More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_4207 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_4207  RagB/SusD domain protein  100 
 
 		 451 aa  911    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4209  RagB/SusD domain protein  47.6 
 
 		 456 aa  386  1e-106  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05675  hypothetical protein  34.39 
 
 		 461 aa  202  7e-51  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.127954  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0453  RagB/SusD domain protein  31.68 
 
 		 469 aa  179  7e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.000455349  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1619  RagB/SusD domain protein  32.49 
 
 		 448 aa  178  2e-43  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.299192  normal  0.510793 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0338  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 447 aa  175  1.9999999999999998e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0773  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 483 aa  173  6.999999999999999e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.961252  normal  0.23471 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4318  RagB/SusD domain protein  31.33 
 
 		 481 aa  171  3e-41  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.0553974 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1583  RagB/SusD domain protein  31.71 
 
 		 479 aa  171  4e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00621618  normal  0.437007 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0107  RagB/SusD domain protein  31.54 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.528025 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0554  hypothetical protein  30.44 
 
 		 458 aa  164  3e-39  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.704424  normal  0.469877 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1275  RagB/SusD domain protein  31.85 
 
 		 460 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.583707 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2080  RagB/SusD domain protein  29.2 
 
 		 457 aa  153  8e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.0104067  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2232  RagB/SusD domain protein  29.45 
 
 		 486 aa  152  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0455  RagB/SusD domain protein  29.29 
 
 		 478 aa  150  6e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1724  RagB/SusD domain protein  31.05 
 
 		 491 aa  150  6e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.120109  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4380  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 478 aa  147  5e-34  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.834955  normal  0.352412 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4646  RagB/SusD domain-containing protein  31.31 
 
 		 490 aa  144  4e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.600007  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1622  RagB/SusD domain protein  30.48 
 
 		 447 aa  143  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.339218 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0536  RagB/SusD domain protein  31.49 
 
 		 456 aa  144  5e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2730  RagB/SusD domain protein  29.52 
 
 		 447 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00424565 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4433  RagB/SusD domain-containing protein  29.26 
 
 		 494 aa  142  1.9999999999999998e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.51618  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0688  RagB/SusD domain protein  29.55 
 
 		 500 aa  140  3e-32  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0549039  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0680  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 477 aa  140  3.9999999999999997e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2136  RagB/SusD domain protein  29.24 
 
 		 470 aa  139  7.999999999999999e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.528291 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1925  RagB/SusD domain-containing protein  27.63 
 
 		 515 aa  138  2e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4175  RagB/SusD domain protein  30.26 
 
 		 504 aa  138  2e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.438263  normal  0.0393106 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1656  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 497 aa  136  8e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.612346 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11493  putative outer membrane protein  27.76 
 
 		 476 aa  136  9.999999999999999e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.494565  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3634  RagB/SusD domain protein  28.49 
 
 		 510 aa  135  1.9999999999999998e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.358652  normal  0.222637 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1041  RagB/SusD domain protein  28.07 
 
 		 501 aa  134  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0635892  normal  0.364021 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2432  RagB/SusD domain-containing protein  28.98 
 
 		 499 aa  133  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.199141  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3165  RagB/SusD domain protein  28.87 
 
 		 456 aa  132  1.0000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5600  RagB/SusD domain protein  28.95 
 
 		 488 aa  132  1.0000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.635453 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1984  RagB/SusD domain protein  28.35 
 
 		 461 aa  131  3e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.494164  hitchhiker  0.00000440617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5314  RagB/SusD domain protein  29.8 
 
 		 486 aa  130  4.0000000000000003e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000248679  normal  0.692044 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4221  RagB/SusD domain protein  31.58 
 
 		 457 aa  129  8.000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.964616 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2272  RagB/SusD domain protein  29.37 
 
 		 491 aa  129  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0931  RagB/SusD domain protein  28.52 
 
 		 494 aa  129  1.0000000000000001e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  decreased coverage  0.00244516  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2413  RagB/SusD domain protein  28.13 
 
 		 480 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6635  RagB/SusD domain protein  29.71 
 
 		 483 aa  127  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.258303 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5654  RagB/SusD domain protein  28.77 
 
 		 511 aa  127  5e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.576188  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6054  RagB/SusD domain protein  27.29 
 
 		 499 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6568  RagB/SusD domain protein  28.24 
 
 		 502 aa  126  7e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.101345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0547  hypothetical protein  27.19 
 
 		 446 aa  126  8.000000000000001e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.395816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2081  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 473 aa  125  1e-27  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0159839  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3207  RagB/SusD domain protein  28.83 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.176888  normal  0.977355 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1495  RagB/SusD domain protein  26.75 
 
 		 506 aa  124  3e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.253352  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1129  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 493 aa  124  4e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.259882  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3809  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 469 aa  124  5e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00323854  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0440  RagB/SusD domain protein  26.27 
 
 		 486 aa  123  8e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3036  RagB/SusD domain-containing protein  26.92 
 
