85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3977 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3977  glycoside hydrolase family 28  100 
 
 		 543 aa  1112    Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.722531  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3113  glycoside hydrolase family 28  36.02 
 
 		 524 aa  274  2.0000000000000002e-72  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  unclonable  0.00001805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3115  glycoside hydrolase family protein  33.27 
 
 		 509 aa  253  8.000000000000001e-66  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1710  glycoside hydrolase family 28  31.21 
 
 		 518 aa  248  2e-64  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.190203  hitchhiker  0.00186796 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2888  glycoside hydrolase family 28  29.73 
 
 		 530 aa  236  6e-61  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.022046  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1579  glycoside hydrolase family 28  33.08 
 
 		 492 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0814382 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1581  glycoside hydrolase family 28  29.79 
 
 		 489 aa  200  6e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0871574 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3719  exo-poly-alpha-D-galacturonosidase precursor  29.05 
 
 		 537 aa  194  3e-48  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3217  glycoside hydrolase family protein  31.58 
 
 		 491 aa  187  5e-46  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0717  glycoside hydrolase family 28  28.96 
 
 		 559 aa  169  8e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3114  glycoside hydrolase family protein  28.72 
 
 		 479 aa  162  1e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4790  glycoside hydrolase family 28  23.26 
 
 		 541 aa  151  3e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.0680897  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4256  glycoside hydrolase family protein  26.57 
 
 		 475 aa  148  2.0000000000000003e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1170  glycoside hydrolase family protein  24.82 
 
 		 548 aa  143  7e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.591559 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4247  glycoside hydrolase family protein  29.13 
 
 		 448 aa  140  3.9999999999999997e-32  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.783037  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29200  endopolygalacturonase  26.18 
 
 		 431 aa  140  4.999999999999999e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2380  Galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  26.85 
 
 		 447 aa  139  8.999999999999999e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5759  polygalacturonase  29.39 
 
 		 416 aa  134  3e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4228  glycoside hydrolase family protein  32.18 
 
 		 442 aa  134  6e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0824  glycoside hydrolase family 28  25.11 
 
 		 444 aa  133  9e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1253  glycoside hydrolase family 28  31.17 
 
 		 544 aa  132  1.0000000000000001e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.80507  normal  0.501453 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4115  glycoside hydrolase family protein  27.86 
 
 		 560 aa  132  2.0000000000000002e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4270  glycosy hydrolase family protein  26.35 
 
 		 865 aa  131  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0354367  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3371  glycoside hydrolase family 28  25.11 
 
 		 444 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0972  glycoside hydrolase family 28  32.44 
 
 		 448 aa  130  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.367864  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2532  glycoside hydrolase family 28  26.3 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1158  glycoside hydrolase family 28  29.38 
 
 		 554 aa  128  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2818  glycoside hydrolase family 28  26.92 
 
 		 542 aa  125  3e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5374  glycoside hydrolase family 28  29.17 
 
 		 442 aa  123  8e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.558216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0953  glycoside hydrolase family protein  26.65 
 
 		 463 aa  123  9.999999999999999e-27  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.161663  hitchhiker  0.000000205432 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2736  glycoside hydrolase family protein  26.93 
 
 		 518 aa  121  3e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.835022  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0610  glycoside hydrolase family 28  32.04 
 
 		 528 aa  119  9.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.826253  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2391  glycoside hydrolase family 28  22.84 
 
 		 470 aa  116  8.999999999999998e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.880928  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4088  glycoside hydrolase family protein  26.23 
 
 		 522 aa  116  1.0000000000000001e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.59776  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2300  glycoside hydrolase family 28  27.74 
 
 		 455 aa  116  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1529  glycoside hydrolase family 28  30.03 
 
 		 442 aa  115  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.604094  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0700  glycoside hydrolase family 28  28.12 
 
 		 509 aa  113  7.000000000000001e-24  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3464  Carbohydrate binding family 6  25.74 
 
 		 649 aa  109  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.235288  hitchhiker  0.0024319 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0498  glycoside hydrolase family protein  26.45 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.446578  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0483  glycoside hydrolase family protein  26.54 
 
 		 446 aa  109  1e-22  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3334  galacturan 1,4-alpha-galacturonidase  24.77 
 
 		 478 aa  108  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.473143  normal  0.755781 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2125  glycoside hydrolase family 28  27.55 
 
 		 437 aa  107  4e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_16052  predicted protein  28.04 
 
