More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_0948 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_0948  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 536 aa  1055    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1271  amine oxidase  35.39 
 
 		 530 aa  303  6.000000000000001e-81  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3492  FAD dependent oxidoreductase  39.37 
 
 		 536 aa  292  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1270  FAD dependent oxidoreductase  34.46 
 
 		 555 aa  291  2e-77  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6157  putative phytoene dehydrogenase family protein  35.28 
 
 		 533 aa  278  2e-73  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.375282  normal  0.113405 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2878  amine oxidase  34.59 
 
 		 527 aa  276  8e-73  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.700832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1673  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 537 aa  275  1.0000000000000001e-72  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  decreased coverage  0.0012513  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0308  FAD dependent oxidoreductase  33.9 
 
 		 547 aa  274  3e-72  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.733784  normal  0.0218745 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3934  FAD dependent oxidoreductase  35.07 
 
 		 549 aa  273  7e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.217875  normal  0.113832 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3288  FAD dependent oxidoreductase  34.03 
 
 		 537 aa  266  8.999999999999999e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3375  FAD dependent oxidoreductase  33.14 
 
 		 536 aa  259  7e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.0710471  hitchhiker  0.0059341 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1978  FAD dependent oxidoreductase  34.44 
 
 		 534 aa  258  1e-67  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.413393  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2744  FAD dependent oxidoreductase  34.16 
 
 		 535 aa  259  1e-67  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.294261  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4029  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 536 aa  258  2e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.150408  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2365  FAD dependent oxidoreductase  34.1 
 
 		 535 aa  257  4e-67  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0283536  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0635  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 516 aa  256  5e-67  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.470789 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0226  FAD dependent oxidoreductase  32.64 
 
 		 518 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3166  FAD dependent oxidoreductase  33.71 
 
 		 539 aa  254  2.0000000000000002e-66  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2014  FAD dependent oxidoreductase  34.33 
 
 		 552 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.166375  normal  0.451875 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3380  amine oxidase  37.89 
 
 		 532 aa  253  5.000000000000001e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3444  amine oxidase  37.71 
 
 		 532 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3302  FAD dependent oxidoreductase  37.34 
 
 		 532 aa  249  7e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0537  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 533 aa  248  3e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0939614  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3854  FAD dependent oxidoreductase  34.77 
 
 		 530 aa  247  4e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1486  FAD dependent oxidoreductase  35.32 
 
 		 554 aa  238  1e-61  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.975068 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3475  FAD dependent oxidoreductase  34.57 
 
 		 559 aa  237  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.621036  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2838  FAD dependent oxidoreductase  34.98 
 
 		 531 aa  232  1e-59  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.320797  normal  0.430895 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3530  oxidoreductase  34.52 
 
 		 531 aa  230  5e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3174  FAD dependent oxidoreductase  34.12 
 
 		 531 aa  227  3e-58  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.919135 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2541  putative phytoene dehydrogenase  33.2 
 
 		 530 aa  225  2e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.553028 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1736  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 556 aa  216  8e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.00685325  normal  0.215441 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0947  FAD dependent oxidoreductase  34.31 
 
 		 532 aa  211  2e-53  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.239668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2105  FAD dependent oxidoreductase  31.03 
 
 		 554 aa  209  1e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0006  amine oxidase  30.26 
 
 		 556 aa  206  9e-52  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3650  FAD dependent oxidoreductase  30.65 
 
 		 547 aa  197  3e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4024  FAD dependent oxidoreductase  29.5 
 
 		 547 aa  197  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.411315  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1581  FAD dependent oxidoreductase  30.81 
 
 		 565 aa  196  1e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.135472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1607  FAD dependent oxidoreductase  31.77 
 
 		 510 aa  195  2e-48  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0416  FAD dependent oxidoreductase  30.78 
 
 		 561 aa  187  5e-46  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.839972 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5057  FAD dependent oxidoreductase  28.68 
 
 		 564 aa  186  9e-46  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0735  FAD dependent oxidoreductase  28.44 
 
 		 563 aa  181  2e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1960  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 523 aa  175  9.999999999999999e-43  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2949  FAD dependent oxidoreductase  30.97 
 
 		 517 aa  173  5.999999999999999e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1278  FAD dependent oxidoreductase  32.03 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00650672 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2310  FAD dependent oxidoreductase  30.62 
 
 		 514 aa  171  4e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.6902  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7299  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 		 528 aa  169  1e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5076  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 520 aa  163  8.000000000000001e-39  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4888  FAD dependent oxidoreductase  29.83 
 
