusD domain protein  27.48 
 
 		 622 aa  65.9  0.000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00579514 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  27.96 
 
 		 486 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  23.28 
 
 		 503 aa  65.1  0.000000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5550  RagB/SusD domain protein  25.05 
 
 		 520 aa  65.1  0.000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.337883 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  38.52 
 
 		 451 aa  64.7  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  24.31 
 
 		 473 aa  63.9  0.000000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  24.22 
 
 		 478 aa  63.9  0.000000007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  24.46 
 
 		 484 aa  63.9  0.000000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6530  RagB/SusD domain protein  25.27 
 
 		 521 aa  63.5  0.000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2268  RagB/SusD domain protein  26.59 
 
 		 574 aa  63.2  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  25.16 
 
 		 488 aa  62.8  0.00000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0005  RagB/SusD domain protein  23.67 
 
 		 504 aa  62.8  0.00000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  26.39 
 
 		 532 aa  62.4  0.00000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4497  RagB/SusD domain protein  24.43 
 
 		 531 aa  62.8  0.00000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.515459 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  23.19 
 
 		 426 aa  62.8  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2653  RagB/SusD domain protein  24.95 
 
 		 572 aa  62.4  0.00000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  27.02 
 
 		 511 aa  61.6  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2282  RagB/SusD domain protein  24.37 
 
 		 540 aa  61.6  0.00000003  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00108991 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0634  RagB/SusD domain protein  24.71 
 
 		 522 aa  61.6  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  23.93 
 
 		 506 aa  62  0.00000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0322  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 534 aa  61.2  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0946991  normal  0.209656 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  26.44 
 
 		 499 aa  61.2  0.00000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4709  RagB/SusD domain protein  22.77 
 
 		 479 aa  59.7  0.0000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.529727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  24.45 
 
 		 469 aa  59.7  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1857  RagB/SusD domain protein  26.12 
 
 		 505 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.363797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  26.65 
 
 		 506 aa  58.9  0.0000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  23.65 
 
 		 478 aa  59.3  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>