 		 471 aa  122  9.999999999999999e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0180462  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6450  RagB/SusD domain protein  29.7 
 
 		 493 aa  120  3e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.960528  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3589  RagB/SusD domain protein  28.91 
 
 		 492 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000864206  hitchhiker  0.000240178 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3338  RagB/SusD domain-containing protein  28.1 
 
 		 492 aa  119  9e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3124  RagB/SusD domain protein  25.35 
 
 		 488 aa  119  9.999999999999999e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.115801  normal  0.453004 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3988  RagB/SusD domain protein  27.52 
 
 		 478 aa  117  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0726  RagB/SusD domain protein  28.1 
 
 		 448 aa  117  6e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.76013  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0974  RagB/SusD domain protein  25.73 
 
 		 462 aa  117  6e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4010  RagB/SusD domain protein  27.31 
 
 		 480 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.19727  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6228  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 511 aa  115  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0518  RagB/SusD domain protein  29.18 
 
 		 483 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00138157 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4041  RagB/SusD domain protein  29.61 
 
 		 477 aa  115  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.763305  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0056  RagB/SusD domain protein  28.51 
 
 		 453 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1564  RagB/SusD domain protein  26.92 
 
 		 484 aa  115  2.0000000000000002e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.914485 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1361  RagB/SusD domain protein  28.09 
 
 		 426 aa  113  7.000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.252312  normal  0.386209 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1803  RagB/SusD domain protein  29.36 
 
 		 512 aa  113  7.000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3391  RagB/SusD domain protein  29.41 
 
 		 507 aa  113  8.000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.540028  normal  0.274912 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5114  RagB/SusD domain protein  30.1 
 
 		 480 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.114098 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4950  RagB/SusD domain-containing protein  29.68 
 
 		 532 aa  112  1.0000000000000001e-23  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  unclonable  0.000000000321491  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0963  RagB/SusD domain protein  28.03 
 
 		 514 aa  112  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.000181436  hitchhiker  0.00536177 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2855  RagB/SusD domain protein  25.81 
 
 		 479 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.142091 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0755  RagB/SusD domain protein  28.54 
 
 		 494 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.906028  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4268  RagB/SusD domain protein  29.04 
 
 		 503 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.246385  normal  0.146292 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4455  RagB/SusD domain protein  29.5 
 
 		 506 aa  110  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.00000000000846539  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2081  RagB/SusD domain protein  29.17 
 
 		 500 aa  109  1e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1282  RagB/SusD domain protein  28.21 
 
 		 613 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1499  RagB/SusD domain protein  25 
 
 		 519 aa  108  2e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0954424 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5395  RagB/SusD domain protein  27.39 
 
 		 506 aa  107  3e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0481462  normal  0.244827 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2522  RagB/SusD domain protein  26.42 
 
 		 522 aa  108  3e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1658  RagB/SusD domain protein  27.06 
 
 		 464 aa  107  4e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.175275  normal  0.106302 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3634  RagB/SusD domain protein  29.26 
 
 		 508 aa  107  6e-22  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.623243  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2846  RagB/SusD domain protein  25.75 
 
 		 487 aa  106  7e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00000771194  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4848  RagB/SusD domain protein  26.6 
 
 		 523 aa  106  1e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.101496  hitchhiker  0.00561902 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2115  RagB/SusD domain protein  26.74 
 
 		 508 aa  106  1e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.103234  normal  0.67321 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0781  RagB/SusD domain-containing protein  27.42 
 
 		 531 aa  104  3e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3195  RagB/SusD domain protein  30.58 
 
 		 472 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.803045  normal  0.231772 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2601  RagB/SusD domain protein  31.27 
 
 		 618 aa  104  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.913559 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1743  RagB/SusD domain protein  24.74 
 
 		 466 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0457607  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0444  RagB/SusD domain protein  27.74 
 
 		 498 aa  104  4e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5331  RagB/SusD domain protein  28.89 
 
 		 541 aa  104  4e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0214505  normal  0.577233 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2021  RagB/SusD domain-containing protein  25.38 
 
 		 507 aa  103  5e-21  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.367368  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1801  RagB/SusD domain protein  28.9 
 
 		 484 aa  103  6e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.587569  hitchhiker  0.000152838 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6428  RagB/SusD domain protein  28.46 
 
 		 466 aa  103  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0713  RagB/SusD domain protein  28.86 
 
 		 491 aa  103  9e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.10796  normal  0.438194 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3372  RagB/SusD domain protein  24.19 
 
 		 549 aa  102  1e-20  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0135  RagB/SusD domain protein  26.26 
 
 		 493 aa  102  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0042  RagB/SusD domain protein  28.63 
 
 		 472 aa  101  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0869  RagB/SusD domain protein  26.63 
 
 		 503 aa  102  2e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0508495  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4818  RagB/SusD domain protein  27.95 
 
 		 486 aa  101  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0677815  unclonable  0.0000000000000348036 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>