 		 520 aa  160  5e-38  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.162383 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1487  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase  28.02 
 
 		 510 aa  157  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000619668 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1677  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 		 519 aa  156  7e-37  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1331  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 531 aa  156  8e-37  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3290  amine oxidase  32.04 
 
 		 545 aa  154  5e-36  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4505  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.145075  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4592  FAD dependent oxidoreductase  29.46 
 
 		 520 aa  154  5e-36  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.353805  normal  0.593862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0988  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 528 aa  152  2e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0648  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 531 aa  150  5e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0637  putative dehydrogenase  29.11 
 
 		 548 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0715988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1505  FAD dependent oxidoreductase  32.08 
 
 		 527 aa  149  1.0000000000000001e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00846828  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1963  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 531 aa  142  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1878  FAD dependent oxidoreductase  30.11 
 
 		 523 aa  139  1e-31  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.215591  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0381  amine oxidase  29.12 
 
 		 510 aa  139  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3431  amine oxidase  29.28 
 
 		 529 aa  137  4e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.478071  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20120  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  31.64 
 
 		 545 aa  136  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.191581  hitchhiker  0.00297894 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3030  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.788741  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0342  FAD dependent oxidoreductase  30.46 
 
 		 531 aa  131  3e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2146  FAD dependent oxidoreductase  28.97 
 
 		 505 aa  129  9.000000000000001e-29  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.220753  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1300  FAD dependent oxidoreductase  32.62 
 
 		 524 aa  127  5e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.211196  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1935  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 521 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.790128  normal  0.638974 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04210  phytoene dehydrogenase-like oxidoreductase  25.73 
 
 		 527 aa  125  2e-27  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.507647  normal  0.876413 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3691  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 		 526 aa  124  3e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00372447  normal  0.0717969 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1696  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 524 aa  124  5e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.209349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1744  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 534 aa  124  6e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0167987 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1024  phytoene dehydrogenase-related protein  26.9 
 
 		 518 aa  124  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2815  FAD dependent oxidoreductase  27.14 
 
 		 522 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000107827  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3467  FAD dependent oxidoreductase  26 
 
 		 533 aa  121  3e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1758  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 534 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.396799 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2659  beta-carotene ketolase  28.68 
 
 		 526 aa  119  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4444  FAD dependent oxidoreductase  26.13 
 
 		 523 aa  119  1.9999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1160  FAD dependent oxidoreductase  31.4 
 
 		 516 aa  117  5e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13863  dehydrogenase  27.53 
 
 		 536 aa  117  6e-25  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2257  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.76 
 
 		 520 aa  115  1.0000000000000001e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3200  phytoene desaturase  27.87 
 
 		 508 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.177165  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3042  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 530 aa  114  6e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.261396  normal  0.193129 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3026  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 530 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3085  FAD dependent oxidoreductase  29.37 
 
 		 530 aa  113  7.000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.214734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2843  phytoene desaturase  27.26 
 
 		 507 aa  113  9e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.105114  normal  0.912757 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1063  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 545 aa  111  4.0000000000000004e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.164132  normal  0.870572 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3766  amine oxidase  25.28 
 
 		 511 aa  110  7.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.918224  hitchhiker  0.0064797 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1954  FAD dependent oxidoreductase  28.3 
 
 		 560 aa  110  9.000000000000001e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2157  FAD dependent oxidoreductase  23.95 
 
 		 430 aa  108  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0263  FAD dependent oxidoreductase  27.87 
 
 		 513 aa  107  4e-22  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4011  amine oxidase  25.23 
 
 		 511 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.984835  normal  0.0140967 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0789  phytoene dehydrogenase and related protein-like protein  29.56 
 
 		 470 aa  105  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.308572 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5019  hypothetical protein  28.47 
 
 		 516 aa  105  2e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.579081 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1699  phytoene desaturase  24.53 
 
 		 511 aa  104  4e-21  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.258971  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6398  amine oxidase  27.8 
 
 		 504 aa  104  5e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0647051 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1339  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  29.62 
 
 		 523 aa  103  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.575389  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1834  putative transmembrane protein  27.93 
 
 		 535 aa  101  3e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.47508  normal  0.564682 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0271  phytoene dehydrogenase  26 
 
 		 518 aa  101  3e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3278  FAD dependent oxidoreductase  26.39 
 
 		 502 aa  101  3e-20  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.312837 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>