 		 271 aa  107  7e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.032394  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5079  Parallel beta-helix repeat protein  23.91 
 
 		 454 aa  107  7e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.416725  normal  0.142328 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5359  putative polygalacturonase protein  27.24 
 
 		 454 aa  105  2e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071082  normal  0.281824 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1569  glycoside hydrolase family 28  29.67 
 
 		 443 aa  105  3e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4285  glycoside hydrolase family protein  24.04 
 
 		 543 aa  104  4e-21  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1092  glycoside hydrolase family 28  26.08 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3223  glycoside hydrolase family 28  25.52 
 
 		 460 aa  103  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.362624  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2567  glycoside hydrolase family protein  26.46 
 
 		 474 aa  103  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5903  glycoside hydrolase family 28  29.78 
 
 		 521 aa  101  4e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.672596 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2115  glycoside hydrolase family protein  27.03 
 
 		 460 aa  101  4e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.698414 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3030  glycoside hydrolase family 28  30.28 
 
 		 467 aa  99.8  1e-19  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6953  glycoside hydrolase family 28  25.92 
 
 		 390 aa  92  3e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1884  glycoside hydrolase family protein  44 
 
 		 606 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.185674  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0153  glycoside hydrolase family 28  28.15 
 
 		 604 aa  87  8e-16  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.90665  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0200  glycoside hydrolase family 28  26.76 
 
 		 605 aa  86.3  0.000000000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4784  glycoside hydrolase family 28  38.98 
 
 		 551 aa  83.2  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.821545  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0230  glycoside hydrolase family protein  22.05 
 
 		 462 aa  83.2  0.00000000000001  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1580  Endopygalactorunase  29.28 
 
 		 246 aa  82.4  0.00000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0687608 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5506  lipolytic protein G-D-S-L family  31.72 
 
 		 727 aa  81.6  0.00000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00398864  hitchhiker  0.00322716 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1756  exo-poly-galacturonase signal peptide protein  35.53 
 
 		 702 aa  81.6  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0518728  normal  0.59815 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6877  hypothetical protein  26.32 
 
 		 543 aa  82  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0249011  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0152  glycoside hydrolase family 28  41.67 
 
 		 602 aa  78.6  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.533709  n/a   
 
 
-
 
NC_011679  PHATR_46668  predicted protein  23.13 
 
 		 451 aa  75.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.000812304  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2457  glycoside hydrolase family 28  22.45 
 
 		 508 aa  73.9  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140372  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0124  Endopygalactorunase-like protein  25.52 
 
 		 641 aa  71.2  0.00000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778802  normal  0.020189 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2862  Fibronectin type III domain protein  33.58 
 
 		 659 aa  67.4  0.0000000006  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.331707  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00376  polygalacturonase  23.08 
 
 		 602 aa  67.4  0.0000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1410  Fibronectin type III domain protein  24.82 
 
 		 659 aa  66.6  0.000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0125  Endopygalactorunase-like protein  26.03 
 
 		 633 aa  66.6  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300956  normal  0.0208856 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1396  Endopygalactorunase-like protein  26.54 
 
 		 642 aa  64.7  0.000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.230855  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3221  glycoside hydrolase family protein  27.14 
 
 		 665 aa  62.4  0.00000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.301284  normal  0.0580699 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5453  glycoside hydrolase family protein  25.71 
 
 		 664 aa  58.9  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.34591 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4603  glycoside hydrolase family protein  22.47 
 
 		 665 aa  57.8  0.0000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.039982  hitchhiker  0.000685896 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4858  glycoside hydrolase family 28  27.34 
 
 		 671 aa  57  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0653045  normal  0.492882 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3960  polygalacturonase  22.35 
 
 		 532 aa  55.5  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0761528  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4904  glycoside hydrolase family protein  21.91 
 
 		 665 aa  55.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.399094 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0989  glycoside hydrolase family 28  22.61 
 
 		 402 aa  55.1  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RSp0833  polygalacturonase transmembrane protein  26.24 
 
 		 680 aa  53.5  0.000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00798361 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3321  glycoside hydrolase family 28  23.42 
 
 		 402 aa  52  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3754  Endopygalactorunase  29.57 
 
 		 983 aa  48.9  0.0002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1922  Endopygalactorunase-like protein  30.7 
 
 		 669 aa  47.8  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.449199  normal  1 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6920  glycoside hydrolase family protein  22.99 
 
 		 458 aa  43.5  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0127  PKD domain containing protein  28.57 
 
 		 931 aa  43.5  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00188311 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>